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牛结节性皮肤病病毒野毒株TaqMan-MGB荧光定量PCR检测方法的建立
作者姓名:聂福平  孟向阁  王昱  杨俊  李贤良  王国民  韩雪清  李应国  侯长军
作者单位:重庆出入境检验检疫局检验检疫技术中心/重庆市陆生动物疫病防控技术研究工程中心/牛病检测重点实验室;重庆大学生物工程学院;西南大学动物科技学院;中国检验检疫科学研究院
基金项目:国家"十三五"科研项目(2016YFD0500907-X);国家质检公益性项目(201310093);重庆出入境检验检疫局科技自立项目(2017CQIK01)
摘    要:为鉴别牛结节性皮肤病病毒野毒株(wild type lumpy skin disease virus,WT LSDV),本研究根据GenBank中发表的WT LSDV全基因组序列,设计并合成1对特异性引物和MGB探针,优化反应条件,建立了鉴别检测WT LSDV的TaqMan-MGB荧光定量PCR方法。结果显示,该方法仅对WT LSDV核酸有特异性扩增,对LSDV疫苗株等其他病毒核酸无交叉反应;标准曲线在一定浓度范围内呈现良好的线性关系,标准曲线为y=-3.361 x+34.979,R^2>0.999,扩增效率为98.39%,最低检测限为4.6 copies/μL。组内、组间重复性试验的变异系数均小于3%。对63份模拟临床样品的检测结果显示,本研究建立荧光定量PCR方法的阳性检出率为90.57%,OIE推荐的普通PCR方法的阳性检出率为64.15%,两种方法检测临床样品均为WT LSDV核酸阴性。结果表明,建立的WT LSDV TaqMan-MGB荧光定量PCR方法特异、敏感、快速、重复性好,且能快速准确地检测WT LSDV,适用于临床样品的鉴别检测,为该病的鉴别、监测、防控提供了技术支撑。

关 键 词:牛结节性皮肤病病毒野毒株  荧光定量PCR  TaqMan-MGB
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