拷贝数变异及其在法医学中的研究进展

近年来拷贝数变异的研究已逐渐延伸至各个领域,如复杂疾病病因探索、精准治疗以及遗传育种和进化等。拷贝数变异独有的遗传学特点使得人们逐渐相信其可以成为解决相关问题的生物学遗传标记。随着检测技术的发展,拷贝数变异在法医学方面的应用也将逐渐增多。本文就拷贝数变异概念与发展以及在法医学中的应用进行阐述,为今后拷贝数变异的实际应用提供新的思路。     

Sinofiler试剂盒D13S317基因座变异1例

1案例 1.1案情 为申报户口,父亲杨某与妻子和女儿来我中心,要求对杨某与女儿是否具有父女关系进行检验,分别采取三人的指尖血备检。     

性别鉴定中amelogenin基因座变异的研究进展

Amelogenin基因座变异,分为amelogenin引物结合区突变和包含amelogenin基因座的Y染色体微缺失两种类型,以后者最为常见。Amelogenin引物结合区突变的发生机制是核苷酸点突变,包含amelogenin的Y染色体微缺失的发生机制可能是非等位同源重组或者非同源末端连接。在全世界人群中,位于印度次大陆地区的印度人群、斯里兰卡人群和尼泊尔人群amelogenin变异率非常高。Amelogenin变异对生育能力和表型影响非常小,但在性别鉴定中会导致错误的性别鉴定结果。采用包含常染色体STR基因座、amelogenin基因座和多个Y-STR基因座的复合扩增试剂盒进行检测可有效避免因amelogenin变异导致的性别误判。     

昆明地区DYS570微变异与Y-SNP单倍群的关联性研究

目的探究DYS570基因座微变异与Y-SNP单倍群的关联性。方法利用AIYSNP42、AIYSNP47和Yfiler^TM Platinum试剂盒中89个Y-SNPs和34个Y-STRs对昆明地区116例在DYS570基因座发生微变异的群体进行研究,采用Set-B二代测序试剂盒检测DYS570基因座的核心重复序列,对获得的数据通过直接计数法进行统计分析,运用Network 10.2软件绘制网络图对样本遗传信息进行可视化分析。结果111例DYS570(18.3-21.3)样本的核心重复序列为TTT[TTTC]_18-21,属于O2a2b1a1a1a4-F14494亚群;1例DYS570/20.3样本的核心重复序列为[TTTC]₁₅TTC[TTTC]₅,属于O2a1b1a1a1a1e-F1365亚群;1例DYS570/17.1样本的核心重复序列为[TTTC]₁₇T,属于O2a1b1a1a1a-F11亚群;3例DYS570/19.2样本的核心重复序列为[TTTC]₃...     

浓缩DNA法结合miniSTR分型技术检验微量DNA

目的优化低拷贝数DNA STR分型方法。方法对采用磁珠法或Chelex-100法提取DNA,Identi-filer试剂盒扩增,未获得分型结果的日常检案检材,采用物理浓缩法或过柱浓缩法浓缩DNA,采用miniFilerTM试剂盒再次扩增分型。结果 127例检材中,47例磁珠法提取DNA未获得分型的样品,分型成功率为36%;80例Chelex-100法提取DNA未获分型的样品,分型成功率为30%。结论采用浓缩法和miniFilerTM试剂盒,可以提高日常检案中低拷贝数检材的STR检验分型成功率。     

全基因组扩增法应用于低拷贝数DNA检测

目的建立基于多重置换扩增(MDA)技术的全基因组扩增(WGA)方法,实现对低拷贝数(LCN)DNA样品进行分析。方法采用REPLI-g试剂盒对样本进行等温全基因组扩增,扩增产物采用ProfilerPlus试剂盒确定样本的十个STR基因座的等位基因型。结果10pgDNA模板经全基因组扩增后,能够进行DNA分型。结论全基因组扩增可以用于LCN的DNA分析,帮助提高微量物证的检出成功率。     

法医遗传学研究新进展

法医遗传学经过近30年发展,已经形成了一套系统的理论和技术体系,相关技术和方法在实际工作中发挥着重要作用。随着实际应用需求的变化和相关基础学科研究的进展,法医遗传学的研究也出现了新变化。本文针对法医遗传学领域的研究进展和发展趋势进行综述,希望能对相关研究和实践提供参考和借鉴。     

肋骨变异法医学鉴定2例

1 案例 1.1 案例1 傅某,女,59岁,因"交通事故致胸腰部外伤后肿痛伴活动不利一小时"入院.临床诊断为"胸12椎体压缩性骨折",予行保守治疗.其后行影像学复查,两次诊断为胸11椎体压缩性骨折;三次诊断为胸12椎体压缩性骨折.鉴定时查体检见,其体表未见明显伤痕,腰部活动受限;四肢肌力V级,肌张力可;神经系统生理反射存在,病理征未引出.     

2个STR基因座变异亲子鉴定1例

1案例一自称孩子父亲的男子（假设父）携孩子和孩子母亲要求进行亲子鉴定。采集指血备检。Chelex-100法提取样本基因组DNA,采用IdentifilerTM试剂盒（美国AB公司）进行STR检验．发现D5S818基因座不符合孟德尔遗传规律．     

足舟骨变异误诊骨折1例

1案例资料1.1简要案情刘某,男,24岁。2004年11月13日下午5时许因车祸受伤,到医院就诊。左足X线片示左舟状骨骨折,予以左足石膏托外固定治疗。同年11月16日,法医对刘某的损伤进行鉴定。1.2法医学检查损伤检查双上肢及右下肢活动自如,左小腿及左足石膏托功能位外固定。打开石膏托未见其左小腿及左足皮肤明显外伤,但主诉左足内侧疼痛,压之疼痛较剧烈。X线检查对其左足进行X线拍片检查,结果显示:左舟骨旁有一小骨块(照片1)。将其右足进行对比摄片,结果显示:在右舟骨旁同样有2个类圆形骨块(照片2)。CT扫描对伤者双足进行CT扫描检查,结果显示:…     

The Successful Recovery of Low Copy Number and Degraded DNA from Bones Exposed to Seawater Suitable for Generating a DNA STR Profile

A universal method allowing for DNA profiling from bones exposed to seawater has not been reported yet. This study refers on the identification of a body immersed in seawater for 8 months. The biological material for identification was the mandibular body, usually characterized by low success rates of DNA analysis. Initially, two extraction protocols were performed with negative results: one used for bones immersed in fresh water and a silica‐column procedure. A third protocol was performed, which combined the extraction of a higher amount of bone powder, the use of multi‐silica‐based extraction columns followed by a concentration step. This protocol allowed to obtain low copy number DNA and to generate a 12‐loci STR profile by combining conventional STR typing and mini‐STR technologies. This protocol could be suitable when human bones have been exposed to severe environmental conditions, and the available nuclear DNA is highly degraded and in low copy number.     

低拷贝DNA模板检验方法探讨

目的探讨扩增及检测方法对低拷贝DNA模板分型检测灵敏度的影响。方法Control DNA 9947A按比例稀释,采用IdentifilerTM和DNATyper15TM试剂扩增,循环参数设置为28和28+6个循环,平行扩增3次,分别单独检测及3次合并检测,使用310及3130分析仪检测。结果28+6个循环的基因座检出率高于28个循环;等位基因不平衡及丢失与基因座没有特异性的关联,随着DNA模板量的减少,等位基因不平衡及丢失增多;将3次扩增产物混合后检测,等位基因不平衡及丢失情况减少,分型正确率增高。结论模板DNA分3次扩增后混合检测、循环数为28+6,可提高低拷贝模板基因座的检出率。     

新一代遗传标记——InDel研究进展

法医DNA分型经历了三代遗传标记的研究,短串联重复序列(short tandem repeat,STR)作为比较成熟的工具已被广泛运用于法医生物学鉴定中。进一步对人类基因组的探索,先后发现了单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)、插入/缺失(Insertion/Deletion,InDel)等一系列遗传标记,而其中InDel作为新型的遗传标记,基本兼具各类遗传标记的优点,受到包括医学分子生物学和法医生物学在内各领域的广泛关注。本文就InDel的研究历史与相应的成果进行简单总结与回顾,以时间轴与研究目的为主要的分类指标,重点关注以多个InDel联合作为遗传标记的多重扩增系统(常染色体或X染色体)在法医生物学及人类学研究中的进展,并对今后该领域研究的方向与暨待解决的问题进行了综述。     

Analysis of Frontal Sinuses for Personal Identification in a Chinese Sample Using a New Code Number

The study of frontal sinuses for personal identification is a considered approach in the forensic field. In Yoshino's system, the frontal sinus patterns of a given person were formulated as a code number (codY) obtained by arranging the class numbers in each classification item. The aim of this work was to use a new code number (codC) with eight digits that includes other two continuous variables obtained as ratios SOR₁ (left frontal sinus area/left orbit area) and SOR₂ (right frontal sinus area/right orbit area), comparing the results with that of Yoshino. Digital radiographic images of the skulls of 150 Chinese people were analyzed. Spearman's partial correlation coefficients were evaluated between variables characterizing frontal sinus patterns. We used a maximum-weight dependence tree for statistical analysis. Results demonstrated that codC significantly reduced the probability of having the same personal code number compared with codY. Our scientific approach results valid for personal identification purposes.     

DNA甲基化在法医学中的应用前景及其检测方法新进展

DNA甲基化是一种重要的表观遗传标记。新近的一些研究表明,DNA甲基化在二联体亲权鉴定、同卵双生子法医学个体甄别等案例中可能具有一定的应用前景,可作为STR或SNP等经典遗传标记的有益补充。目前基于甲基化敏感的限制性核酸内切酶、重亚硫酸盐转化以及甲基化CpG结合蛋白等原理已建立了一系列的DNA甲基化检测方法。甲基化敏感的单核苷酸引物延伸、实时荧光PCR、甲基化特异性PCR、甲基化特异性多重连接反应依赖性探针扩增、光纤微珠芯片等位点特异性DNA甲基化检测方法都可用于已知CpG位点甲基化状态的检测并可能在法医学实验室具有一定的应用前景;AIMS、HELP、COMPARE-MS等通过对基因组范围内的DNA甲基化扫描分析,可发现具有潜在法医学应用价值的DNA甲基化位点。     

表观遗传学及其在同卵双生子研究中的新进展

表观遗传学是指不改变DNA序列的可遗传的基因表达改变.是多细胞真核生物的重要生物学现象.DNA甲基化、基因组印记、组蛋白乙酰化、组蛋白甲基化、染色质重塑、假基因和小分子RNA等是表观遗传学的主要研究内容.同卵双生子(monozygotic twins,MZ)是由一个受精卵分裂发育而成的双胞胎,二者具有完全相同的基因组DNA序列.从经典遗传学的角度,使用短串联重复序列(short tandem repeat,sTR)和单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)等遗传标记均不能对其进行有效的个体甄别.因此,寻找新的遗传标记显得尤为重要,最新表观遗传学领域的研究成果表明.MZ个体间DNA甲基化差异显著,这为甄别MZ个体提供了新的策略.本文对表观遗传学的概念、研究内容及表观遗传学在MZ鉴别中的应用前景进行了综述.     

烧毁复印纸的提取、显现方法研究

目的建立科学的提取、显现烧毁复印纸的方法。方法制备烧毁复印纸,对比喷雾法、气熏法、涂刷法、水漂法、发胶喷雾法对烧毁复印纸的摊平软化效果;对比夹板固定法和胶带粘取法对烧毁复印纸的固定效果;对比光学检验法、化学显现法对烧毁复印纸文件的显现效果。结果喷雾法摊平软化效果整体上优于其他方法;夹板固定法可适用于大多数烧毁复印纸文件,胶带粘取法适用于打印类复印纸文件;光学检验可以显现出黑笔、蓝笔、红笔、2B铅笔字迹以及指印,化学显现可以更清晰地显现出黑笔、2B铅笔字迹。结论当烧毁复印纸烧毁程度不明确时,摊平软化可选用喷雾法;当烧毁复印纸内容需进一步检验时,固定优选用夹板固定法;显现烧毁复印纸应根据不同显现客体采取合适的方法。