| 环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因侧翼序列的hiTAIL-PCR扩增及其生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 岑双庆,李有全,张晓,何海宁,刘志杰,陈泽,杨吉飞,关贵全,牛庆丽,刘爱红,任巧云,罗建勋,殷宏.环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因侧翼序列的hiTAIL-PCR扩增及其生物信息学分析[J].中国兽医科学,2014(1). |
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| 作者姓名： | 岑双庆 李有全 张晓 何海宁 刘志杰 陈泽 杨吉飞 关贵全 牛庆丽 刘爱红 任巧云 罗建勋 殷宏 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(31272556,31101621);农业部肉牛牦牛项目(CARS-38);国家重点基础研究发展计划(973)项目(2010CB530206);国家引进国际先进农业科学技术计划(948)项目(2010-S04);家畜疫病病原生物学国家重点实验室项目;欧盟EPIZONE项目(FOOD-CT-2006-016236);ASFRISK项目(211691);AR-BOZOONET项目(211757);PIROVAC项目(KBBE-3-245145) |
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| 摘 要： | 为扩增环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因的侧翼序列,从感染环形泰勒虫的淋巴细胞系中提取RNA,反转录合成第1链cDNA。以该cDNA为模板,利用高效热不对称交互PCR法(hiTAIL-PCR)进行扩增,将目的片段连接到pGEM-T Easy载体并进行测序。结果显示,获得了环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因的5′端侧翼序列,该序列编码894个氨基酸。生物信息学分析结果表明,该蛋白具有信号肽,信号肽剪切部位位于第19~20个氨基酸残基之间,很可能是一种分泌蛋白;经TMHMM2.0预测,该蛋白在第875~892位氨基酸残基部位具有典型的跨膜结构;Motifscan预测的结果显示,环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白存在2处N-糖基化位点(153NLSF、333NESM)和15处CK2蛋白激酶磷酸化位点;在该蛋白第500~650位氨基酸残基部分具有较高的抗原性,推测可能是该蛋白与其他蛋白发生相互作用的区域。
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| 关 键 词： | 环形泰勒虫 RT-PCR 微线体-棒状体蛋白 hiTAIL-PCR 生物信息学分析 |
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