湖南地区苗族人群26个Y-STR基因座遗传多态性

<正>本研究应用Goldeneye TM DNA身份鉴定系统26Y试剂盒[基点认知技术(北京)有限公司]荧光标记复合扩增系统,对湖南地区120名苗族无关个体进行基因分型,获取了26个Y-STR基因座在湖南地区的相关群体遗传学数据,为该地区苗族人群的法医学鉴定提供基础数据,现报道如下。     

湖南地区汉族人群DYS456等26个Y-STR基因座多态性

正本研究应用GoldeneyeDNA身份鉴定系统26Y试剂盒[基点认知技术(北京)有限公司]荧光标记复合扩增系统对湖南地区510名汉族无关个体进行基因分型,获取了26个Y-STR基因座在湖南地区的相关群体遗传学数据,为该地区汉族人群法医学个体识别和亲权鉴定提供基础数据,现报道如下。1材料与方法510名汉族无关个体的血样采自湖南省所辖各     

福建畲族人群26个Y-STR基因座遗传多态性及其法医学应用

目的对Goldeneye TM DNA身份鉴定系统26Y试剂盒在畲族人群中的法医学应用进行研究。方法应用毛细管电泳分型技术,对53名福建地区畲族男性无关个体的26个Y-STR基因座进行检测,获得基因型分布状况,计算等位基因频率及单倍型多样性等群体遗传学参数,并对福建畲族与其他民族群体遗传关系进行分析。结果 53名无关个体中的26个Y-STR基因座共观察到126个等位基因,等位基因频率为0.010 1~0.886 8。26个Y-STR基因座的GD值为0.211 2~0.846 2,有19个基因座的GD值大于0.5。共观察到47种单倍型。根据R ST构建的遗传距离矩阵显示福建畲族与闽南汉族之间遗传距离最近,其次是南方汉族,与北方民族的遗传距离相对较远。结论 Goldeneye TM DNA身份鉴定系统26Y试剂盒所包含的26个Y-STR基因座在福建畲族中多态性较好,在特殊案件中可作为良好的补充体系,具有法医学应用价值。     

DNATyper~(TM) Y29试剂盒的性能确证

目的评价DNATyper~(TM)Y29试剂盒法医学应用价值。方法该试剂盒是五色荧光标记,包含29个Y-STR基因座,可以用于5色电泳测序仪,适用于Y-STR案件检验和数据库建设工作。该试剂盒包含AmpFlSTR~?Yfiler~?ki的17个Y-STR基因座以及另外的12个Y-STR基因座。本文通过不同反应体积、退火温度和循环次数对该体系进行方法验证,并且从灵敏度、准确性、种属特异性、混合样本、男性特异性、批次间试剂稳定性、不同检材的适应性与一致性等方面对其进行测试。结果该试剂盒分型结果准确、灵敏度高(最低检测模板可达62.5 pg);在1600:1的高浓度女性背景条件下,仍可以获得男性完整分型,具有良好的男性特异性;男性混合样本中,1:3-3:1的混合范围内,可以获得完整分型;此外,试剂盒还具有良好的种属特异性测试、一致性和稳定性。结论上述结果表明该试剂盒可用于法庭科学实际案件检验与Y-STR DNA数据库建设。     

Goldeneye~(TM) DNA身份鉴定系统25A试剂盒的法医学验证

目的对Goldeneye TM DNA身份鉴定系统25A试剂盒的技术性能进行测试及评估。方法依据规定的方法对该试剂盒的准确性、灵敏度、一致性、均衡性、稳定性和混合样本等方面进行检验,并应用于部分人员血样和常见案件检材的检验。结果各等位基因间均衡性≥42%,阳性DNA样本分型准确,0.125 ng的阳性对照样本可检出完整分型。结论 Goldeneye TM DNA身份鉴定系统25A试剂盒可以用于法庭科学的DNA数据库和部分案件的DNA检验。     

X-STR在精斑混合检材检验中的法医学应用

目的应用X和Y染色体STR分析含有相同父系祖先个体DNA的混合检材。方法用差异裂解法提取混合检材基因组DNA,用PowerPlex 21试剂盒、GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统27Y试剂盒、SureID?PathFinder扩增荧光检测试剂盒和GoldeneyeTM DNA身份鉴定系统17X试剂盒检测混合检材。结果根据X-STR和Y-STR单倍型成功鉴别具有相同父系祖先的嫌疑人,确定混合检材中存在4个男性个体DNA。结论 X-STR可以应用于检验精斑混合检材,结合Y-STR数据可区分相同父系男性个体,并辅助判断混合检材中男性个体的数量。     

9个Y-STR基因座荧光复合扩增系统的法医学应用

目的建立9个Y-STR基因座的复合扩增系统,提高Y-STR的法医学检测效能。方法6-FAM标记DYS434、Y-GATA-A10、DYS438、DYS439,HEX标记DYS531、DYS557、DYS448,TAMRA标记DYS456、DYS444引物,PCR复合扩增,毛细管电泳得到结果,考察扩增系统的个体识别能力、灵敏度、特异性、组织同一性。结果所建立的9个Y-STR复合扩增系统分型清晰,单倍型多样性达0.9968,特异性好,灵敏度高(0.5ngDNA),并且在男女混合斑检验上较常染色体STR分型更有优势。结论9个Y-STR复合扩增系统具有较高的识别能力,对建立Y染色体STR数据库,研究群体遗传学和进行法医学混合斑物证鉴定有重要意义。     

19个常染色体与4个Y染色体STR复合扩增体系的建立

目的建立19个常染色体STR及Amelogenin和4个Y染色体STR基因座复合扩增体系,并对其效能进行评估。方法用五色荧光标记20+4Y-STR基因座,建立同步扩增检测体系,用ABI 3130XL遗传分析仪对扩增产物进行电泳,GeneMapperID 3.2软件进行基因分型;检测体系的灵敏度、均衡性、稳定性、特异性、同一性和稳定性,并观察混合、降解及微量检材的分型情况。结果采用本文体系,DNA模板量在0.05~1.00ng时,分型准确,均衡性、特异性好;混合、降解及微量检材分型正确。该19个常染色体STR基因座的累计个人识别率大于0.999 999 999,三联体累计非父排除率达0.999 999 985,Y-STR单倍型多态性为0.592。结论本文建立的复合扩增体系分型准确,稳定,在法医学案件检验及数据库建设等方面有良好的应用前景。     

17个Y-STR位点复合扩增检测在半同胞关系鉴定中的应用

人类Y染色体STR基因座以其独特的优势在法医学实践中发挥着日益重要的作用。各种成熟的Y-STR分型试剂盒也不断被开发出来。本文结合实际案例对Yfiler商品化试剂盒进行了应用和验证。该试剂盒可以检测17个Y-STR位点并在一个管内实现复合扩增。     

湖南浏阳客家人25个Y-STR基因座遗传多态性

本文对中国湖南省浏阳市客家人聚居区小河乡253名健康无关个体25个Y-STR基因座遗传多态性进行调查,采用Goldeneye26Y试剂盒使用9700型扩增仪直接扩增DNA,扩增产物用3500XL毛细管电泳仪检测,通过观察25个基因座遗传多样性(GD值)在0.3287~0.9271之间,所使用的扩增系统25个Y-STR基因座有较好的识别能力。     

Goldeneye~(TM) DNA身份鉴定系统22NC试剂盒的法医遗传学调查

目的调查Goldeneye TM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒中所包含的21个常染色体STR基因座在汉族人群中的遗传学数据,并考察该试剂盒的法医学应用价值。方法应用Goldeneye TM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒对华东地区500名汉族健康无关个体进行常染色体STR基因座分型检测,统计分析21个常染色体STR基因座的频率数据、群体遗传学参数及连锁不平衡状况。结果 21个常染色体STR基因座在华东汉族人群中均符合Hardy-Weinberg平衡,各基因座之间相互独立。DP值均大于0.85,在群体中的CDP值为1-3.616 5×10-26,二联体累积非父排除率为1-2.786 81×10-6,三联体累积非父排除率为1-8.545 82×10-10。结论Goldeneye TM DNA身份鉴定系统22NC试剂盒中所包含的21个常染色体STR基因座在华东汉族人群中具有良好的多态性,联合Goldeneye TM DNA身份鉴定系统20A可以满足双亲皆无的全同胞鉴定要求,为该类案件的解决提供便利的工具。     

ABO基因分型与多重STR联合检测在法医学中的应用

目的建立ABO基因型和Goldeneye16A试剂盒联合检测的方法,并评价其在法医学实践中的应用价值。方法将6种ABO基因型(A/A,A/O,B/B,B/O,A/B,O/O)的序列特异性引物(PCR-SSP)检测方法与Goldeneye16A试剂盒相整合进行同步分型。通过对460份男性个体血痕样本、9947A DNA及90份案件样本进行检测,考察方法的一致性、灵敏度及对法庭科学检材的适用性。结果应用本文方法可同时检出6种ABO基因型和15个常染色体STR基因座及性别决定基因座,检测灵敏度为125pg,其中ABO基因检测灵敏度达63pg。460份男性血痕和90份案件检材证实该联合分型方法用于各类检材结果准确、稳定。结论本文ABO基因分型与多重STR联合检测方法,适用于各类含有核细胞的生物检材,在法庭科学DNA鉴定中有较好的应用前景。     

IDentifier DNA分型盒（炎黄34）的法医学验证及应用评估

目的 测试IDentifier DNA分型盒(炎黄34)的技术性能指标,评估其法医学应用价值。方法 根据《法庭科学人类荧光标记STR复合扩增检测试剂质量基本要求》(GB/T 37226—2018),从种属特异性、分型准确性、灵敏度、适应性、耐受性、一致性、均衡性、反应条件验证、混合样本、稳定性、批间差11个方面对IDentifier DNA分型盒(炎黄34)进行测试。比较IDentifier DNA分型盒(炎黄34)与Power Plex^?Fusion 6C系统、Versa Plex^?27PY系统、Veri Filer^TM Plus PCR扩增试剂盒的系统效能。使用IDentifier DNA分型盒(炎黄34)检测日常案件中的拭子类生物检材,观察其STR检验结果 。结果 IDentifier DNA分型盒(炎黄34)具有良好的种属特异性、分型准确性、适应性、耐受性和均衡性,灵敏度可达0.062 5 ng,能检测案件中不同类型的检材、降解检材及混有抑制剂的检材,对混合比例为4∶1以内的样本均能获得完整分型。该试剂盒的系统效...     

DNATyper^TM21试剂盒的法医学验证

目的测试DNATyper^TM21试剂盒的技术性能指标,评估其法医学应用价值。方法从灵敏度、种属特异性、准确性、耐受性、适应性、一致性、均衡性、混合样本、稳定性等九个方面对该试剂盒进行测试。结果DNATyper^TM21具有良好的种属特异性、准确性、适应性、均衡性和稳定性,试剂盒的灵敏度达到0.125ng,能检测案件中常见的不同类型的检材,对降解检材及抑制剂具有一定的耐受性,能检测4:1比例的混合DNA样本并得到正确分型。结论DNATyper^TM21试剂盒的性能指标达到了STR检测试剂盒的技术水平,可用于个体识别、亲权鉴定及法医遗传学分析。     

六色荧光标记快速PCR扩增体系的建立及验证

目的建立PCR快速扩增程序和体系,并对其技术指标进行验证。方法采用六色荧光标记技术,对24个常染色体STR基因座、1个Y-STR基因座和Amelogenin、Y-In Del基因座进行复合扩增及毛细管电泳检测,同时考察体系的灵敏度、特异性、同一性、稳定性、混合样本及批量样本测试,并观察各种常见检材及降解、脱落细胞检材的分型情况。结果所建立的体系灵敏度达0.062 5 ng,快速扩增仅耗时65 min就可获得准确分型;种属特异性高;各种纸质血样本和混合、降解、脱落细胞检材的分型正确。结论本研究建立的快速扩增体系可显著提升检验速率,分型准确、稳定,对建立STR数据库、研究群体遗传学和进行法医学鉴定有重要意义。     

Y—STR基因座分型缺失分析

目的分析Y—STR基因座等位基因分型缺失数据,为法医学提供应用参考。方法收集浙江汉族4477名无关男性个体血样,自动工作站磁珠法提取DNA,Y—filer^TM试剂盒进行复合扩增,Gene Mapper IDv3．2分析软件分析Y-STR数据,统计出现基因分型缺失的概率。结果在4477名无关个体的Y—STR数据中,有来自23种单倍型的26个样本Y-STR分型各有1个短片段基因座的基因分型缺失,而其它长片段基因座的分型均完全正常。基因分型缺失的发生频率为0．518％。结论Y-STR基因座分型缺失具有一定的发生率,在日常检案中应注意防止误判。     

清代遗骸Y-STR检验1例

法医学实践中经常遇到对骨骼DNA检验的案例,但对保存超过100年的骨骼样本的检验报道较少。本文成功提取到150年前土埋遗骸的骨骼DNA,采用Y—filer试剂盒在9700型扩增仪上进行扩增,3130XL型遗传分析仪进行检测,得到遗骸Y—STR分型,并与对照样本比对,确认了遗骸身份。     

荧光复合扩增4个Y染色体STR的单倍型及其法医学应用

目的建立一套Y染色体STR的双色荧光复合扩增系统,调查4个Y-STR基因座单倍型分布情况及其在混合斑物证检验中的法医学应用前景。方法荧光标记引物复合扩增Y-GATA-A10、DYS531、DYS557和DYS448四个Y染色体特异性STR基因座,并用ABⅠ310遗传分析仪对扩增产物进行检测、分型。结果在成都汉族120名无关男性个体中,四个基因座分别检出5、5、8、7个等位基因,共检出78种单倍型,单倍型基因多样性为0.9881。对3例本教研室不能用常规常染色体STR对男性成份作出同一认定的混合斑检材,该系统成功的作出了与嫌疑人血液Y-STR基因型一致的鉴定结论。结论建立的Y-STR荧光标记复合扩增系统具有很高的识别能力,对建立Y染色体STR数据库,研究群体遗传学和进行法医学混合斑物证鉴定有重要意义。     

河北秦皇岛地区汉族人群16个Y-STR基因座遗传多态性

本文对中国秦皇岛地区汉族216名健康无关男性个体进行16个Y-STR基因座复核扩增荧光检测。采用Chelex-100法提取样本DNA,用Life公司Y-filer反应试剂盒进行扩增及检测,结果在16个Y-STR基因座共检出216个单倍型,累计GD值达0.998 968,适合于单亲鉴定、混合样本的个体识别和Y-STR家系排查。     

19个常染色体与4个Y染色体STR复合扩增体系的建立

目的建立19个常染色体STR及Amelogenin和4个Y染色体STR基因座复合扩增体系,并对其效能进行评估。方法用五色荧光标记20＋4Y—STR基因座,建立同步扩增检测体系,用ABI3130XL遗传分析仪对扩增产物进行电泳,GeneMapperID3．2软件进行基因分型;检测体系的灵敏度、均衡性、稳定性、特异性、同一性和稳定性,并观察混合、降解及微量检材的分型情况。结果采用本文体系,DNA模板量在0．05～1．00ng时,分型准确,均衡性、特异性好;混合、降解及微量检材分型正确。该19个常染色体STR基因座的累计个人识别率大于0．999999999,三联体累计非父排除率达0．999999985,Y—STR单倍型多态性为0．592。结论本文建立的复合扩增体系分型准确,稳定,在法医学案件检验及数据库建设等方面有良好的应用前景。