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全血和血斑蛋白质组学差异分析
引用本文:黄傲,温姝博,孔倩倩,赵珍敏,刘希玲.全血和血斑蛋白质组学差异分析[J].法医学杂志,2023(6):549-556.
作者姓名:黄傲  温姝博  孔倩倩  赵珍敏  刘希玲
作者单位:1. 苏州大学基础医学与生物科学学院;2. 司法鉴定科学研究院上海市法医学重点实验室司法部司法鉴定重点实验室上海市司法鉴定专业技术服务平台
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81871534);;中央级科研院所社会公益研究资助项目(GY2021G-2);
摘    要:目的 研究外周血形成干燥血斑后蛋白质水平的变化。方法 应用液相色谱-串联质谱法(LCMS/MS)和非标记定量(label-free quantification,LFQ)策略进行全血和血斑的蛋白质检测,分别采用R 4.2.1软件limma包和edgeR包筛选差异蛋白质,再进行生物学功能、信号通路和亚细胞定位分析。结果 全血和血斑中分别检测到623个和596个蛋白质,其中31个蛋白质的定量差异具有统计学意义,包括10个丰度在血斑中上调和21个丰度在血斑中下调的蛋白质。结论 全血和血斑中的蛋白质丰度高度相关,两者间蛋白质丰度的改变可能与细胞内源性蛋白和结构蛋白的变化相关。应用蛋白质组学技术可以辅助蛋白质生物标志物的筛选和鉴定,为法医学研究引入新型生物标志物。

关 键 词:法医学  蛋白质组学  液相色谱-串联质谱法  差异蛋白质  非标记定量策略  全血  血斑
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