27-plex SNPs复合扩增检测体系构建与应用评价 |
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引用本文: | 魏丽,魏以梁,江丽,孙启凡,王英元,李彩霞. 27-plex SNPs复合扩增检测体系构建与应用评价[J]. 中国法医学杂志, 2016, 0(1): 13-17. DOI: 10.13618/j.issn.1001-5728.2016.01.004 |
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作者姓名: | 魏丽 魏以梁 江丽 孙启凡 王英元 李彩霞 |
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作者单位: | 1. 公安部物证鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室 北京1000382;公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心 北京1000382;山西医科大学,山西太原036000;2. 天津医科大学基础医学院免疫系 天津300070;3. 公安部物证鉴定中心法医遗传学公安部重点实验室 北京1000382;公安部物证鉴定中心北京市现场物证检验工程技术研究中心 北京1000382;4. 山西医科大学,山西太原,036000 |
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基金项目: | 中央级公益性基本科研业务费项目,十二五课题支撑项目 |
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摘 要: | 目的建立27个常染色体SNPs复合检测体系,用于未知个体种族来源推断。方法通过对Hap Map数据库中描述祖先(非洲、欧洲、东亚)的遗传标记信息分析,选出27个SNPs位点,构建27个SNPs复合扩增体系;采用该体系对17个不同祖先人群的1 164份样本进行测试,得到的分型数据和在Hap Map数据库查询到的11个相关人群的数据;采用据聚类分析方法(K=3)进行祖先成分和匹配率计算,分析推算样品9947A的祖先来源,并进行体系性能验证。结果该体系可以进行单一和混合人群的种族来源和种族成分推断,来自新疆的人群遗传成分呈现在欧洲与东亚祖先之间连续分布,样品9947A祖先成分和匹配率与相关文献分析结果一致。浓度最低为0.1ng/μL时27个等位基因均可正确判型。结论本文构建的27-plex SNPs复合体系可以精确推断非洲、欧洲、东亚血统的个体祖先起源,且对欧亚混合人群(欧洲/东亚)有较好的推断能力,可在相关研究和实践中选择使用。
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关 键 词: | 法医物证学 SNPs 复合扩增 多态性分析 |
The development of a 27-plex SNP multiplex system |
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Abstract: | |
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Keywords: | forensics biological evidence SNPs compound amplification polymorphism analysis |
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