采用123D Catch建立中药材的3D模型

目的 基于真实照片建立中药材的3D模型。方法 利用123D Catch 3D合成软件,对三七 Panax notoginseng(Burkill) F. H. Chen ex C. H. Chow、竹黄Shiraia bambusicola Henn、杭白芷Angelica dahurica ‘Hangbaizhi’ Yuan et Shan、川木香Dolomiaea souliel (Franch.) C. Shih进行多视角拍摄和3D建模。结果 123D Catch可以快速地将多角度拍摄的二维药材照片转变为3D模型,4种中药材的3D模型可以清晰完整地展示其性状及鉴别特点。结论 3D建模技术可以完整地展示中药材的性状,在中药性状鉴定研究与教学研究方面具有良好的应用前景。     

基于网络药理学研究止嗽散治疗咳嗽变异性哮喘的分子机制

目的 通过整合药物代谢动力学数据进行多重药物靶点预测,探究止嗽散治疗咳嗽变异性哮喘(cough variant asthma,CVA)的作用机制.方法 先利用大规模数据挖掘、文献检索搜集止嗽散方中所有中药的化学成分,再利用药物代谢动力学数据筛选其活性成分并用Swiss Target Prediction、SysDT和TargetNet方法进行靶点预测,并借助GeneCards和OMIM数据库获得CVA的致病基因,并与药物靶点取交集以构建蛋白相互作用网络,对获得的核心靶点进行生物学功能富集分析,最后选取若干核心靶点及其关键的成分进行分子对接验证.结果 共筛出止嗽散治疗CVA的活性成分97个(包括白前苷元C、7,4'-二羟基黄酮、甘草酸、新对叶百部碱和β-谷甾醇)及靶点144个.通过分析蛋白相互作用网络得到MAPK3、TNF、CASP3、EGFR、PTGS2和MMP-9等10个核心靶点.KEGG富集分析得到30条与CVA相关的通路.分子对接验证核心靶点中EGFR、PTGS2和MMP-9与其关键化合物有较好结合力.结论 止嗽散治疗CVA涉及多条信号通路,其分子机制可能是通过止嗽散中主要活性成分对PI3K-Akt、NF-κB和HIF-1等通路的调控,最终达到治疗CVA的效果.     

基于网络药理学和分子对接技术探究小柴胡汤治疗三阴性乳腺癌的作用机制

目的 通过生物信息学分析和整合药物代谢动力学数据进行多重药物靶点预测，探究小柴胡汤治疗三阴性乳腺癌（triple negative breast cancer，TNBC）的作用机制。方法 基于药理学数据库获取小柴胡汤的活性成分与对应靶点；采用加权基因共表达网络分析方法识别乳腺癌高通量测序数据中肿瘤发生发展的关键基因；采用GO功能与KEGG通路富集分析进行生物功能与通路注释；通过Cytoscape软件进行核心基因鉴定；利用分子对接方法模拟关键生物标志物与小柴胡汤核心活性成分的对接模式。结果 在对小柴胡汤进行数据挖掘后获得242个有效成分和265个对应靶点，通过加权分析方法得到乳腺癌密切相关的563个疾病关键靶点，小柴胡汤与TNBC共有13个交集靶点。小柴胡汤成分靶点网络构建得到槲皮素、山柰酚、异鼠李亭素、木犀草素、豆甾醇、β-豆甾醇、牵牛花色素等主要成分。PPI网络构建后通过筛选得到3个核心靶点（CCNA2、CCNB1、CHEK1）与2个关键化学成分（槲皮素、山柰酚）。GO富集获得15个生物过程、45个细胞组分、16个分子功能，其中主要与细胞器裂变和细胞核分裂等细胞增殖过程，浓缩染色体和中心区核染色体，单链DNA结合ATP依赖活性等相关。KEGG通路富集得到了37条通路，主要富集在精氨酸等代谢通路上。分子对接模拟显示核心蛋白靶点与重要活性成分具有良好的结合活性。结论 小柴胡汤主要通过CCNA2、CCNB1、CHEK1等靶点，槲皮素、山柰酚等主要活性成分及细胞调亡、成纤维细胞形成和肿瘤细胞增殖及炎症进程达到干预TNBC的作用。