| 山羊痘病毒古浪株P32毒力蛋白的结构模拟与分析 |
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| 引用本文： | 赵志荀,吴国华,颜新敏,崔力凡,李健,朱海霞,张强.山羊痘病毒古浪株P32毒力蛋白的结构模拟与分析[J].中国兽医科学,2010,40(8). |
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| 作者姓名： | 赵志荀 吴国华 颜新敏 崔力凡 李健 朱海霞 张强 |
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| 作者单位： | 赵志荀(中国农业科学院,兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,甘肃,兰州,730046;甘肃农业大学,动物医学院,甘肃,兰州,730070);吴国华,颜新敏,崔力凡,李健,朱海霞,张强(中国农业科学院,兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,农业部畜禽病毒学重点开放实验室,甘肃,兰州,730046) |
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| 基金项目： | 甘肃省重大科技专项，农业部转基因生物新品种培育重大专项 |
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| 摘 要： | 以山羊痘病毒(GPV)古浪(Gulang)株的DNA为模板,采用PCR扩增目的基因p32,应用TM-pred软件预测其跨膜结构区域,通过Threading方法建立GPVGulang株P32蛋白的3D结构,并综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测其B细胞抗原表位。结果表明,p32在核苷酸水平上非常保守,19株GPVp32基因的整体变异率为0.22%。GPVGulang株P32结构蛋白的三维空间结构有不同的结构区域,共由14个α-螺旋、5个β折叠、35个转角和若干无规则卷曲构成。P32蛋白呈现较规则的空间构象,其中羧基末端第286～306位氨基酸区段为跨膜区域,11～19、21、47、66、123、154、155、183、185、225、230～232、235、238、239这些氨基酸在空间上共同形成的区域极有可能是抗原表位区域。
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| 关 键 词： | 山羊痘病毒 P32结构蛋白 3D结构 B细胞表位 |
Structural modelling and analysis of P32 from a goatpox virus Gulang strain |
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| ZHAO Zhi-xun,WU Guo-hua,YAN Xin-min,CUI Li-fan,LI Jian,ZHU Hai-xia,ZHANG Qiang.Structural modelling and analysis of P32 from a goatpox virus Gulang strain[J].Veterinary Science in China,2010,40(8). |
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| Authors: | ZHAO Zhi-xun WU Guo-hua YAN Xin-min CUI Li-fan LI Jian ZHU Hai-xia ZHANG Qiang |
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| Institution: | ZHAO Zhi-xun1,2,WU Guo-hua1,YAN Xin-min1,CUI Li-fan1,LI Jian1,ZHU Hai-xia1,ZHANG Qiang1(1.Key Laboratory of Animal Virology of the Ministry of Agriculture/State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology/Lanzhou Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730046,China,2.College of Veterinary Medicine,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | GPV P32 structure protein 3D model B-cell epitope |
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