两种计数法预测叔侄关系的对比研究

目的对比等位基因全不同基因座及共有等位基因计数法预测叔侄关系的差异性、相似性及其效能,为侦破案件提供参考。方法以已知叔侄关系的204对作为实验组,无关个体的204对作为对照组,采用PowerPlex 21系统检测20个常染色体STR基因座,然后进行统计分析。结果设定等位基因全不同基因座数预测界值≤6个,发现叔侄关系的灵敏度为83.82%,特异性为74.02%,漏判率为8.82%,误判率为11.76%,系统效能为78.92%。共有等位基因数预测界值≥17个,发现叔侄关系的灵敏度为75.98%,特异性为77.45%,漏判率与误判率均为7.84%,系统效能为76.72%。结论等位基因全不同基因座计数法与共有等位基因数计数法有互补优势,联合应用能提高预测叔侄血亲关系的能力,对侦查具有良好的指导意义。     

同胞鉴定中风险与对策的思考

目的 考察同胞认亲案件鉴定中的风险.方法 在一例同胞关系鉴定中,采用常染色体STR检测系统及X染色体STR检测系统进行基因型分型,并用ITO法计算全同胞指数及统计共有等住基因数和全相同基因座数进行判定.结果 在该案例中,常染色体STR分型结果与X染色体STR分型结果均提示被检验同胞之间并非其声称的全同胞关系,在排除其中非全同胞个体后,对剩余全同胞进行基因型分析从而反推出其生父母基因型,并与被认个体进行基因型比对后得出排除结论,即被认个体与被检验同胞之间不存在生物学全同胞关系.结论 对于同胞认亲的案件,若无父亲和(或)母亲参与,鉴定人应尽可能地通过多种检测系统(常染色体STR、X-STR、Y-STR、mtDNA等)综合分析,从而对被检验同胞所声称的“全同胞”关系进行验证;也可用ITO法计算全同胞指数及统计共有等位基因数和全相同基因座数进行判定,这样可以互相印证鉴定结果,降低误判风险.     

应用常染色体STR基因座共有等位基因数判别全同胞关系

目的建立基于常染色体STR基因座共有等位基因数的全同胞关系判别标准。方法根据280对全同胞及2003对无关个体Identifiler系统15个STR基因座的分型结果,对15个STR基因座的共有等位基因数（S15）和全同胞指数（FSI）进行统计,应用SAS8.2软件包得出Fisher判别函数并与ITO法结果进行比较。结果全同胞对及无关个体对中共有等位基因数目均符合正态分布。采用Identifiler系统15个STR基因座共有等位基因数进行全同胞关系判别时,判别函数分别为：ZFS=3.26970S15-31.51174和ZUI=1.70058S15-8.52411。用上述判别函数进行全同胞/无关个体关系判别时的平均错判率为0.0298。15个STR基因座共有等位基因数法、CODIS13个STR基因座共有等位基因数法与ITO法判别结果差异无统计学意义。结论应用常染色体STR基因座的共有等位基因数判别全同胞关系简便、可信,易于掌握且不受STR基因座等位基因频率的影响。     

多系统联合分析应用于复杂亲缘关系鉴定

目的探讨多种检测系统用于祖孙、同胞等复杂亲缘关系鉴定的效能。方法采用常染色体、性染色体STR检测系统以及常染色体STR基因座累计状态一致性评分方法筛选符合要求的参照样本,分析复杂亲缘关系鉴定中缺失被鉴定人的等位基因,对无法重建的＂空白＂等位基因,以最不利于＂认定亲缘关系＂的假设取概率值计算似然率。结果在一复杂亲缘关系鉴定案例中,从8个声称的全同胞中筛选出5个符合同父同母遗传条件的全同胞作为参照样本用于重建缺失被鉴定人等位基因,重建的父母相关基因型符合作为被检女孩亲生祖父母的遗传基因条件,祖孙亲缘关系似然率为1483659.96。结论在复杂亲缘关系鉴定中联合协同应用常染色体STR基因分型、性染色体STR基因分型、生物学全同胞关系累计状态一致性评分标准等多种分析系统有利于获得更接近真实的案件结论。     

采用STR和SNP遗传标记鉴定全同胞姐妹关系

目的 通过对常染色体和X染色体遗传标记的检测,探讨全同胞姐妹关系的鉴定策略.方法 提取姐妹个体的DNA,采用SinofileTM试剂盒检验常染色体上的15个STR基因座、采用Mentype(R) Argus X-8试剂盒和多重X染色体STR检测试剂盒检验X染色体上的17个STR基因座,同时采用TaqMan技术对11个X-SNP位点进行分型检测.结果 依据常染色体STR基因座的检测结果计算全同胞指数,不排除被检个体的同胞姐妹关系:X染色体上各个STR基因座和SNP位点均检见1～2个相同的等位基因,进一步支持被检个体的同胞姐妹关系.结论 对于全同胞姐妹关系的鉴定案例,除了检测常染色体STR基因座外,还可以从X染色体上选择多态性遗传标记进行检测,获得更多的遗传信息.     

Y—STR系统挽救了一家亲情

今年6月,司法部司鉴所接受一例亲子鉴定,运用Y-ST系统,拨开重重疑云,挽救了一个和睦家庭的亲情。司法部司鉴所物证学实验室近年来对Y-STR系统用于亲缘鉴定进行了实验探索,他们认为,Y-STR呈父系遗传特征,孩子与生父具有相同的Y-STR单倍型。在法医物证学上,Y-STR应用价值比较大,可在父-子血缘关系、兄弟同胞关系、叔侄关系和祖孙关系鉴定中发挥重要作用。在亲子鉴定和个体识别案件鉴定中,目前国内外一般依据常染色体STR的检测结果作出鉴定结论。但是,由于STR突变率较高,检验中若只发现1-2个基因座不符合遗传规律,有时很难作出正确的…     

多种遗传标记在同母异父半同胞关系鉴定中的综合应用

目的通过对常染色体和X染色体STR基因座以及线粒体DNA高变区多态性的检验,探讨同母异父半同胞关系鉴定策略。方法提取3名全同胞及其1名疑似同母异父半同胞个体的DNA,采用SinofilerTM试剂盒检测常染色体上的15个STR基因座、采用Mentype Argus X-8试剂盒和自主研制的16重X染色体STR扩增体系,共检验X染色体上的19个STR基因座,同时采用基因测序技术分析线粒体DNA高变区Ⅰ和高变区Ⅱ的多态性。结果依据常染色体STR基因型结果及全同胞指数和半同胞指数计算结果排除可疑个体与已知3名全同胞间存在全同胞关系,线粒体DNA高变区多态性检测结果提示4名被鉴定人为同一母系,X染色体STR分型结果支持被鉴定个体间为半同胞关系。结论对于同母异父半同胞鉴定案例,综合运用常染色体STR、X染色体STR及线粒体DNA高变区测序等多种遗传分析手段,可获得可靠的鉴定结论。     

利用Identifiler分型系统推断同胞关系

目的探讨自主开发的同胞关系鉴定自动分析软件（ASI）对Identifiler分型系统进行同胞关系鉴定的可行性。方法应用本课题组所开发的软件ASI,对151对同胞及31 224对人工模拟无关个体进行Identifiler系统的15个常染色体STR基因座分型进行分析,计算亲权指数（PI）、同胞关系概率（WFS）和等位基因匹配情况,所获数据进行统计分析,自动计算排序。结果当WFS大于99.999%时,同胞个体占39.07%,无关个体占0%,两组具有显著差异,可以推断两个体同胞关系。当WFS介于1%~99.999%范围内,同胞个体和无关个体有部分重叠,同胞个体占60.93%,无关个体占21.3%,两者具有一定差异,可以通过增加检测STR基因座,再结合案情加作Y-STR、m tDNA检测,以推断两个体是否具有同胞关系。当WFS小于1%时,同胞个体占0%,无关个体占78.7%,可以推断两个体不具有同胞关系。个体间等位基因匹配结果表明：在检测Identifiler体系15个STR基因座时,当两个体常染色体STR基因座的全相同数目≥5时,或全不同数目≤1时,提示为同胞关系;当两个体全不同数目≥6时,或全相同数目≤1时,提示为无关个体,以此作为预测有无同胞关系的界值。结论Identifiler系统及同胞关系鉴定自动分析软件ASI可用于推断同胞关系。     

IBS评分法鉴定全同胞关系及其临界值查询表的构建CSCD

目的建立包含不同个数STR基因座检测体系在不同错判标准下的IBS临界值和检测效能查询表。方法收集267对全同胞和360对无关个体血样,采用Goldeneye^(TM) 20A体系进行19个常染色体STR基因座的分型,按照《生物学全同胞关系鉴定实施规范》采用IBS评分法判定全同胞关系。通过理论推算,计算包含不同个数STR基因座检测体系在不同错判标准下的IBS临界值和检测效能。结果按照规范的IBS评分标准对全同胞和无关个体的鉴别效能为0.764 0,错判率为0,理论推算和样本观察值相符。包含不同个数STR基因座检测体系的全同胞鉴定IBS评分临界值查询表构建成功。结论该规范的IBS评分法检测效力较高,错判率极低,判定结果相对保守。包含不同个数STR基因座检测体系的全同胞鉴定IBS评分临界值查询表为全同胞鉴定的结果评判提供了重要的参考数据,具有很好的应用价值。     

常染色体STR和X染色体STR联合应用于姑侄和叔侄关系鉴定

目的通过对常染色体STR和X染色体STR基因座进行分型检验,探讨姑侄、叔侄关系的鉴定策略。方法提取案例中被检女孩和另外3名个体（女性2名,疑为被检女孩的姑姑;男性1名,疑为被检女孩的叔父）的血样DNA,采用Goldeneye 20A系统和AGCU 21＋1系统分别进行常染色体STR基因座的复合PCR扩增,用Mentype○RArgus X-12试剂盒和本室自主研制的16重X染色体STR扩增体系分别进行X染色体STR基因座的复合PCR扩增,用3130 XL遗传分析仪进行毛细管电泳和基因型分析。结果依据常染色体STR基因型结果及姑侄、叔侄关系指数计算结果,不排除2名被检姑姑和与被检女性存在姑侄关系;不排除被检叔叔和与被检女性存在叔侄关系,X染色体STR分型结果支持此鉴定意见。结论对于姑侄、叔侄关系鉴定案例,X染色体STR基因座是常染色体STR基因座的良好补充,两者联合运用可获得可靠的鉴定意见。     

Y-haplotype screening of local patrilineages followed by autosomal STR typing can detect likely perpetrators in some populations

The male-specific, human Y-chromosomal short tandem repeats (Y-STRs) are very useful in forensic analysis and human evolution studies. The authors report two sexual crime cases in which the perpetrators were successfully traced using Y-haplotype screening of local patrilineages followed by autosomal STR typing. First, several main local patrilineages from local cases were investigated using Y-STR haplotyping, aimed to find the pedigrees whose haplotypes were identical or similar to those of the crime scene samples. Then, several key suspects were defined from the screened pedigrees, and autosomal STR typing was performed to identify the perpetrator of the crime. The application of Y-haplotype screening of local patrilineages followed by autosomal STR typing in these two cases demonstrates its usefulness for solving sexually related crimes in certain populations.     

Evaluation of usefulness of further Y-STR analysis in sexual assault cases on PSA positive samples resulting in female autosomal STR profiling

Samples from male to female sexual assault cases that are positive for the presumptive prostate specific antigen (PSA) test often do not result in a male autosomal STR profile. Due to highly unequal proportions of female and male DNA in typical sexual assault samples, routine autosomal STR analysis often fails to detect the DNA of the assailant, even after differential extraction of the samples. Previous studies have already shown the value of Y-STR analysis in such cases [1]. In Belgium, forensic DNA laboratories are only allowed to perform Y-STR profiling on sexual assault samples by a specific requisition, after routine autosomal STR analysis has been performed. However, a request for additional Y-STR analysis is rather exceptional.In this study, we evaluated the usefulness of further Y-STR analysis. For 100 PSA positive rinses and swabs from male to female sexual assault cases resulting in female autosomal STR profiling, 7% resulted in a full or partial Y-STR profile useful for comparison, using the 23-loci Y-STR PowerPlex Y23 System (Promega). The success rate raised to 12.5% with a higher DNA input in the PCR mix. In conclusion, these results support the usefulness of performing Y-STRs analysis on the sperm DNA extracts to identify the alleged assailant in sexual assault cases.     

Evaluation of population variation at 17 autosomal STR and 16 Y-STR haplotype loci in Croatians

Seventeen autosomal STR loci (D8S1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D3S1358, TH01, D13S317, D16S539, D2S1338, D19S433, VWA, TPOX, D18S51, D5S818, FGA, Penta E and Penta D) and 16 Y-STR haplotype loci (DYS19, DYS385, DYS389I, DYS398II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS437, DYS438, DYS439, DYS448, DYS456, DYS458, DYS635 and GATA H4.1) were analyzed in the sample of 200 unrelated Croatians. The agreement with HWE was confirmed for all autosomal STR loci. The combined power of discrimination (PD) and the combined power of exclusion (PE) for the 17 autosomal STR loci were 0.999999999999999999682299331476 and 0.99999995, respectively. Penta E proved to be the most informative autosomal STR locus. Among 200 Croatian males, 197 Y-STR haplotypes were identified and haplotype diversity was estimated at 0.9998 ± 0.0005.     

MiniFiler及Yfiler试剂盒无创产前亲子鉴定的可能性探究

目的采用Mini Filer~(TM)及YFiler~(TM)试剂盒对孕妇血浆进行STR分型,评估上述试剂盒进行无创产前亲子鉴定的可行性。方法采用Mini Filer~(TM)及YFiler~(TM)试剂盒,对2例成人男性的全血及血浆进行STR分型,评估血浆检材的分型准确率及适用性;对8组已知亲子关系的孕妇家系(4组非父,4组亲父,均为男胎样本)采用Mini Filer~(TM)及YFiler~(TM)试剂盒进行STR分型,对STR分型图谱直接观察,总结归纳孕妇血浆STR图谱的特征,探讨进行无创产前亲子鉴定的可行性。结果血浆检材的STR分型结果与全血STR分型结果 100%一致,且等位基因峰高接近,表明血浆是一类可以进行STR分型的检材;观察8组孕妇血浆检材的STR分型图谱,可获得2~5个可用(含胎儿STR信息)Mini-STR位点,1~8个可用Y-STR位点,且在位点充足的情况下(6个),肯定父权家系可计算累计父权指数达192 653,否定父权家系中有3~7个位点支持否定父权。结论采用Mini Filer~(TM)及Yfiler~(TM)试剂盒对孕妇血浆进行STR分型,存在进行无创产前亲子鉴定的可能性。     

2例亲权鉴定案中的嵌合体STR谱分析

先天性基因嵌合体由遗传获得，是胚胎早期两个不同受精卵相互混合或血管交叉吻合继而发育成的一个包含两套（种）不同细胞系的个体。分为血型嵌合体（twin chimeras）和全身器官组织嵌合体（whole body chimerasl两种。本文通过两例亲权鉴定中发现的男性先天性嵌合体及其家族成员常染色体、性染色体的STR谱遗传分析，探讨先天性基因嵌合体的类型、发生、基因嵌合现象在不同组织中的表现及其作为证据可能在法庭科学调查中存在的风险。分析结果表明，两例男性Y—STR单倍型显示正常，分别与其男性家族成员Y—STR单倍型一致。但其在常染色体和X染色体上的STR基因表现嵌合现象，分别是在胚胎发育早期由男性-女性、男性-男性的异卵双生子发生融合并发育而成的的全身器官组织嵌合体。嵌合体上不同来源组织的STR等位基因强度显示不均衡状态。     

荧光复合扩增4个Y染色体STR的单倍型及其法医学应用

目的建立一套Y染色体STR的双色荧光复合扩增系统,调查4个Y-STR基因座单倍型分布情况及其在混合斑物证检验中的法医学应用前景。方法荧光标记引物复合扩增Y-GATA-A10、DYS531、DYS557和DYS448四个Y染色体特异性STR基因座,并用ABⅠ310遗传分析仪对扩增产物进行检测、分型。结果在成都汉族120名无关男性个体中,四个基因座分别检出5、5、8、7个等位基因,共检出78种单倍型,单倍型基因多样性为0.9881。对3例本教研室不能用常规常染色体STR对男性成份作出同一认定的混合斑检材,该系统成功的作出了与嫌疑人血液Y-STR基因型一致的鉴定结论。结论建立的Y-STR荧光标记复合扩增系统具有很高的识别能力,对建立Y染色体STR数据库,研究群体遗传学和进行法医学混合斑物证鉴定有重要意义。     

Analysis of non-suspect samples lacking visually identifiable sperm using a Y-STR 10-plex

Y-STRs are valuable in the investigation of sexual assaults in which autosomal STR genotype interpretation is challenging. To detect male DNA from compromised sexual assault evidence, 45 non-suspect samples were differentially extracted and analyzed with 10 Y-STRs. These samples were positive for the presence of human seminal fluid, but were negative for spermatozoa by microscopic examination. Y-STR data were obtained in approximately 86.2% of the epithelial or sperm fractions. On samples yielding incomplete profiles, results were obtained on an average of 5 loci per sample. The inability to obtain results may be due to insufficient amplifiable male DNA, PCR inhibition, or unfounded accusations of sexual assault. This study indicates that it is possible to obtain a male STR profile even in the absence of visually identifiable spermatozoa. Furthermore, Y-STR loci should become components of CODIS if they are to be used in solving non-suspect sexual assaults.     

Y染色体STR的银染复合扩增

目的建立一套Y染色体STR的复合扩增体系,检测中国藏族人群的单倍型分布。方法利用复合扩增的方法扩增DYS434、DYS443和DYS456三个基因座,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳银染进行分型,检测西藏藏族101名无关男性个体单倍型分布。结果三个基因座在藏族样本中分别检测出4、4、6个等位基因,共检测出31种单倍型,其单倍型的变异度是0.9481,标准误为0.0049。结论Y-STR的复合扩增在法医学的亲权鉴定和个人识别中有重要的作用。     

利用Y-STR单倍型推断嫌疑人家族来源的研究

目的调查山东寿光地区汉族男性家族起源及研究17个Y-STR基因座单倍型在家族中的遗传稳定性。方法对寿光地区624个无关男性家族群体进行抽样,应用Y-filer荧光标记复合扩增系统,对17个Y-STR基因座复合扩增,用ABI3130XL型基因分析仪对扩增产物进行检测,并统计其群体遗传学参数。结果未发现家族性偶合。结论寿光地区624个汉族无关男性家族在经过了约七百年的遗传和突变累积后,其Y-STR单倍型仍具有较强的家族识别能力,可以很好地用于推断嫌疑人的家族来源。