太原地区汉族人群3个STR基因座的多态性分析

短串联重复序列 (ＳＴＲ)属微卫星ＤＮＡ ,在人类基因组中广泛分布。具有ＶＮＴＲ序列特征的ＳＴＲ基因座已成为一类重要的遗传标记。ＳＴＲ基因座多态片段长度小 ,ＰＣＲ扩增成功率高 ,尤其对ＳＴＲ基因座进行复合扩增使单次扩增获得多基因座的信息量 ,简单 ,快速得到分型结果 ,在法医鉴定中具有重要的意义[1] 。应用复合扩增方法调查了太原地区汉族人群 3个ＳＴＲ即Ｄ16Ｓ539、Ｄ7Ｓ82 0和Ｐ13Ｓ317基因座的基因频率分布 ,获得了 3个ＳＴＲ多态性基因座的遗传学数据。1　材料方法1 1　实验材料1 1 1　样本　 10 1例ＥＤＴＡ抗凝血来自无亲…     

D2S1338和D19S433基因座的多态性及其法医学应用

为了寻找在法医学上更有应用价值 ,且适用于国内外实验室交流的ＳＴＲ标记系统 ,本文作者应用ＰＣＲ复合扩增和四色荧光技术对Ｄ2Ｓ1338和Ｄ19Ｓ4 33基因座进行了研究 ,并初步将其运用于法医学检验。现将结果报道如下。1　材料与方法1 1　样本收集 160名华东地区汉族无关个体血样 ,制成血斑纱布 ,用于频率调查 ;5 0个两代家系血样 ,用于家系调查 ;及本室近期收检的 90例亲子鉴定和 7例个体识别案生物学检材 ,用于案例检验。1 2　方法用Ｃｈｅｌｅｘ法提取血样ＤＮＡ ,扩增用ＰＥＡｍＰＦ1ＳＴＲＳＧＭＰｌｕｓ试剂盒 (方法见说明书 )。ＰＣ…     

荧光标记复合扩增对中国汉族群体8个STR基因座的多态性

应用ＳＴＲ复合扩增技术对ＦＢＩ推荐的 8个ＳＴＲ基因座 ,即Ｄ5Ｓ818,Ｄ13Ｓ317,Ｄ7Ｓ82 0 ,Ｄ16Ｓ539,ｖＷＡ ,ＴＨ0 1,ＴＰＯＸ ,ＣＳＦ1ＰＯ ,进行荧光复合扩增 ,其产物经ＡＢＩ377ＸＬ序列分析仪检测 ,对 110名中国汉人无关个体进行频率调查 ,为大规模ＤＮＡ数据库的建立提供有益探索。1　材料和方法1 1　实验材料无关个体血样来自本室日常检案积累 ;扩增及检测试剂购自美国ＰＲＯＭＥＧＡ公司 ;ＡＢＩ377ＸＬ序列分析仪。1 2　实验方法〔1、2〕　1 2 1　ＤＮＡ模板的制备　 5%ｃｈｅｌｅｘ10 0 (Ｂｉｏ ｒａｄ)2 0 0ｍｌ处理 ,56℃孵…     

哈尔滨(地区)人群CSF1 PO-TPOX-TH01基因座的基因频率调查

参照美国Ｐｒｏｍｅｇａ公司的方法 ,复合扩增ＣＳＦ1ＰＯ、ＴＰＯＸ、ＴＨ0 1基因座 ,并对 3个基因座的基因频率分布进行调查。1　材料和方法1 1　材料血样取自哈尔滨 (地区 )人群的无关个体。采耳血制成干血纱。1 2　方法1 2 1　引物　Ｐｒｏｍｅｇａ公司的ＣＴＴ复合扩增系统试剂盒提供。1 2 2　ＤＮＡ提取　用Ｃｈｅｌｅｘ〔1〕方法提取血纱ＤＮＡ。1 2 3　ＰＣＲ复合扩增　采用ＧｅｎｅｐｒｉｎｔＳＴＲｓｙｓｔｅｍＣＴＴ试剂盒 (ＰｒｏｍｅｇａＵＳＡ ) :2 5μｌ 10×ｂｕｆｆｅｒ(10ｍｍｏｌ/ＬＴｒｉｓ ＨＣｌｐＨ9 0 ,50 0ｍ…     

中国汉族人群D2S1328基因座的遗传多态性研究

采用ＰＣＲ和ＰＡＧ垂直电泳技术 ,对中国河北180名汉族无关个体和 10个家系进行调查 ,获得汉族人群Ｄ2Ｓ132 8基因座群体遗传学数据 ,现将结果报告如下。1　材料与方法1 1　血样180名汉族无关个体的ＥＤＴＡ抗凝血由河北省中心血站提供。 10个家系二代人 30份血样由河北省人民医院提供。1 2　引物Ｄ2Ｓ132 8特异性寡核苷酸引物 ,由上海生物工程公司合成。引物的序列为 5′ ＴＧＧＣＡＣＡＴＧＴＡＣＡＣＣＡＧＡＡＣ 3′和 5′ ＧＴＧＧＣＴＴＴＧＧＡＧＧＡＡＣＡＣＴＡ 3′。1 3　ＤＮＡ提取根据文献 [1]的方法有所改进。ＰＣＲ扩增体系 …     

中国黎族人群13个STR基因座的多态性调查

应用四色荧光标记引物复合扩增技术 ,对 2 13名黎族无关个体的 13个ＳＴＲ基因座进行分型研究 ,计算中国黎族 13个ＳＴＲ基因座的基因频率 ,统计分析各基因座的杂合度 (Ｈ)、多态信息总量 (ＰＩＣ)、个体识别机率 (Ｄｐ)及累积个体识别率、累积非父排除率。1　材料和方法1 1　材料黎族无关个体血样 2 13份 ,取自海南省琼中黎族自治县、陵水黎族自治县等黎族居住地。抽取静脉血液涂布于滤纸上 ,阴干保存。1 2　方法1 2 1　ＤＮＡ提取　所有检材均应用Ｃｈｅｌｅｘ 10 0法提取ＤＮＡ。1 2 2　ＰＣＲ试剂　用ＡＢＩ公司Ｐｒｏｆｉｌｅｒ Ｐｌ…     

武汉汉族人群D14S608、D16S3253、D21S1437基因座多态性

利用ＰＣＲ和ＰＡＧＥ技术 ,对武地区汉族人群Ｄ14Ｓ60 8、Ｄ16Ｓ3 2 5 3、Ｄ2 1Ｓ14 3 73个ＳＴＲ基因座进行调查。2 80例武汉地区汉族无关个体抗凝血样取自同济医院血库。ＤＮＡ提取、ＰＣＲ扩增产物检测 ,基因型命名及群体数据参照杨庆恩方法[1] ,3个ＳＴＲ基本特征和其引物参数文献[2 ] 。武汉汉族人群Ｄ 14Ｓ60 8、Ｄ 16Ｓ3 2 5 3和Ｄ2 1Ｓ14 3 7等位基因频率分布见表 1。Ｄ14Ｓ60 8、Ｄ16Ｓ3 2 5 3和Ｄ2 1Ｓ14 3 7基因座Ｈ、ＤＰ、Ｐｍ和ＰＩＣ值见表 2。　　为了从众多的ＳＴＲ位点中筛选出频率更好、分型稳定的ＳＴＲ基因座。选取了…     

贵州汉族人群6个STR基因座的多态性

参照美国Ｐｒｏｍｅｇａ公司的方法 ,应用ＳＴＲ复合扩增技术对 6个ＳＴＲ基因座 ,即ＣＳＦ1ＰＯ、ＴＰＯＸ、ＴＨ0 1、Ｄ7Ｓ82 0、Ｄ16Ｓ5 39、Ｄ13Ｓ317的基因频率分布进行调查 ,以获得贵州汉族人群的多态性资料 ,为实际检案提供参考数据。对贵州 (地区 ) 10 8份汉族无关个体的血样 ,用Ｃｈｅｌｅｘ 10 0法提取ＤＮＡ ,按Ｐｒｏｍｅｇａ公司试剂盒操作手册进行上述6个基因座的复合扩增。经ＤＮＡ分型和统计学分析 ,10 8份检材 6个基因座的累计个人识别率为 :0 99999887。所有基因座经 χ2检验 ,符合Ｈａｒｄｙ Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡。本…     

法医常染色体STR分型

短串联重复序列 (ＳＴＲ)是广泛存在于人类基因组中的一类具有长度多态性的ＤＮＡ序列。它由 2～ 6个碱基对构成核心序列 ,呈串联重复排列 ,其长度多态性主要由核心序列拷贝数目的变化而产生。一般认为 ,人类基因组平均每 6～ 10ｋｂ就有 1个ＳＴＲ基因座 ,为法医个人识别和亲子鉴定提供了高信息基因座的丰富来源。与限制性片段长度多态性产生的ＤＮＡ指纹相比 ,用聚合酶链反应技术 (ＰＣＲ)扩增ＳＴＲ基因座产生的ＤＮＡ纹印具有更高的灵敏度。ＳＴＲ扩增片段较短 (10 0～ 30 0ｂｐ) ,对于常见含部分降解ＤＮＡ的陈旧斑痕 ,ＰＣＲ扩增ＳＴ…     

广西壮族人群2个Y-STR基因座多态性研究

1999年Ｗｈｉｔｅ等[1] 报道了 7个Ｙ ＳＴＲ基因座 ,其核心重复序列均为ＧＡＴＡ。本文作者对其中Ａ10、Ａ7 1两个基因座在中国壮族人群中的分布频率进行了调查 ,报告如下。1　材料及方法1 1　样品及其ＤＮＡ提取来源于广西壮族无关男性个体血斑 10 0份 ,4℃低温保存。采用Ｃｈｅｌｅｘ 10 0快速提取法[2 ] 。离心后4℃低温保存。1 2　引物合成与标记根据文献 [1]。由上海生物工程公司合成如下引物序列。Ａ10和Ａ7 1引物的 5′端用ＦＡＭ标记。1 3　ＰＣＲ扩增及其产物检测10 μｌ反应体系 ,包括 10×ＰＥＢｕｆｆｅｒⅡ (Ｐｅｒｋｉｎ Ｅ…     

甘肃裕固族人群21个STR基因座的遗传多态性

正短串联重复序列(STR)在人类基因组中分布广泛、多态性高、可复合扩增,已被广泛应用于亲权鉴定、个人识别以及种族识别。由于同一STR遗传标记在不同人群中的多态性分布存在差异,因此,应用于法医学鉴定前,必须通过群体调查获得该群体的基本遗传学参数[1]。本研究对甘肃省肃南裕固族自治县裕固族无关个体的血样进行21个STR基因座的复合扩增,获得该群体21个STR基因座的遗传多态信息,     

闽南地区汉族人群12个Y-STR基因座遗传多态性

近年来,Y染色体短串联重复序列作为常用的Y染色体特异性遗传标记在法医学个人识别和亲子鉴定以及人类进化研究中具有独特的作用[1,2]。本文调查了闽南地区汉族人群109名无关男性个体12个Y-STR基因座,现报道如下。1材料与方法1.1样本109份无关男性个体,血样采自调查证实3代以上居住于福建省安溪县与南安市的汉族群体。1.2 DNA提取常规chelex-100快速提取法或盐析法提取基因组DNA。1.3 PCR复合扩增采用PowerPlex Y System试剂盒(美国Promega公司),总反应体系为10μl,其中Gold STR 10×Buffer1μl,PowerPlex Y 10×Primer PairM i…     

广西壮汉群体3个STR基因座的遗传多态性

ＳＴＲ广泛存在于人类基因组中。其多态性好 ,易于扩增 ,且扩增片段短 ( 10 0～ 50 0ｂｐ) ,多个ＳＴＲ基因座的联合使用完全能达到同一认定[1、2 ] 。国内有关Ｄ16Ｓ539、Ｄ7Ｓ82 0、Ｄ13Ｓ317基因座的人群调查资料相对较少。本文作者对上述基因座在广西壮、汉群体中的遗传多态性进行了研究。1　材料与方法1 1　群体及家系样本广西地区壮、汉人群无关个体的橼酸钠抗凝血分别采自广西壮族自区崇左县的壮族农民自愿者、南宁市某中学的汉族学生自愿者 ;2个三代家系 ( 1个三代5人和 1个三代 7人 ) ;30例经其它ＤＮＡ技术检测确定亲生关系 (ＲＣ…     

北京地区汉族人群SE33基因座遗传多态性

SE33基因座是短串联重复序列STR基因座,位于人类6号染色体长臂,核心序列为AAAG,片段大小在203~333之间。本文对北京地区汉族人群206例无关个体的血样进行SE33基因座多态性调查,现报道如下。1材料和方法206份北京地区汉族无关个体血样。Chelex-100法提取DNA;PowerPlex SE33基因座扩增试剂盒(Promega,美国)(详见试剂盒说明)、9700基因扩增仪扩增;产物用AB I 3100基因分析仪进行分离和检测;Genescan和Genetyper软件进行结果分析。运用统计学计算通用公式[1]进行统计学分析。2结果和讨论206例无关个体的SE33基因座分型结果见表1。表1…     

河南地区汉族群体9个STR基因座的频率分布调查

应用ＰＣＲ技术 ,对 9个ＳＴＲ基因座分三组 (Ⅰ组 :ＣＳＦ1ＰＯ ,ＴＰＯＸ ,ＴＨ0 1;Ⅱ组Ｆ13Ａ0 1,ＦＥＳＦＰＳ ,ｖＷＡ ;Ⅲ :Ｄ16Ｓ539.Ｄ7Ｓ82 0 ,Ｄ13Ｓ317)进行复合扩增 ,对河南地区汉族 10 0例无关个体血样ＤＮＡ进行群体调查 ,得到 9个基因座的基因频率。计算出各基因座及 9个基因座综合的杂合度 (Ｈ)、多态性信息总量(ＰＩＣ)、鉴别机率 (Ｄｐ)、匹配概率 (Ｐｍ)和非父排除率 (ＰＥ) ,并在常规的办案中应用三组 9个ＳＴＲ基因座对各类案件进行检验 ,结果报告如下。1　结果与讨论9个基因座的分型结果经 χ2 检验 ,均符合Ｈａｒｄｙ…     

盐城地区汉族人群15个STR基因座的遗传多态性

本文利用复合STR技术,应用PowerPlex(16System试剂盒对213名盐城地区汉族无关个体进行15个基因座的遗传多态性调查。现报道如下:1材料与方法213名盐城地区汉族无关个体血样,全部为本实验室办案积累。chelex法[1]或硅珠法[2]提取血样DNA,应用PowerPlex(16System试剂盒复合扩增,扩增体系10μl,热循环参数和电泳体系各组份配比按试剂盒所附操作手册设置。主要仪器:ABI9700扩增仪、ABI3100-Avant基因分析仪。对基因型数据作χ2检验。利用PowerStats分析软件对群体数据进行处理,得到15个STR基因座的杂合度(H)、个体识别能力(DP值)、偶…     

浙江汉族人群9个STR基因座的遗传多态性调查

利用四色荧光标记复合扩增的方法 ,在同一反应管内复合扩增Ｄ3Ｓ1358、ｖＷＡ、ＦＧＡ、Ｄ8Ｓ1179、Ｄ2 1Ｓ11、Ｄ18Ｓ51、Ｄ5Ｓ818、Ｄ13Ｓ317及Ｄ7Ｓ82 0九个ＳＴＲ基因座。扩增产物用ＡＢＩ310型基因分析仪进行毛细管电泳分离 ,自动荧光检测予以分型。经对2 0 0名浙江汉族无关个体进行群体遗传学调查 ,获得该 9个ＳＴＲ基因座的频率分布 ,以及各基因座的杂合度 (Ｈ)、个人识别能力 (ＤＰ)、偶合率 (ＰＭ)、非父排除率 (ＥＰＰ)和多态性信息总量 (ＰＩＣ)等群体遗传学参数 ,为法医学应用提供理论依据 ,现报告如下。1　材料与方法1 1　实验…     

三个STR位点复合扩增多态性及法医学应用

STR（shorttandemrepeat），即短串重复序列，广泛存在于人类基因组中，平均每15kb就存在一个STR位点，为法医个体识别和亲子鉴定提供了丰富的遗传标记[1,2]。复合扩增多个多态片段长度不重叠STR位点，可以节约检材，提高单次PCR扩增的信息量。现将我们对三个STR位点（HHUMCSFIPO[AGAT]a，HUMT－POX[AATG]a，HUMTH01[AATG]a）复合扩增分型的研究以及在法医学中应用报道如下。材料和方法一、实验材料无关个体血样取自北京地区汉族个体，家系取自北京郊区两家庭，血痕、混合斑、毛发等为实验室积累，同一个体不同组织脏器…     

山东沂源县汉族人群18个STR基因座遗传多态性

正本文应用DNA TyperTM15 plus试剂盒(公安部物证鉴定中心)对山东省沂源县1012名汉族无关个体18个STR基因座遗传多态性进行调查,为法医学及相关研究与实践提供遗传学资料。1材料与方法1012名常住沂源县汉族无关个体血样(男性741例,女性271例)均系本实验室日常工作积累。采用DNA TyperTM15 plus试剂盒10μL反应体系免提取直接扩增[1]。扩增产物应用ABI 3500基因分析仪检     

浙江汉族人群15个STR基因座遗传多态性

本文应用PowerPlex 16荧光标记复合扩增系统,对浙江汉族510名无关个体15个STR基因座进行遗传学调查,现报道如下:1材料与方法1.1样本510名浙江汉族无关个体的血样来自浙江全省各地,系本实验室日常检案积累。1.2实验方法所有血样均采用硅珠法提取DNA[1]。参照文献[2]采用10μl扩增反应体系,其中包括:Gold STR 10×Buffer 1μl,Taq Gold DNA聚合酶0.3μl,10×Primer PairM ix 1μl,模板DNA 1μl(DNA量控制在0.5~1ng),用无菌去离子水补足体系,混匀,稍加离心后置AB I 9700型扩增仪中进行扩增。热循环参数为:95℃11m in,96℃1m in,然…