采用自主研发似然比率计算器进行ITO亲缘关系分析

目的探讨采用自主研发的似然比率计算器进行ITO法亲缘关系鉴定的可行性。方法针对GoldeneyeTMDNA ID System 20A系统的19个常染色体STR基因座分型数据,使用自主研发的似然比率计算器,人工模拟100 000对无关个体及100 000个家系的父子、同胞、半同胞、一、二代堂表兄弟,应用ITO法,自动分析计算亲权指数（PI）和亲缘关系概率（RCP）。结果父子和无关个体关系概率界值下无重叠,具有显著差异。同胞关系概率大于99.99%时,同胞占66.48%,无关个体占0%,具有显著差异;概率小于99.99%时,同胞个体和无关个体有部分重叠,具有一定差异。半同胞关系概率大于99.99%时,半同胞占1.52%,无关个体占0%,具有显著差异;概率小于99.99%时,两组有部分重叠,具有一定差异。一、二代堂表兄弟关系概率为10%～90%范围内时,无关个体分别占90%,99.98%,无法推断。结论本文方法可用于推断父子关系、同胞关系、半同胞关系。     

PowerPlex(R)16HS试剂盒在陈旧血样DNA检验中的应用

PowerPlex 16 HS系统是对16个STR基因座进行联合扩增试剂盒,对PCR抑制物的耐受性较强,适于直接扩增。本文作者在公安部的打拐专项行动中,采用该试剂盒,对保存近10年的300份陈旧血样进行DNA检验,取得了较好的效果。1材料与方法1.1主要仪器与试剂PowerPlex(16 HS试剂盒(Promega公司,美国),BSD 600半自动取样机(BSD公司,澳大利亚),9700扩增仪、3130XL遗传分析仪(ABI公司,美国)。     

PowerPlex16HS试剂盒在陈旧血样DNA检验中的应用

PowerPlex16HS系统是对16个STR基因座进行联合扩增试剂盒,对PCR抑制物的耐受性较强,适于直接扩增^[1-2]。本文作者在公安部的打拐专项行动中,采用该试剂盒,对保存近10年的300份陈旧血样进行DNA检验,取得了较好的效果。     

标准三联体非父排除率计算公式的推导和验证

目的对标准三联体亲子鉴定的非父排除率(PE)进行公式推导和实验验证。方法基于PE定义自行推导公式:PE=sum(P_i~2(1-P_i)~2)from i=1 to n+sum(P_iP_j(1-P_i)~3)from ij to n+sum(P_iP_j(1-P_j)~3)from ij to n+sum(P_iP_j(P_i+P_j)(1-P_i-P_j)~2)from ij to n。将该公式与前人报道的5个公式(1)~(5)进行对比,计算AGCU EX20系统19个常染色体STR基因座的PE值。根据1 000例单亲样本和1 000个无关个体样本设计真实实验,计算PE真实实验值。以随机模拟法产生1 000万对模拟亲母子和1 000万个随机个体,设计模拟实验计算PE模拟实验值。在19个基因座,统计各基因座的等位基因频率之和(S),将PE的公式值、真实实验值和模拟实验值进行对比。结果当S=1时,公式(1)、(2)、(5)、(6)计算结果完全一致,且符合真实和模拟双重实验验证。当S≠1时,公式(1)、(2)、(5)、(6)计算结果有较小误差。公式(3)、(4)的计算结果有较大误差。结论本研究推导的公式(6)与经典公式(1)、(2)、(5)均可用于标准三联体亲子鉴定。S值对PE公式计算有一定影响。