3个miniSTR基因座四色荧光复合分型体系的构建及应用

目的建立D3S3053、D6S474、D20S482（扩增片段〈150bp）3个miniSTR基因座四色荧光复合分型体系,用于高度降解DNA样本的基因分型。方法采用6-FAM、HEX、TAMRA荧光染料标记D20S482、D3S3053、D6S474基因座上游引物,构建并优化复合扩增体系,在ABI310遗传分析仪上对扩增产物进行电泳分析,Genemapper3．2软件分析产物片段大小并进行分型。采用上述体系对120份河北汉族健康无关个体血样进行检测,并计算群体遗传学参数。比较该体系与ID试剂盒用于高度降解检材的成功率及灵敏度。结果D3S3053、D6S474、D20S4823个miniSTR基因座荧光标记复合扩增分型体系稳定可靠,灵敏度达50pg,用于高度降解检材分析的成功率明显高于ID试剂盒。3个基因座在河北汉族人群中的累积个人识别能力为0．998,累积非父排除率为0．84。结论该系统可用于分析高度降解DNA样本的基因分型,进行法医学个人识别和亲权鉴定。     

广西地区京族人群9个STR基因座遗传多态性

<正> 286例广西地区京族人群无关个体血样,采用Chelex-100的方法提取DNA,荧光标记复合扩增系统Profiler Plus Kit(ABI公司)扩增D8S1179、1321S11、D18S51、D3S1358、 VWA、 FGA、D5S818、D13S317、D7S820等9个STR基因座,ABI 377-96全自动测序仪对扩增产物进行检测,GenoTyper软件进行基因分型。统计处理所获得的数据资料,为个人识别、亲权鉴定、DNA数据库技术等法医学应用及群体遗传学、民族学提供基础资料,现报告如下。     

D8S1179基因座假变异6例

ProfilerPlus试剂盒 (ABI公司 )中的 9个STR基因座 ,是广泛应用于法医物证检验的遗传标记。本文作者在用该试剂盒进行亲子鉴定时 ,发现 6例亲子鉴定的D8S1179基因座不符合遗传规律。经用Iden tifiler”试剂盒 (ABI公司 )复检 ,证实为等位基因丢失而引起的假变异。1　案例资料6例亲子鉴定案D8S1179基因座检测结果见表 1。表 1. 6例亲子鉴定中D8S1179基因座的检测案例编号 案由 ProfilerPlus试剂盒母子父Identifiler试剂盒母子父1申请移民 1 4 ,1 4 1 3 ,1 3 1 3 ,1 3 1 4 ,1 5 1 3 ,1 5 1 3 ,1 32申请移民 1 3 ,1 3 1 5 ,1 5 1 3 ,1…     

D21S11稀有等位基因落入相邻基因座1例

正1案例1.1简要案情建立基因档案,送检血液样本一份。1.2初次检验采用Chelex-100法提取DNA,Amp FSTR~SinofilerTM试剂盒(美国AB公司)进行PCR复合扩增,扩增体系和热循环反应按试剂盒说明书进行,扩增产物在3130xl遗传分析仪(美国AB公司)电泳,Genemapper ID v3.2软件分析结果。D21S11基因座表现为纯合子,D7S820基因座显示为5/8/11三带型,     

荧光标记3个miniSTR基因座复合扩增系统的建立

目的建立扩增片段<135bp,包括D5S818,D8S1179,D16S539 3个miniSTR基因座复合扩增系统。方法采用不同荧光染料标记引物,通过PCR扩增,利用ABI 3100遗传分析仪进行片段长度分析,对100份无关个体血样,10个家系样本以及30份高度降解检材进行检测。结果本系统DNA分型结果与AmpFLSTR Identifiler试剂盒完全一致,且灵敏度高于AmpFLSTR Identifiler试剂盒。结论本系统可以应用于个人识别和亲权鉴定,为降解DNA样本分型提供了新的方法。     

D8S1179基因座等位基因“丢失”1例

作者报道1例D8S1179基因座基因丢失现象：采用ProfilerPlus试剂盒扩增系统对1例血痕D8S1179基因座进行基因分型时，等位基因16丢失；改用Identifiler试剂盒扩增系统对其进行基因分型时，等位基因16正常出现。     

Identifiler体系单基因排除的三联体亲权1例

1案例王某,男,33岁,1999年与前妻张某离婚,婚生子判由王某抚养。后王某再婚,但三年来一直没有生育,去医院检查得知自己生育能力极低,遂怀疑前妻所生之子不是自己亲生,来我处申请进行亲子鉴定。2检验分别抽取王某、张某与其子的静脉血各0.1mL,EDTA抗凝。用Chelex-100法提取上述血样的DNA,用ABI公司IdentifilerKit荧光标记复合扩增试剂盒扩增,ABI310型基因分析仪对扩增产物进行检测,Genotyperv2.5.2软件进行基因分型,所得STR基因型结果见表1。由表1可见在所检测的15个STR基因座中仅有D16S539位点孩子与王某不符合遗传关系。遂采用…     

浙江畲族人群9个STR基因座的遗传多态性

目的调查浙江畲族人群STR基因座的遗传多态性,为群体遗传学和法医学个人识别、亲子鉴定提供基础数据。方法采用AmpFlSTRProfilerPlus试剂盒(ABI公司),ABI310基因自动分析仪对浙江畲族120名无关个体血样的D3S1358、VWA、FGA、D8S1179、D21S11、D18S51、D5S818、D13S317和D7S820等9个STR基因座进行等位基因频率和基因型频率调查。结果获得浙江畲族人群9个STR基因座的基因频率分布资料,所有基因座基因型频率分布均符合Hardy—Weinberg平衡,计算得杂合度(H)0.655～0.960,个人识别率(DP)0.878～0.960,非父排除率(PE)0.363～0.677,多态信息总量(PIC)0.68～0.86。结论该9个STR基因座在浙江畲族人群中呈高度多态性,在法医学及人类遗传学研究中具有重要意义。     

新疆汉族人群6个STR基因座的遗传多态性

参照美国Promega公司Geneprint试剂盒提供的方法 ,采用CTTMultiplex和SilverSTRⅢSystem复合扩增试剂盒 ,对新疆地区汉族人群CCT系统 15 1名和STRⅢ系统 14 2名无关个体血样进行CSFIPO、TPOX、THOI、D16S5 39、D7S82 0、D13S317等 6个STR基因座的基因频率调查 ,结果如下 :新疆地区汉族人群 15 1名 (CTT系统 )及 14 2名 (STRⅢ系统 )无关个体的血样经Chelex 10 0快速提取法提取DNA ,PCR扩增 ,用标准等位基因作参照物 ,电泳分离 ,银染检测后 ,进行DNA分型和统计学分析。CSFIPO、TPOX、THOI、D16S5 39、D7S82 0…     

山西地区汉族15个STR基因座遗传多态性

10 9份山西地区无关个体血样本 (日常办案检材 ) ,Chelex 10 0法或酚 氯仿抽提法提取其样本DNA ,按Power PlexTM16荧光标记试剂盒 (Promega)说明书 ,采用 10 μl体系扩增D3S135 8、vWA、FGA、D8S1179、D2 1S11、D18S5 1、D5S818、D13S317、D7S82 0、CSF1PO、TH0 1、TPOX、PentaD、PentaE、D16S5 39共 15个STR基因座。扩增产物应用ABI310型全自动遗传分析仪检测 ,记录无关个体各基因座的基因型 ,计算 15个基因座的等位基因频率分布和对基因型分布进行 χ2 检验 ,并按文献[1,2 ] 方法分别计算等位基因的杂合度 (H)、个…     

大连地区汉族人群D2S1338和D19S433基因座的遗传多态性

<正> 采用310型DNA全自动测序仪、商品化试剂盒AmpFISTR IndentifilerTM(PE公司)复合扩增法,调查了大连地区汉族人群15个STR基因座分布频率,现将其中D2S1338和D19S433基因座多态性分析报告如下(其余13个已另作报告)。     

8个miniSTR基因座复合扩增系统的建立及其应用

目的建立扩增片段〈200bp,包含CSF1PO,TH01,TPOX,D3S1358,FGA,D7S820,D21S11,PentaD 8个miniSTR基因座的复合扩增体系。方法采用四色荧光染料标记引物,PCR扩增后,应用ABI 3130遗传分析仪进行片段长度分析,对280例无关个体,137例疑难生物物证进行了检验。结果280例无关个体的调查结果为除1例在CSF1PO基因座外,其余样本的各基因座分型结果与AmpFLSTR Identifiler试剂盒完全相同。与应用ID试剂盒比较,明显提高了137例疑难生物物证的检出率。结论该检测技术方法稳定,结果准确,重复性好,且其判型结果可进行DNA数据库查询、比对,为刑事案件及灾难事故中疑难生物物证的检验提供了一条新的途径。     

D6S1043和D12S391基因座在亲权鉴定中的应用

目的研究D6S1043和D12S391基因座在亲权关系鉴定案件中的应用价值。方法应用荧光标记复合扩增系统对日常检案中所收集的192名汉族无关个体血样DNA进行PCR扩增,用ABI3100-Avant遗传分析仪对扩增产物进行毛细管电泳,用GeneMapperv3.2软件进行基因分型,统计分析D6S1043和D12S391基因座的多态信息。结果在D6S1043和D12S391基因座分别发现12个等位基因,它们在中国汉族人群中的个体识别能力分别为0.9656和0.9510,二联体非父排除率分别为0.573和0.510,三联体非父排除率分别为0.731和0.679。结论D6S1043和D12S391基因座具有高度多态性,在亲权鉴定中具有重要应用价值。     

两个X-STR基因座变异亲子鉴定1例

1案例资料 1.1 简要案情及DNA分型检验 因申报户口,需要鉴定某男与1名女孩是否存在亲生血缘关系.采集某男、女孩以及其生母的末梢血液.用Chelex-100法提取DNA,采用Identifiler试剂盒(AB公司)进行15个常染色体STR基因座检测,并使用Investigator Argus X-12试剂盒(QIAGEN公司)进行12个X-STR基因座检测.实验操作按照使用说明书进行,在ABI 9700型基因扩增仪进行复合扩增,产物在ABI 3130基因分析仪上进行毛细管电泳,分别采用LIZ 500及BT0 550分子量标准为内标,用GeneMapper ID v3.2软件进行基因分型.     

亲子鉴定中STR基因座的基因突变分析

目的探讨Identifiler^TM荧光标记复合扩增试剂盒15个STR基因座在亲子鉴定中的基因突变特点。方法应用Identifiler^TM荧光标记复合扩增试剂盒检测676例亲子鉴定案，对其中1～2个突变基因座加做HLA等位基因检测或Y—STR基因座检测。结果在认定亲子关系的676例中，观察1304次减数分裂，Identifiler^TM荧光标记复合扩增试剂盒中的15个基因座确定19例突变，其中D18S51基因座4例，D2S1338基因座3例，D8S1179、D16S539、vWA、D7S820、D13S317基因座各2例，D5S818和TH01基因座各1例，D21S11、FGA、D3S1358、D19S433、TPOX、CSF1P0基因座未见突变；一步突变的17例，二步突变的为1例，四步突变的1例；1个基因座发生突变的18例，2个基因座同时发生基因突变的为1例；突变来自父亲与来自母亲的比例为13：2，4例来源不能确定。结论用Identifiler^TM荧光标记复合扩增试剂盒检测到1—2个基因座发生突变，须增加对其它遗传标记的检测。     

D12S391、D6S1043在西藏藏族和四川汉族人群中的遗传多态性

<正>由美国AB公司开发的华夏PCR直接扩增试剂盒已经广泛应用于全国公安机关DNA数据库的检验工作,该试剂盒是依据中国人群的遗传信息,将Identifiler试剂盒中TPOX、TH01两个STR基因座换为D12S391、D6S1043。本实验通过使用华夏PCR直接扩增试剂盒,对西藏自治区藏族人群和四川汉族人群中1079名无关个体进行STR分型,统计了D12S391、D6S1043     

广东地区汉族人群 13个 STR基因座的频率调查

目的调查广东地区汉族无关个体的 13个 STR基因座（ D3S1358、 vWA、 FGA、 D8S1179、 D21S11、 D18S51、 D5S818、 D13S317、 D7S820、 D1 6S539、 TH01、 TPOX、 CSF1PO）多态性,研究其在法医学检验中的应用价值。方法用 AmpFlSTR Profiler Plus及 Cofiler二个荧光标记系统对新鲜血样进行 13个基因座的复合扩增,用 ABI 377-96全自动测序仪对扩增产物进行检测,用 GenoTyper软件进行基因分型。结果 13个基因座 PIC >0.5,DP >0.76,家系调查符合孟德尔遗传规律。结论含有 13个 STR基因座的二个荧光标记复合扩增系统可满足法医物证学的个体识别及亲权鉴定的需要。     

引物结合区点突变致D18S51等位基因丢失

目的确定D18S51基因座是否存在等位基因缺失及其原因。方法应用多个STR试剂盒检测检材以确定D18S51基因座的等位基因缺失情况;重新设计引物对所测D18S51基因座进行单独扩增,并对缺失的等位基因进行测序。结果该案例被检个体的D18S51侧翼序列引物结合区发生突变,致等位基因丢失。结论亲权鉴定时出现不符合孟德尔遗传规律现象,应使用多个试剂盒检测验证以避免父权误判。     

广西苗族人群15个STR基因座的多态性调查

目的调查广西苗族人群无关个体的15个STR基因座(D8S1179、D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA、TPOX、D18S51、D5S818、FGA)多态性,研究其在法医学检验中的应用价值。方法应用AmpFlSTRIdentifilerTM荧光标记复合扩增系统对274例广西苗族无关个体血样DNA进行15个STR基因座的复合扩增,用ABI3100遗传分析仪对扩增产物进行检测,用GeneScan、GenoTyper软件进行基因分型,统计计算15个STR基因座的群体遗传学参数。结果IdentifilerTM荧光标记系统的15个STR基因座在广西苗族人群的累积偶合率为5.04×10-17,累积非父排除率分别为0.9999993。结论该15个STR基因座可满足广西苗族人群法医学的个体识别及亲权鉴定的需要。     

6个STR基因座在宁夏山区回族聚居区的多态性

<正> 128名无关个体血样,取自宁夏回族聚居之南部山区6县。Chelex法提取DNA,按Promega公司试剂盒操作方法进行D16S539、D7S820、D13S317、CSF1PO、TPOX、TH01等6个基因座的复合扩增,并进行聚丙烯酰胺变性胶电泳分离和银染检测,得到基因分型及各基因座等位基因频率分布(表1)。