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TaqMan探针技术用于X-SNP位点的分型
引用本文:张素华,李莉,李成涛,赵书民.TaqMan探针技术用于X-SNP位点的分型[J].法医学杂志,2010,26(1):22-25.
作者姓名:张素华  李莉  李成涛  赵书民
作者单位:1. 苏州大学医学部法医学系,江苏,苏州,215123;司法部司法鉴定科学技术研究所,上海市法医学重点实验室,上海,200063
2. 司法部司法鉴定科学技术研究所,上海市法医学重点实验室,上海,200063
基金项目:上海市自然科学基金资助项目(08ZR1419800)
摘    要:目的建立一种基于TaqMan探针技术的快速、准确且经济的实时荧光PCR方法,用于检测X染色体上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)。方法选择X染色体上的13个SNP位点(X-SNP),针对每个位点分别设计1对PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增,对X-SNP位点进行分型。结果13个位点均符合Hardy-Weinberg平衡;多态信息含量分布为0.3497~0.3750,杂合度为0.4537~0.5021。建立的方法能够用于X-SNP位点的基因分型,检测结果与DNA测序结果完全一致。结论基于TaqMan探针技术的等位基因特异的实时荧光PCR方法灵敏、简单、快速,可实现对X-SNP位点的分型检测;所选择的13个X-SNP位点具有高信息量,在法医遗传学中具有潜在的应用价值。

关 键 词:法医遗传学  多态性  单核苷酸  X染色体  TaqMan探针

X-SNP Genotyping Using the TaqMan Probe Technology
ZHANG Su-hua,LI Li,LI Cheng-tao,ZHAO Shu-min.X-SNP Genotyping Using the TaqMan Probe Technology[J].Journal of Forensic Medicine,2010,26(1):22-25.
Authors:ZHANG Su-hua  LI Li  LI Cheng-tao  ZHAO Shu-min
Institution:1.Department of Forensic Medicine;Medical College of Soochow University;Suzhou 215123;China;2.Shang-hai Key Laboratory of Forensic Medicine;Institute of Forensic Science;Ministry of Justice;P.R.China;Shang-hai 200063;China
Abstract:Objective To develop a rapid,accurate and economical real time fluorescence PCR method with TaqMan probe technology to detect the X chromosome single nucleotide polymorphism(X-SNP).Methods Taq-Man probes and polymerase chain reaction primers were respectively designed according to the 13 X-SNP.Then,the X-SNP were genotyped after the amplification by real time fluorescence PCR.Results All the loci follow the Hardy-Weinberg equilibrium.The polymorphic information content for 13 distinct loci varied between 0....
Keywords:forensic genetics  polymorphism  single nucleotide  X chromosome  TaqMan probe  
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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