NCBI数据库在常见嗜尸性蝇类种属鉴别中的应用 |
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引用本文: | 李学博,刘东,巩强,王清山,杨永强,万立华,李红卫.NCBI数据库在常见嗜尸性蝇类种属鉴别中的应用[J].中国法医学杂志,2014(1). |
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作者姓名: | 李学博 刘东 巩强 王清山 杨永强 万立华 李红卫 |
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作者单位: | 山东省高校证据鉴识重点实验室(山东政法学院);重庆市公安局物证鉴定中心;临沭县公安局;重庆医科大学法医学教研室; |
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基金项目: | 公安部重点研究计划项目(2011ZDYJCQSJ006) |
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摘 要: | 目的探讨NCBI数据库比对分析对常见嗜尸性蝇类种属鉴别中的应用价值。方法收集2009年1月至2012年12月重庆市常见嗜尸性蝇类不同发育历期2科5属7种样本52份,采用Chelex100法提取mtDNA,利用2对引物扩增细胞色素C氧化酶辅酶I基因,分别截取498bp和841bp相同长度的序列,采用MEGA软件计算种内及种间进化分歧情况,并分别在NCBI数据库进行序列BLAST搜索种属同源性比对分析。结果所得序列种内进化分歧均数在0%~0.7%之间,种间进化分歧均数在7.5%~16.1%之间;7个种属的样本序列I和序列II分别有5个和6个种属完全比对正确,样本总体的正确率分别达到96.15%和98.08%,Max ident值均在97%以上。结论采用序列同源性比对分析,并借助NCBI数据库强大的检索分析功能,可准确进行常见嗜尸性蝇类的种属鉴定,为法医学死亡时间推断提供重要参考依据。
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关 键 词: | 法医昆虫学 嗜尸性蝇类 NCBI mtDNA 种属鉴别 |
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