PCR技术的常见问题与处理方法

自1989年我国DNA指纹技术研究获得成功并正式用于法医物证检验以来,已经为侦查破案发挥了重要作用.随着DNA技术的深入发展,此后PCR技术由于它日益明显的优越性得到越来越广泛的应用.到目前为止全国已有几十个法医PCR实验室,从单个VN-TR和STR位点的扩增技术到银染检测,从复合扩增STR技术到荧光检测,使得该技术越来越精确和方便.笔者将在办案过程中就PCR技术的常见问题与处理方法,尤其是银染检测STR位点复合扩增技术和荧光检测STR位点复合扩增技术所积累的一些经验总结如下供大家参考.     

法医 STR 的快速检验方法

以 STR 复合扩增检测为代表的法医 DNA 分型技术以其灵敏度高、核心序列小、可复合扩增、方法易于标准化等优势,已经成为当前法庭科学 DNA 检验的主要手段,在各国刑事案件侦破和民事案件解决中发挥了重要的作用。本研究在国内外实验室法医 STR快速检验方法[1]的基础上,从生物物证 DNA 免提取扩增检验、生物物证 DNA 快速提取检验、生物物证 DNA快速扩增、利用新型检测设备快速检测及使用 Gen-eMapper ID－X 软件快速分析5个方面进行归纳。     

荧光标记STR分型技术检验腐败组织基因型

探讨腐败组织荧光标记STR分型检测技术的应用价值。应用含12个STR基因座及一个性别基因座的2个荧光标记的复合扩增系统,对40例1～6周的腐败肌肉提取的DNA进行扩增,用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,PE377测序仪分析基因型。所检测样本在12个STR基因座均扩增出特异性谱带,并可判定其基因型。荧光标记STR检测技术对腐败组织分型可靠,在实际检案中具有较高的应用价值。     

葡萄胎的DNA检验

目的探讨一例强奸案中的葡萄胎样本的DNA检验及结果分析。方法用Identifiler试剂盒对葡萄胎样本和受害人血样进行荧光复合STR基因座扩增并分型。结果该例的葡萄胎在15个STR基因座上分型均为纯合子,应属于单精子受精的完全性葡萄胎。结论葡萄胎类型多种,对应着不同的DNA分型,在实际案件的检验中应引起注意。     

DYS19、DYS391、DYS439三个Y-STR荧光标记复合扩增的法医学应用研究

目的　研究Y—染色体STR基因座在法医学检测中的应用价值。方法　用荧光标记DYS19,DYS391,DYS4 39三个Y—STR基因座 ,PCR复合扩增 ,通过毛细管电泳得到结果。结果　三个Y—STR基因座有较高的种属特异性 ;观察 5 0次男性配子细胞形成过程中的减数分裂未发现突变基因 ;对男∶女不同比例混合血样检测 ,当男∶女性血样比达 1∶5 0时 ,仍能准确分型Y—STR基因型 ,并且Y—STR检验较常染色体STR分型更有优势 ;检测了 1～ 15个月病理石蜡切片 ,表明Y -STR基因座适合降解DNA的检测。结论　Y -STR分型适合日常法医检案的需要 ,该方法是对常染色体STR应用的一个补充。     

模板DNA用量对荧光STR复合扩增检测的影响

目的 探讨模板DNA用量对荧光STR复合扩增检测的影响,寻求荧光STR复合扩增检测的最适扩增模板DNA用量。方法 采用模板DNA(9947A)不同的扩增用量,对Profiler Plus试剂盒的基因座进行扩增,在3100型全自动遗传分析仪上作了检测。结果 3100型遗传分析仪检测的最适扩增模板DNA用量在0.31～2.5ng之间。结论 模板DNA量过高或过低均会影响荧光STR复合扩增检测结果的可靠性。     

DNase-Ⅰ纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA

目的研究脱氧核糖核酸酶I(DNase-I)纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA的方法在法医学中的应用。方法收集79份性犯罪案件混合斑检材,分别用DNase-I纯化结合碱性裂解法和差异裂解法提取精子DNA,采用STR荧光标记复合扩增体系进行16个STR基因座分型,并比较检验结果。结果应用DNase-I纯化结合碱性裂解法提取精子DNA,64例检材分型成功;应用差异裂解法提取精子DNA,57例检材分型成功;两种方法比较结果存在显著性差异(P=0.039),DNase-1纯化结合碱性裂解法提取精子DNA的STR分型成功率更高,成本低廉。结论DNase-I纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA可提高检验成功率,操作简便,快速,易于自动化,适于法医学个体识别鉴定。     

应用自动化工作站提取常见生物样本DNA

目的建立使用自动化工作站提取法医案件生物样本DNA的方法。方法选用Biomek 3000自动化工作站,采用DNA IQTM系统及Chelex法对法医案件中常见生物样本进行DNA提取,荧光定量技术进行定量,PCR扩增16个STR基因座并与手工提取方法比较。结果与手工提取方法进行比较,选用自动化工作站结合使用DNAIQTM系统及Chelex法提取DNA可获得满意的STR检验结果。结论自动化工作站可用于法医案件中常见生物样本的DNA提取。     

DNase-I纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA

目的研究脱氧核糖核酸酶I(DNase-I)纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA的方法在法医学中的应用。方法收集79份性犯罪案件混合斑检材,分别用DNase-I纯化结合碱性裂解法和差异裂解法提取精子DNA,采用STR荧光标记复合扩增体系进行16个STR基因座分型,并比较检验结果。结果应用DNase-I纯化结合碱性裂解法提取精子DNA,64例检材分型成功;应用差异裂解法提取精子DNA,57例检材分型成功;两种方法比较结果存在显著性差异(P=0.039),DNase-1纯化结合碱性裂解法提取精子DNA的STR分型成功率更高,成本低廉。结论DNase-I纯化结合碱性裂解法提取混合斑精子DNA可提高检验成功率,操作简便,快速,易于自动化,适于法医学个体识别鉴定。     

荧光STR复合扩增试剂盒的评估过程探索

STR复合扩增检验技术是目前法医DNA检验技术中最重要也是最常用的技术种类之一，随着荧光检测技术和毛细管电泳技术的发展，特别是DNA数据库建设中丰要采用STR复合扩增技术进行基因分型，大大拓展了STR复合扩增检验应用范围。与此同时，STR复合扩增检验试剂成为影响检验质量的重要因素，关系到样本检验分型结果，而分型数据是为法庭提供证据的直接依据，     

汗潜指印的STR分型检测在案件中的应用

目的探索案例中所涉及的汗潜指印DNA的提取和检验方法。方法采用Chlex-100法提取DNA,进行STR复合扩增,通过毛细管电泳检测荧光信号。结果案例中涉及的汗潜指印在ProfilerPlus试剂盒10个基因座的分型检测均获成功。结论含有汗潜指印的检材的发现和正确提取对最终检测成功至关重要。     

强奸致孕形成部分性葡萄胎的检验分析

目的探讨强奸致孕案葡萄胎组织的DNA检验和STR结果分析。方法用DNA Typer TM15试剂盒对犯罪嫌疑人、受害人血样和流产胚胎组织进行荧光复合STR基因座扩增检测。结果检测的一例流产胚胎组织DNA的STR峰谱表现出部分3条带,且3条带中有两个等位基因来源于犯罪嫌疑人,另外一个来源于受害人,推断为单卵双精子受精的部分性葡萄胎。结论应用STR分型技术可以推断葡萄胎的DNA来源和受精类型,为亲缘关系鉴定提供依据。     

15个常染色体和10个Y-STR基因座复合扩增试剂盒的研发

目的建立法医物证学常染色体和Y染色体综合检测的方法。方法选择常用的常染色体STR基因座和Y染色体STR基因座,设计复合扩增引物,形成五色荧光标记复合扩增试剂盒。结果开发出一个五色荧光标记复合扩增试剂盒,可同时对15个常染色体STR基因座、1个性别基因座和10个Y染色体STR基因座进行分型检测。结论 15个常染色体STR加10个Y染色体STR检测试剂盒结合毛细管电泳凝胶进行STR分型,结果准确可靠,在法医学案件检验及数据库建设等方面有良好的应用前景。     

批量陈旧血样DNA的自动化检验

目的建立批量陈旧血样DNA自动化提取检验的方法。方法采用普通磁珠法和本文建立的磁珠法经TECAN Freedom EVO150—8型自动化工作站分别提取540份陈旧血样模板DNA,采用Sinofiler^TM试剂盒进行荧光标记复合扩增。结果采用普通磁珠法和本文所建DNA提取方法,在540份样本中获得全部基因座STR分型的样本分别为217份和488份,检验成功率分别为40．2％和90．3％。结论本文所建方法可显著提高大批量陈旧血样自动化检验成功率。     

葡萄胎的DNA检验

本文利用STR复合扩增技术对1例强奸致孕案件中的胚胎组织进行了检验,结果获得了一种罕见的DNA分型（见图1）,其15个STR基因座均表现为纯合子。结合临床与病理检验结果,确定为葡萄胎。     

毛干及自然脱落毛囊复合扩增Amel及13个STR基因座检验的实验研究

刑事案件案发现场往往会遗留有毛发。人为拔下的毛发 ,毛囊用常规方法一般可成功检见Amel及STR基因座 ,达到同一认定 ,毛干可进行mtDNA检验。自然脱落毛囊一般不能进行Amel及STR基因座检验。Barbaro等报道 ,通过增加循环圈数的方法分别扩增同一个单位点STR基因座 4～ 5次后 ,采用激光荧光仪检测 ,综合分析结果 ,可以确定 3～ 4cm长1根毛干Amel及 8个STR基因座 ,这种检测方法已用于实际案件检验[1] 。我们受该文启发 ,较为系统的研究了毛干及自然脱落毛囊复合扩增Amel及 13个STR基因座 ,报道如下。1　材料与方法1 1　检材及样本自…     

汗潜指印的STR分型检测

目的探索汗潜指印的荧光STR复合扩增检测的方法。方法采用Chelex-100和Microco-100浓缩柱,提取汗潜指印中DNA,STR复合扩增荧光电泳检测。结果 105例汗潜指纹STR分型可明确判读5个以上基因座的占30.3％,个体之间的差异、捺印指印时用力大小以及指印遗留在客体上时间的长短均影响检测成功率。结论该汗潜指印的DNA提取方法步骤简单,方法较为稳定,使单枚汗潜指印可望获得DNA分型。     

荧光标记STR复合扩增检验系统的研究

本研究以化学合成的荧光标记引物建立了STR复合扩增体系,体系I包括4个STR基因座和牙釉蛋白基因,体系Ⅱ包括4个STR基因座,体系Ⅲ包括3个STR基因座.制备了体系I各基因座的等位基因标准对照,测定了各等位基因长度.对代表性等位基因进行了序列测定,确定了等位基因重复单位的重复数目及测量长度与等位基因命名的对应关系,对各基因座等位基因进行了标准命名.建立了复合扩增检验系统等位基因自动分析命名的模板.三个复合扩增检验体系的累积随机匹配概率为8.3×10-3,为遗传学分析建立了实用的检验系统.     

重庆地区汉族人群9个STR基因座遗传多态性

正本文应用STRtyper-10G荧光复合扩增体系,对重庆地区汉族人群9个常染色体STR基因座遗传多态性进行调查,以期为相关研究及实践提供基础数据。1材料与方法样本318名重庆地区无关汉族个体的血样均为重庆市正鼎鉴定所日常工作积累。STR分型所有样本均采用常规Chelex-100法提取DNA,STRtyper-10G荧光复合扩增试剂盒10μL反应体系进行扩增,ABI 3130遗传分析仪毛细管电泳     

“502”熏显后掌纹的STR检验2例

随着STR基因座复合扩增系统在法庭科学中的广泛应用，汗潜指印的STR分型检验已成为可能。本文对2枚“502”熏显后的掌纹进行了STR检验，现报道如下。