| 肠道菌群多样性变性梯度凝胶电泳分析法的建立 |
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| 引用本文： | 刘健华,陈杖榴,李云,俞道进.肠道菌群多样性变性梯度凝胶电泳分析法的建立[J].中国兽医科学,2005,35(6):445-449. |
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| 作者姓名： | 刘健华 陈杖榴 李云 俞道进 |
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| 作者单位： | 华南农业大学,兽医学院,广东省兽药研制与安全评价重点实验室,广东,广州,510642 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重点项目(30130140) |
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| 摘 要： | 采用珠磨法、冻融研磨法和酶法对粪便细菌进行裂解,提取粪便细菌DNA,并采用16SrRNAV3区引物(P3GCf、P2r)和V6V8区引物(U968GCf、L1401r)扩增细菌16SrRNA基因可变区,对变性梯度凝胶电泳(DGGE)方法用于肠道菌群多样性分析的各种条件进行了优化,建立了分析人和动物粪便菌群多样性的DGGE方法。2对引物的粪便DGGE结果都表明,珠磨法和冻融研磨法对细菌的裂解效果优于酶法;P3GCf、P2r引物的条带数明显多于U968GCf、L1401r引物;珠磨法PCRDGGE对普通拟杆菌、青春双歧杆菌和粪肠球菌的检测限分别为(6.4±0.1)×102、(6.1±0.7)×103和(7.2±0.2)×105个细菌,珠磨法对这3种细菌的检测限均低于酶法。结果表明,珠磨法和P3GCf、P2r引物更适宜用于粪便菌群多样性DGGE分析。
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| 关 键 词： | 变性梯度凝胶电泳 肠道菌群 DNA提取 菌群多样性 |
| 文章编号： | 1000-6419(2005)06-0445-05 |
| 修稿时间： | 2005年2月4日 |
Development of denaturant gradient gel electrophoresis for analysis of intestinal microflora community diversity |
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| LIU Jian-hua,CHEN Zhang-liu,LI Yun,YU Dao-jin.Development of denaturant gradient gel electrophoresis for analysis of intestinal microflora community diversity[J].Veterinary Science in China,2005,35(6):445-449. |
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| Authors: | LIU Jian-hua CHEN Zhang-liu LI Yun YU Dao-jin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | PCR-DGGE intestinal microflora DNA isolation bacterial diversity |
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