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禽流感病毒等RNA病毒鉴别基因芯片的制备
引用本文:TIAN Li-na,王秀荣,YANG Zhong-ping,石霖,TAO Qi-meng,包红梅,LI Yan-bing,陈化兰.禽流感病毒等RNA病毒鉴别基因芯片的制备[J].中国兽医科学,2008,38(8).
作者姓名:TIAN Li-na  王秀荣  YANG Zhong-ping  石霖  TAO Qi-meng  包红梅  LI Yan-bing  陈化兰
作者单位:中国农业科学院,哈尔滨兽医研究所,农业部动物流感重点开放实验室兽医生物技术国家重点实验室国家禽流感参考实验室,黑龙江,哈尔滨,150001
基金项目:中国-俄罗斯合作基金 
摘    要:将克隆和鉴定的AIV的HA、NA、M、NS、NP基因以及NDV、IBDV,IBV的保守基因片段作为探针,同时以克隆的GAPDH基因作为阳性对照,利用芯片点样系统spotArray<'TM>24将探针与阳性对照、阴性对照和空白对照按照设计好的阵列点在基片上,制备了AIV等RNA病毒诊断芯片,并从点样条件和杂交条件两个方面进行了优化.结果显示,探针浓度在300~1 200 μg/mL时点样,Cy3-dUTP终浓度为0.05μmol/mL,杂交温度在42℃,杂交时间在8~12 h时,杂交信号比较理想.该方法对20份已鉴定的H5N1亚型禽流感病毒的检出率为100%(20/20);10份现地送检的疑似AIV样品的检出率为70%(7/10),检测结果与RT-PCR和鸡胚传代分离鉴定的符合率为100%.结果表明,制备的DNA芯片可有效诊断上述病毒.

关 键 词:禽流感病毒  基因芯片  鉴别诊断  优化

Preparation for discrimination microarray of RNA viruses
TIAN Li-na,WANG Xiu-rong,YANG Zhong-ping,SHI Lin,TAO Qi-meng,BAO Hong-mei,LI Yan-bing,CHEN Hua-lan.Preparation for discrimination microarray of RNA viruses[J].Veterinary Science in China,2008,38(8).
Authors:TIAN Li-na  WANG Xiu-rong  YANG Zhong-ping  SHI Lin  TAO Qi-meng  BAO Hong-mei  LI Yan-bing  CHEN Hua-lan
Abstract:
Keywords:
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