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甘肃犬瘟热病毒流行株N蛋白和H蛋白基因的序列分析
引用本文:王小辉,王旭荣,郭庆勇,李建喜,李世宏.甘肃犬瘟热病毒流行株N蛋白和H蛋白基因的序列分析[J].中国兽医科学,2011(3).
作者姓名:王小辉  王旭荣  郭庆勇  李建喜  李世宏
作者单位:中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所中国农业科学院临床兽医学研究中心;新疆农业大学动物医学学院;
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(BRF080302)
摘    要:采用RT-PCR方法扩增了3株犬瘟热病毒(CDV)分离株的N、H蛋白基因,将其克隆入pGEM-T Easy载体并进行序列分析。结果表明,获得的N蛋白基因序列与GenBank上登录的其他国家和地区的CDV分离株相应序列的同源性为92.5%~99.9%,获得的H蛋白基因与其他国家和地区的CDV分离株相应序列的同源性为81.7%~100%。由N蛋白基因和H蛋白基因推导的氨基酸序列构建的遗传进化树可知,这3株CDV流行株均处于野毒株的分支上,在N蛋白基因的遗传进化树上,CDV流行株呈现明显的地域性差异,而在H蛋白基因的遗传进化树上,不同国家和地区的CDV分离株之间虽有一定的地域联系,但与N蛋白基因相比,其地域性联系并不明显。说明这3株CDV流行株为野毒株,H蛋白基因的变异水平明显高于N蛋白基因,而N蛋白基因更能显示毒株与地域的关系。

关 键 词:犬瘟热病毒  N基因  H基因  序列分析  

Sequence analysis of nucleoprotein and hemagglutinin genes of wild type canine distemper virus isolated from dogs in Gansu Province
WANG Xiao-hui,WANG Xu-rong,GUO Qing-yong,LI Jian-xi,LI Shi-hong.Sequence analysis of nucleoprotein and hemagglutinin genes of wild type canine distemper virus isolated from dogs in Gansu Province[J].Veterinary Science in China,2011(3).
Authors:WANG Xiao-hui  WANG Xu-rong  GUO Qing-yong  LI Jian-xi  LI Shi-hong
Institution:WANG Xiao-hui1,WANG Xu-rong1,GUO Qing-yong2,LI Jian-xi1,LI Shi-hong1(1.Research Center of Clinical Veterinary Medicine of Chinese Academy of Agricultural Sciences/Lanzhou Institute of Animal Science and Veterinary Pharmaceutics,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730050,China,2.College of Veterinary Medicine,Xinjiang Agricultural University,Urumqi 830052,China)
Abstract:The nucleoprotein(N) gene and hemagglutinin(H) gene were amplified from 3 strains of canine distemper virus(CDV) isolated from dogs in Gansu Province by RT-PCR.Subsequently,the nucleotides of these two genes were sequenced and analyzed by Clustal V of DNAstar.The N gene shared from 92.5% to 99.9% homology with those of the CDV strains available in GenBank.The H gene shared from 81.7% to 100% homology with those of the CDV strains from other regions.The phylogenetic tree based on the amino acid sequences ded...
Keywords:canine distemper virus  nucleoprotein gene  hemagglutinin gene  sequence analysis  
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