| 鸡Toll样受体3基因全长的扩增及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 甘珊珊,何秀苗,韦平.鸡Toll样受体3基因全长的扩增及生物信息学分析[J].中国兽医科学,2011(6). |
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| 作者姓名： | 甘珊珊 何秀苗 韦平 |
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| 作者单位： | 广西民族大学化学与生物转化过程重点实验室;广西大学; |
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| 基金项目： | 广西青年科学基金项目(桂科青0991014); 广西民族大学2010年研究生教育创新计划项目(gxun-chx2010082); 国家自然科学基金项目(30860206) |
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| 摘 要： | 利用RT-PCR方法从广西三黄鸡外周血淋巴白细胞中扩增出鸡Toll样受体3基因(TLR3),进而对其进行序列分析和结构预测。结果显示,扩增出的TLR3基因全长为3 036bp,与GenBank中鸡TLR3序列同源性达96.5%～99.7%,突变主要集中在胞外区前173个氨基酸;与牛、鼠、绵羊、猪、马、家兔、黑猩猩、人、大猩猩的氨基酸同源性较低,为68.0%～74.8%;禽类TLR3与其他动物类及人类的TLR3分属于两大不同分支,处于不同进化位置;结构预测表明,GX-sh-chTLR3具有明显的跨膜蛋白结构,胞外区蛋白是由外侧多个α螺旋和内侧凹陷的多个β折叠构成螺线管状马鞍形结构,胞外区含有15个明显的富含亮氨酸的重复序列。结果表明,成功扩增出的鸡TLR3基因编码蛋白的空间结构特征明显,为进一步研究该基因的功能奠定了基础。
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| 关 键 词： | 鸡 TLR3 扩增 序列分析 结构预测 |
Amplification and bioinformatics analysis of the full-length chicken toll-like receptor 3 gene |
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| GAN Shan-shan,HE Xiu-miao,WEI Ping.Amplification and bioinformatics analysis of the full-length chicken toll-like receptor 3 gene[J].Veterinary Science in China,2011(6). |
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| Authors: | GAN Shan-shan HE Xiu-miao WEI Ping |
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| Institution: | GAN Shan-shan1,HE Xiu-miao1,WEI Ping2(1.Key Laboratory of Chemistry and Biotransformation/Guangxi University for Nationalities,Nanning 530006,China,2.Guangxi University,Nanning 530005,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | chicken toll-like receptor 3 amplification sequence analysis structure prediction |
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