采用Identifiler系统进行全同胞关系判定的准则探讨

目的 探讨采用Identifiler系统进行全同胞关系判定时共有等位基因数(IAN)和全相同基因座数(A2)的标准.方法 依据IAN和A2的有限分布,将IAN的31种取值代入已建立的判别函数,获得判定全同胞时IAN和A2的阈值,据此确定4种标准,对经Identifiler系统分型的280对全同胞和2003对无关个体对进...     

利用同胞关系鉴定强奸杀人案1例

1 案例资料 齐某，女，19岁。2006年10月28日早8时，被人发现死于村边小路上。法医尸检确认齐某死因为生前溺水，并受到性侵犯，阴道内发现精子。     

常染色体及X染色体STR用于同胞鉴定1例

本文通过PCR-STR分型技术,对1名认亲女性个体与4名已知同胞兄妹检测15个常染色体-STR基因座和14个X染色体-STR基因座,根据遗传规律分析及用判别函数进行判断,结果一致,排除认亲个体与4兄妹存在同胞关系。     

综合应用Y-STR和全同胞关系破获命案积案1例

Y染色体具有父系遗传的特性.公安机关已建立了Y-STR家系排查方法,用以划定侦查范围、确定犯罪嫌疑人所在的家系.在本文中,技术人员通过Y-STR定位家系,容差推断锁定近亲家系并利用状态一致性(IBS)分析法鉴别全同胞关系,充分挖掘检材分型信息,更好地服务侦查破案,丰富了Y-STR的综合应用策略.     

多种判定方法在半同胞姐妹关系鉴定中的综合应用

目的探讨综合运用三种不同方法进行半同胞姐妹关系的鉴定。方法对案例中的甲、甲母、乙和乙母分别使用Power Plex21试剂盒、AGCU Expressmarker 21+1试剂盒、Microreader 23sp-B试剂盒和AGCU X-19 STR试剂盒进行STR分型,根据STR分型结果分别利用ITO方法、判别函数法和IBS法进行半同胞关系鉴定。同时结合X-STR结果,进而综合判定是否为同父异母半同胞姐妹亲缘关系。结果本案例中通过ITO方法计算,HSI均在1.36×102~2.09×105之间,支持甲和乙为半同胞关系,判别函数同样得到了基本一致的结果,IBS法的结果也对此结果进行了验证。结论对于同父异母的半同胞关系鉴定,综合应用多种判定方法分析可获得较为可靠的鉴定意见。     

应用ITO法确定同胞关系1例

1案例资料某年4月27日~5月2日,某市陆续发现上肢、下肢、躯干等人体尸块,初步检验显示尸块分别来自1男1女。经查发现陈某、林某夫妇去向不明,对其住宅进行勘验,在客厅天花板、电视机、墙壁、椅子,厨房水桶等处发现了多处血迹,客厅、洗手间门口附近地面有大量潜血,现场提取血迹及牙刷、漱口盅、拖鞋、衣服等生活物品做DNA鉴定。2 DNA鉴定DNA鉴定结果证实,死者为1男性和1女性个体,血迹、牙刷、衣服等物品分别检出两死者的基因型,表明两死者在此处居住过,并且被害。但陈某夫妇的生活习惯无法调查,为确定两死者就是陈某和林某,还需进一步做…     

应用家系重建鉴定半同胞关系亲权指数计算

在法医物证鉴定中,目前对于半同胞亲缘关系的鉴定还没有统一的技术规范,较为常用的方法是通过ITO法计算两个被鉴定个体之间的半同胞关系指数进行判定,但在部分实际检案中,即使加测更多数量的STR基因座仍不能达到阈值。本文探讨通过家系重建法鉴定半同胞关系,根据被检孩子生母是否参与鉴定,以及缺席鉴定者不同的推测基因型分别推导亲权指数的计算公式,并对其进行了归纳和总结。     

利用STR分型方法进行同胞关系鉴定

本文运用人类短串联重复序列(shorttandemrepeats,STR)分型方法对1案例进行了同胞血缘关系鉴定,通过这一案例的分析得出了一些数据,供同行们参考。1案情2004年,应委托人王某之要求,对5位已知同胞兄弟姐妹与另一位可疑个体之间是否存在同父同母之同胞关系进行鉴定。2材料和方法2.1DNA抽提取5名同胞兄妹的血样(1,2,3,5,6号)和可疑个体血样(4号),用Chelex-100快速提取法[1]提取DNA。2.2PCR反应用ABI公司荧光标记扩增试剂盒(AmpFlSTRTCofilerPCRAmplificationKit、AmpFlSTRTMProfilerPluPCRAmplificationKit)对DNA进行PCR扩…     

疑难父系半同胞亲缘关系鉴定1例

1案例资料 1.1 简要案情 被鉴定人甲,父亲已故.被鉴定人乙因遗产继承纠纷申请与甲作同父异母亲缘关系鉴定. 1.2 DNA分型检验 采用Chelex-100法提取甲、乙、甲母、甲姐、甲弟共5人血样模板DNA,应用Applied Biosystems(R) Y、Identifiler体系(AB公司)、STR TyperTM 10体系(珠海科登公司)、AGCU 21+1STR(无锡中德美联公司)进行复合扩增,产物在310型遗传分析仪(AB公司)上进行电泳分型,结果经GeneMapper ID v3.2软件判读.     

多种遗传标记联合应用判定同胞关系3例

<正>全同胞关系是指同父母所生的子女之间的关系,属于复杂亲缘关系的主要类型之一。本人在实际工作中联合运用常染色体、Y染色体、X染色体的STR检验及线粒体DNA的SNP检验,成功判定了3起案件中当事人的同胞亲缘关系,可以为类似的案件提供一定的借鉴。1案例资料【案例1】包某海（男,编号1X）称其1955年左右在某地走失。采集其唾液样本检验比对,发现其DYS19等41个Y染色体STR分型与其走失地的李姓家系相同。该李姓家系的李某华（女,编号1A）称其有一弟弟幼年走失,其父母现已去世,需鉴定包某海与李某华是否具有全同胞关系。     

常染色体STR遗传标记在同胞鉴定中的应用

目的 探讨常染色体STR遗传标记用于鉴定两个体同胞关系的可行性。方法 用Power Plex~(TM)16体系15个STR基因座检测150对同胞个体和150对无关个体,ITO法计算同胞关系指数(PI_(FS))与同胞关系概率(W_(FS)),并比较两组W_(FS)值及两个体间等位基因匹配情况的差异,对前者进行组间差异的x~2检验。结果 100对(66.67％)同胞个体的W_(FS)大于0.9995;无关个体W_(FS)均小于0.8,其中100对(66.67％)W_(FS)小于0.27。同胞个体两个体间等位基因全相同的基因座个数为1～10个不等,平均5.49个,无关个体0～5个不等,平均1.33个;等位基因全不同的基因座个数,同胞个体0～6个不等,平均1.66个,无关个体2～11个不等,平均6.57个;等位基因半相同的基因座个数,同胞个体3～13个不等,平均7.85个,而无关个体1～13个不等,平均7.11个。经x~2检验,同胞个体和无关个体间全相同和全不同的基因座数差异均有极显著意义(P<0.001),半相同的基因座数差异无显著意义(P>0.05)。结论 PowerPlex~(TM)16体系可用于鉴定同胞关系。当两个体全不同基因座个数大于或等于6个,或全相同基因座数为0时,提示为无关个体;当两个体全不同基因座个数小于或等于1个,或全相同基因座数大于或等于6个时,提示为同胞。     

51个常染色体STR基因座在ITO法判断全同胞中的应用

目的探讨ITO法和判别函数法在全同胞鉴定中的应用价值。方法根据342对全同胞和3 900对无关个体的19、21、39、51个常染色STR基因座的分型结果,采用ITO法计算全同胞关系指数(FSI)。用SPSS软件Fisher判别分析法,分别建立lg FSI全同胞-无关个体的判别函数。结果每组全同胞对和无关个体对的lg FSI符合正态分布,具有显著性差异。在19、21、39、51个STR基因座,全同胞组判别函数分别为L同胞=1.666 6×lg FSI-5.208 0,L同胞=1.643 9×lg FSI-5.512 0,L同胞=1.569 4×lg FSI-8.076 4,L同胞=1.480 7×lg FSI-9.860 9;无关个体组分别为L无关=-1.346 1×lg FSI-3.638 5,L无关=-1.330 9×lg FSI-3.851 7,L无关=-1.319 2×lg FSI-5.910 2,L无关=-1.273 8×lg FSI-7.477 6。平均错判率分别为:1.361 9%、1.228 5%、0.438 6%和0.146 2%。结论 ITO判别函数法在全同胞-无关个体鉴定中具有很高的应用价值,且检测基因座越多,系统效能越高,并能降低错判风险。     

判别函数在同胞鉴定中的应用

目的探讨判别函数法在全同胞与半同胞鉴定中的应用价值。方法根据360对全同胞、90对半同胞及360对无关个体的15个STR基因座分型结果,计算全不同(X0)、半相同(X1)和完全相同(X2)的基因座数目,分别根据DFS1=3.898X0+3.973X1-19.481,DHS1=5.687X0+5.300X1-35.112及DR1=7.309X0+5.533X1-44.941的全同胞/半同胞/无关个体判别函数、DFS2=3.872X0+3.931X1-18.895及DR2=7.303X0+5.473X1-44.298全同胞/无关个体判别函数和DHS3=10.227X0+10.436X1-66.102及DR3=11.863X0+11.089X1-79.494半同胞/无关个体判别函数进行判别。结果判别准确率:①用全同胞/半同胞/无关个体判别函数,全同胞组为83.61%,半同胞组为81.11%,无关个体组为83.06%;②用全同胞/无关个体判别函数,全同胞组为96.39%,无关个体组为98.61%;③用半同胞/无关个体判别函数,半同胞组为88.89%,无关个体组为85.00%。结论本文3种判别函数可应用于同胞鉴定,尤其运用全同胞/无关个体判别函数判断同胞关系准确率高,有较高的应用价值。     

磁珠法自动化纯化现场检材DNA方法研究

目的利用TE-MAGS在TECAN工作站上结合磁珠试剂盒,建立自动化工作站批量纯化现场检材DNA的方法,并探讨其在法医物证检案中的应用。方法灵敏度测试:标准品使用0.1ng/μL 9947A,用200μL TES稀释制备DNA总量0.1ng~1ng共10种的标准样品,采用本文方法提取纯化,使用IdentifilerTM试剂盒扩增,用3130XL型测序仪检测,Gene Mapper ID-X分析,分析STR图谱质量;纯化能力测试:在1ng总量的标准样品中加入腐殖酸、血红素,采用本文方法提取纯化、扩增检测,分析STR图谱质量;实际案件应用对比:收集304份现场检材,分别采用本方法和硅珠法进行提取纯化,经扩增检测,统计对比两种提取纯化方法 STR分型成功率。结果灵敏度测试:0.1ng~0.2ng总量标准样品提取的DNA模板,扩增后可检测到部分基因座STR图谱,0.3ng~1ng总量标准样品提取的DNA模板,扩增后可以得到完整的STR图谱;纯化能力测试:对混合有一定浓度的腐殖酸、血红素的标准样品的提取产物检测图谱未见明显抑制;实际案件应用对比测试:304份现场检材工作站磁珠法检出成功率(50%)高于硅珠法(40.8%)。结论本文所建立的方法缓冲范围较大,回收率高,纯化能力强,提取产物STR分型成功率高,适合现场检材批量化DNA检验。     

藏獒犬11个STR基因座遗传多态性

目的建立犬STR复合扩增体系,为犬个体识别和亲权鉴定提供一种检测方法。方法用自行建立的11个犬STR基因座复合扩增体系,使用ABI3130XL遗传分析仪,对107份藏獒唾液DNA样本的扩增产物进行检测及统计学分析。结果除1个基因座杂合度低于60%,其他10个基因座杂合度均高于70%;11个基因座PIC值均在0.6以上;11个基因座中有8个基因座的个体识别率在0.938以上,其余3个基因座均在0.826以上;父权排除率除TETRA为0.267,其余在0.401~0.749之间,偶合机率1.08×10-13。结论此11个犬STR基因座在藏獒犬中具有较高的个体识别能力,可用于犬类个体识别和亲权鉴定。     

19个常染色体与4个Y染色体STR复合扩增体系的建立

目的建立19个常染色体STR及Amelogenin和4个Y染色体STR基因座复合扩增体系,并对其效能进行评估。方法用五色荧光标记20＋4Y—STR基因座,建立同步扩增检测体系,用ABI3130XL遗传分析仪对扩增产物进行电泳,GeneMapperID3．2软件进行基因分型;检测体系的灵敏度、均衡性、稳定性、特异性、同一性和稳定性,并观察混合、降解及微量检材的分型情况。结果采用本文体系,DNA模板量在0．05～1．00ng时,分型准确,均衡性、特异性好;混合、降解及微量检材分型正确。该19个常染色体STR基因座的累计个人识别率大于0．999999999,三联体累计非父排除率达0．999999985,Y—STR单倍型多态性为0．592。结论本文建立的复合扩增体系分型准确,稳定,在法医学案件检验及数据库建设等方面有良好的应用前景。     

福尔马林固定组织SNP与STR检测的比较

目的检测经长期福尔马林固定的组织降解情况,并比较组织中SNP与STR的检出率。方法本文对24例经福尔马林固定、-20℃保存5年的组织样本,采用Quantifiler?Trio DNA定量试剂盒检测样本DNA的降解系数及浓度,运用55-SNPs SNa Pshot复合分型体系和Power Plex?21试剂盒分别进行SNP与STR检测。结果大部分样本降解系数在1~8,发生不同程度的降解。与未降解样本相比,SNP分型完全一致,检出率为100%;其中8例样本STR分型存在33个等位基因丢失,降解系数均大于2.6,且75.8%的等位基因片段长度大于300bp。当样本检测出16个STR基因座时,似然率与54个SNP相当。当样本检出大于17个STR时,似然率大于54个SNP。STR基因座片段长度与等位基因检出率之间呈负相关。除2例样本降解系数较小却发生等位基因丢失外,其余样本降解系数与等位基因检出率之间呈负相关。结论经福尔马林长期固定的组织DNA易降解,检测SNP明显优于STR,但需要更多的SNP以提高个体识别能力。     

牛四核苷酸STR基因座的筛选和多态性分析

目的筛选阴影带出现率低且多态性较高的牛四核苷酸STR基因座。方法用Tandem repeats finder软件搜索牛基因组中的四核苷酸重复STR序列片段,用Primer Premier 5.0软件设计引物,然后扩增、电泳,筛选出符合要求的STR基因座,并对100份无关黄牛个体血样进行STR基因座分型。结果共筛选出6个具有多态性的牛四核苷酸重复STR基因座（B006、B007、B008、B022、B025、B026）,其100份无关黄牛个体血样的累积个体识别率和累积非父排除概率分别为0.99995和0.859591。结论本研究筛选出的6个四核苷酸STR基因座阴影带出现率低且多态性较高,可用于牛的个体识别和亲子鉴定的研究。     

云南玉溪汉族15个STR基因座多态性及遗传关系分析

目的调查玉溪汉族人群15个STR基因座的遗传多态性,并分析与国内部分地区汉族群体的遗传关系。方法采用AmpFLSTR Identifiler试剂盒,复合扩增15个STR基因座,计算基因频率及法医学参数;收集国内其他10个群体的遗传学资料进行遗传距离和聚类分析。结果玉溪汉族群体15个STR基因座等位基因及基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,PD值在0.790 6～0.968 1之间,PE值在0.315 9～0.733 5之间,PIC值在0.554 6～0.856 4之间,15个基因座累积个体识别力为0.999 999 999 999 999 99,累积非父排除率为0.999 998。不同地区汉族群体间遗传距离分析提示,玉溪汉族与成都汉族遗传距离最近(0.004 0),其次是河南(0.004 5)和潮汕(0.004 7);内蒙古最远(0.036 1)。结论云南玉溪汉族15个STR基因座具有较高的遗传多态性,适于该群体的法医学应用,遗传关系分析结果可为该群体的起源、迁徙及与其他群体的遗传关系分析提供参考。