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含74个腺嘌呤poly(A)尾的猪水泡病病毒HK/70株3'非编码区的克隆及其特征分析
引用本文:郑海学,刘湘涛,尚佑军,吴锦艳,冯霞,白兴文,田宏,孙世琪,尹双辉,郭建宏,刘在新,谢庆阁.含74个腺嘌呤poly(A)尾的猪水泡病病毒HK/70株3''''非编码区的克隆及其特征分析[J].中国兽医科学,2006,36(1):7-12.
作者姓名:郑海学  刘湘涛  尚佑军  吴锦艳  冯霞  白兴文  田宏  孙世琪  尹双辉  郭建宏  刘在新  谢庆阁
作者单位:1. 中国农业科学院,兰州兽医研究所,农业部畜禽病毒学重点实验室,甘肃,兰州,730046;中国农业科学院,研究生院,北京,100081
2. 中国农业科学院,兰州兽医研究所,农业部畜禽病毒学重点实验室,甘肃,兰州,730046
3. 中国农业科学院,兰州兽医研究所,农业部畜禽病毒学重点实验室,甘肃,兰州,730046;西北农林科技大学,陕西,杨凌,712100
摘    要:应用3′RACE法降落式扩增并克隆了猪水泡病病毒(SVDV)HK/70株基因组3′端的真实序列.测序结果表明,所扩增的目的基因片段长4 200 nt,包括非结构蛋白编码区(P2和P3)、3′端非编码区和poly(A)尾,其中3′NTR位于终止密码子TAA之后,长99 nt,poly(A)至少含有74个腺嘌呤碱基.经与参考毒株进行序列比较,结果显示, HK/70株与J1′73、H/3′76和AUG/22/90株的核苷酸同源性较高,为99.0%(仅第65位碱基不同),而与NET/1/92参考毒株的核苷酸同源性较低,为83.3%,与人柯萨奇病毒B5 UK/54株(UK/54-CB5)的同源性为75.7%.同时对3′NTR的二级结构进行分析,并与参考毒株和CB5毒株的二级结构进行了比较.结果表明,它们具有协同变异性,有共同的祖先,显示出3′NTR存在支持其功能所必需的一些结构域.

关 键 词:猪水泡病病毒  3′NTR  二级结构  柯萨奇病毒B5
文章编号:1673-4696(2006)01-0007-06
修稿时间:2005年8月3日

Molecular cloning and characterization of 3' non-translated region of swine vesicular disease virus HK/70 strain with 74 adenines poly(A) tail
ZHENG Hai-xue,LIU Xiang-tao,SHANG You-jun,WU Jin-yan,FENG Xia,BAI Xing-wen,TIAN Hong,SUN Shi-qi,YIN Shuang-hui,GUO Jian-hong,LIU Zai-xin,XIE Qing-ge.Molecular cloning and characterization of 3'''' non-translated region of swine vesicular disease virus HK/70 strain with 74 adenines poly(A) tail[J].Veterinary Science in China,2006,36(1):7-12.
Authors:ZHENG Hai-xue  LIU Xiang-tao  SHANG You-jun  WU Jin-yan  FENG Xia  BAI Xing-wen  TIAN Hong  SUN Shi-qi  YIN Shuang-hui  GUO Jian-hong  LIU Zai-xin  XIE Qing-ge
Abstract:
Keywords:poly(A)
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