AMELY无效扩增个体Yp11.2区域STS位点检测

目的通过Y-STR复合扩增技术检测AMELY缺失的男性个体Y染色体的完整性,并对数据库中的STS位点进行筛选并设计引物,检测Y染色体AMEL区域的STS位点缺失情况,为进一步研究中国人口中AMELY的缺失提供数据和理论依据。方法应用Goldeneye 20A PCR扩增试剂盒、华夏TM白金PCR扩增试剂、Y filer plus试剂盒和Goldeneye 27YB试剂盒进行PCR扩增、通过ABI 3500遗传分析仪进行毛细管电泳以及STR分型。通过UniSTS database和UCSC对Y染色体p11.2区域的多个STS位点进行筛选,部分STS位点自行设计引物,梯度PCR和常规PCR扩增结合琼脂糖凝胶电泳进行STS位点的分析。结果 Goldeneye 20A和华夏TM白金两种试剂盒分型结果均显示两父子AMELY等位基因无效扩增。Y filer plus和27YB试剂盒分型结果显示两父子均在DYS570和DYS576位点无效扩增。STS位点扩增显示两父子的Y染色体缺失的STS位点有BV703904、BV703923、SY2137、SY716、DYS256、DYS267、SY2232、SY2233、DYS261和DYS260。结论 AMELY无效扩增的父子Yp11.2缺失片段包含了BV703904-DYS260之间的区域,长度为2.63~2.74 Mb。     

山东济宁地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性

本文对中国济宁地区汉族598个健康无关个体进行15个STR基因座遗传多态性调查。采用Amp FISTR华夏试剂盒进行直接扩增及检测。结果在15个STR基因座共检出191个等位基因和687种基因型,其分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05)。所调查的汉族人群15个STR基因座具有较好识别能力。     

骨骼肌circRNA在死亡时间推断中的初步筛选及验证研究

目的通过构建骨骼肌中环状RNA(circular RNA,circRNA)表达谱,筛选出人体骨骼肌中与死亡时间具有时序性变化的circRNAs,并对筛选出的circRNAs进行验证,进而探讨其相对表达量与死亡时间的相关性。方法芯片实验选取2例外界温度、湿度相对一致,已知死亡时间在24 h内的个体,分别于尸检即刻(12 h以内)、3、5、7、10 d各取50 g组织进行总RNA提取,并进行逆转录、探针标记、基因芯片检测等实验,初步得到circRNA表达谱;对筛选出的circRNAs在后续收集的18例检材中进行验证,对所得数据进行统计分析。结果骨骼肌组织中共检测出13156个circRNAs,但在10 d内整体呈下降趋势的circRNAs只有hsa_circ_0001727、hsa_circ_0001136、hsa_circ_0001871、hsa_circ_0005251、hsa_circ_0000284、hsa_circ_0000520、hsa_circ_00019717个。对所筛选出的7个circRNAs在18例检材中进行验证,发现只有hsa_circ_0001727、hsa_circ_0001136、hsa_circ_0001871、hsa_circ_0005251、hsa_circ_00002845个circRNAs随着死亡时间增加,其相对表达量显著下降,具有统计学意义(P<0.05)。而hsa_circ_0000520、hsa_circ_00019712个circRNAs的表达为阴性。结论circRNA是一种较为稳定的生物标记物,部分可用于死亡时间推断的研究。