安徽汉族人群11个Y-STR基因座遗传多态性

本文采用Promega公司PowerPlex(Y系统,对安徽地区255名汉族无关男性个体11个Y-STR基因座遗传多态性进行了调查,现报道如下。1材料与方法1.1样本255名安徽汉族无关男性个体的血样/口腔擦拭物等,来自合肥市红十字会中心血站和本实验室日常检案积累。1.2方法采用Chelex-100法[1]提取DNA,10μl扩增反应体系,在9700型扩增仪上进行扩增,扩增产物用AB I 3100型基因分析仪检测。1.3数据分析各基因座等位基因与单倍型检出频率采用直接计数法,等位基因多样性及单倍型多样性GD值按公式GD=n(1-∑Pi2)/(n-1)计算[2]。n为检测的样本数,Pi为第i个…     

福建汉族人群17个Y-STR基因座遗传多态性调查

本文应用PCR技术对福建汉族189名无关男性的血样进行Yfiler^TM17个STR基因座遗传多态性调查，现报道如下。1材料与方法 1．1实验方法 福建省各地189名汉族男性无关个体的血样，系本实验室日常检案积累。Chelex-100法提取DNA；采用12．5μl扩增反应体系翻；热循环参数参照PowerPlex Y System试剂盒推荐方法。     

浙江汉族人群15个STR基因座遗传多态性

本文应用PowerPlex 16荧光标记复合扩增系统,对浙江汉族510名无关个体15个STR基因座进行遗传学调查,现报道如下:1材料与方法1.1样本510名浙江汉族无关个体的血样来自浙江全省各地,系本实验室日常检案积累。1.2实验方法所有血样均采用硅珠法提取DNA[1]。参照文献[2]采用10μl扩增反应体系,其中包括:Gold STR 10×Buffer 1μl,Taq Gold DNA聚合酶0.3μl,10×Primer PairM ix 1μl,模板DNA 1μl(DNA量控制在0.5~1ng),用无菌去离子水补足体系,混匀,稍加离心后置AB I 9700型扩增仪中进行扩增。热循环参数为:95℃11m in,96℃1m in,然…     

闽南地区汉族人群12个Y-STR基因座遗传多态性

近年来,Y染色体短串联重复序列作为常用的Y染色体特异性遗传标记在法医学个人识别和亲子鉴定以及人类进化研究中具有独特的作用[1,2]。本文调查了闽南地区汉族人群109名无关男性个体12个Y-STR基因座,现报道如下。1材料与方法1.1样本109份无关男性个体,血样采自调查证实3代以上居住于福建省安溪县与南安市的汉族群体。1.2 DNA提取常规chelex-100快速提取法或盐析法提取基因组DNA。1.3 PCR复合扩增采用PowerPlex Y System试剂盒(美国Promega公司),总反应体系为10μl,其中Gold STR 10×Buffer1μl,PowerPlex Y 10×Primer PairM i…     

山东沂源县汉族人群18个STR基因座遗传多态性

正本文应用DNA TyperTM15 plus试剂盒(公安部物证鉴定中心)对山东省沂源县1012名汉族无关个体18个STR基因座遗传多态性进行调查,为法医学及相关研究与实践提供遗传学资料。1材料与方法1012名常住沂源县汉族无关个体血样(男性741例,女性271例)均系本实验室日常工作积累。采用DNA TyperTM15 plus试剂盒10μL反应体系免提取直接扩增[1]。扩增产物应用ABI 3500基因分析仪检     

盐城地区汉族人群15个STR基因座的遗传多态性

本文利用复合STR技术,应用PowerPlex(16System试剂盒对213名盐城地区汉族无关个体进行15个基因座的遗传多态性调查。现报道如下:1材料与方法213名盐城地区汉族无关个体血样,全部为本实验室办案积累。chelex法[1]或硅珠法[2]提取血样DNA,应用PowerPlex(16System试剂盒复合扩增,扩增体系10μl,热循环参数和电泳体系各组份配比按试剂盒所附操作手册设置。主要仪器:ABI9700扩增仪、ABI3100-Avant基因分析仪。对基因型数据作χ2检验。利用PowerStats分析软件对群体数据进行处理,得到15个STR基因座的杂合度(H)、个体识别能力(DP值)、偶…     

5个Y-STR基因座复合扩增及其单倍型

多个Y STR基因座复合扩增在国内外已得到应用[1、2 ] 。本文作者报道用银染法复合扩增DYS389II、DYS389I、DYS390、GATA A7 2和DYS393等 5个Y STR基因座 ,并对广东汉族 4 15名无关男性个体进行基因分型调查。1　材料和方法1 1　材料4 15份广东汉族无关男性个体血样来自本室日常检案标本 ,用Chelex 10 0法提取DNA。1 2　引物序列DYS389Ⅱ、DYS389Ⅰ、DYS390、GATA A7 2和DYS393等 5个基因座引物序列见文献 [3、 4 ],由上海生物工程有限公司合成。1 3　PCR扩增条件总体积 2 5 μl,内含dNTP 4 2 0 μmol/L ,MgCl23 0mm…     

闽南地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性调查

本文通过对中国闽南地区汉族15个STR基因座遗传多态性的研究,旨在获得该地区人群的基因频率等遗传学数据,为完善我国STR基因数据库,广泛开展人类群体遗传学及法医个体识别等研究提供基础资料。1材料和方法1.1样本122份无关个体EDTA抗凝血样本采自调查证实三代以上居住于福建省安溪县与南安市的汉族群体,其中男性90例、女性32例。血样本用EP管分装,-30℃冰冻保存。1.2DNA提取及定量取血样3.5μl,常规Chelex-100法[1]提取DNA,溴化乙锭荧光法[2]测DNA含量。1.3PCR复合扩增采用AmpFLSTRIdentifilerPCR扩增试剂盒(美国ABI公司),…     

中国汉族人群2个高变MVR基因座遗传多态性

常染色体小卫星基因座D16S309(MS205)位于16p13.3(AE006466)[1],核心序列为45~54bp,重复次数8~87次[2]。D2S44(YNH24)基因座位于2q21.3-q22(AJ001534)[3],核心序列为31bp。本文采用MVR-PCR技术,选择重复单位3′侧翼区引物(公共引物)和MVR特异性引物匹配进行PCR扩增,对中国河北汉族人群2个基因座遗传多态性进行了调查。1材料与方法1.1样本及DNA提取116份枸橼酸钠抗凝血样由河北省血液中心提供,采自无血缘关系汉族健康个体。常规饱和酚-氯仿法提取DNA。1.2MVR-PCRD16S309引物序列参见文献[2,4]。反应体系为25μl,分别加入5μl…     

南京汉族人群24个Y-STR基因座的遗传多态性

目的调查DYS391等24个Y-STR基因座在南京汉族人群的遗传多态性,考察其在法医学中的应用价值。方法应用AGCU Y-PLUS(24)PCR试剂盒对南京580名汉族无关男性个体进行Y-STR基因座扩增检测分型,用软件计算24个基因座的基因频率等群体遗传学参数,并与湖北、辽宁、广东、北京、成都汉族人群数据进行比较。结果南京580名汉族无关男性个体在24个Y-STR基因座共发现580种单倍型,各基因座的基因多样性(GD)为0.294 6~0.939 8,单倍型多样性(HD)为0.983 7。六地人群GD值的差异有统计学意义。结论 DYS391等24个Y-STR基因座在南京地区有法医学价值,可用于案件检验及家系排查。     

河北汉族人群X染色体3个STR基因座遗传多态性

本文调查了X染色体3个STR基因座在河北汉族人群中的遗传多态性,现报道如下。1材料与方法1.1材料血液样本来自河北汉族无关个体,男114名,女118名。1.2方法血液样本用酚-氯仿法提取DNA。3个基因座的引物序列参照基因组数据库(www.gdb.org),由北京赛百盛生物工程有限公司合成。扩增采用20μl反应体系,其中包括:10×buffer 2.0μl,DXS6801、DXS7424、DXS9902引物浓度分别为1pmol/μl、0.5pmol/μl、1pmol/μl,模板20ng,25mmol/L MgC l21.2μl~1.6μl,TaqDNA聚合酶1U,10mmmol/L dNTP 0.2~0.4μl。热循环参数参考Edelmann等[1,2]人的…     

河南汉族人群16个Y-STR基因座遗传多态性

<正>1材料与方法采集208名河南汉族无关男性个体的血样,用Chelex-100法提取。采用Yfiler试剂盒(美国AB公司)对16个Y-STR基因座进行PCR扩增。PCR产物在3130XL型遗传分析仪(美国AB公司)上进行毛细管电泳,GeneMapper ID v3.2软件进行基因分型。等位基因频率用直接计数法。基因多样性(gene diversity,GD)按照公式GD=n(1-ΣPi2)/(n-1)[1]计算,其中n为检测的样本数,Pi为第i个等位基因的频率。     

海南黎族群体14个STR基因座遗传多态性

STR基因座是建立DNA数据库首选遗传标记,建库需要针对目标人群做了大量的基因频率调查,本文作者应用公安部物证鉴定中心研发的DNATyperTM15试剂盒,对345个海南黎族无关个体14个基因座进行了调查。1材料与方法样本345份无关个体血样取自看守所内在押海南黎族人,采指尖末梢静脉血滴于滤纸上,阴干保存。DNA提取全部345份检材均选用Chelex-100法提取DNA[1]。复合扩增应用公安部物证鉴定中心研发的DNATyperTM15试剂盒,对14基因座进行复合PCR扩增。扩增体系为B ffer 2.0μl,10×primer 1.0μl,Taq酶0.2μl,灭菌水5.8μl,模板DNA 1.0…     

武汉汉族人群MICA基因第5外显子STR遗传多态性

本文对武汉汉族群体M ICA-STR基因座遗传多态性进行了调查,现报道如下。1材料与方法1.1样品武汉地区235例汉族无关健康个体EDTA抗凝血由武汉同济医院血库提供。所有样品采用Chelex-100法提取DNA[1]。1.2引物M ICA-STR分型采用M izuki等[2]报道的引物,其中上游引物5′端用6-FAM荧光染料标记,由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。1.3 PCR扩增及产物检测M ICA-STR扩增反应总体积为10μl,内含200μmol/L dNTPs,50mmol/L KC l,10mmol/L Tris-HC l(pH8.3),1.5mmol/LMgCl2,5~10ng模板DNA,0.2μmol/L每条引物,0.5U Ampl…     

山西汉族人群DYS460基因座遗传多态性

本文对山西地区汉族群体的DYS460基因座遗传多态性进行了调查,现报道如下。1材料与方法1.1样品100名无关男性个体和20名女性个体来自山西汉族人群,取外周血1ml,用EDTA抗凝,DNA提取采用TKM法[1]并做相应调整:TKM破坏红细胞,白细胞用2×蛋白酶K消化液(20 mmol/L Tris-HCl,pH7.6;20 mmol/L EDTA,pH8.0;300 mmol/L NaCl;1%SDS)和蛋白酶K(100μg/ml)55℃水浴3~5h。酚-氯仿抽提,无水乙醇沉淀,最后溶于无菌去离子水中。1.2方法引物引物序列参照基因库GDB,由大连TaKa-La公司合成。PCR扩增及电泳检测50μl反应体系,含50~100ng基因…     

辽宁地区汉族群体4个STR基因座遗传多态性

<正>本文在对辽宁地区汉族无关个体17个STR基因座遗传多态性数据进行报道[1]的基础上,补充对Pental D、Penta E、D10S1248、D2S441 4个STR基因座遗传多态性进行调查,为法医学相关研究和应用提供参考数据。1材料与方法1.1样本及DNA提取1 663份辽宁地区无关汉族健康个体血斑,均系本实验室日常受理案件积累。1.2 PCR扩增、电泳与分型     

江苏金湖汉族16个Y-STR基因座遗传多态性

本文对中国江苏省金湖县汉族342名健康无关个体16个Y–STR基因座遗传多态性进行调查,采用Y-filer TM试剂盒提取DNA,用9700型扩增仪进行PCR扩增和检测,通过观察16个基因座遗传多样性(GD值)在0.396 9~0.963 8之间。群体遗传矩阵分析显示,金湖汉族与河北汉族的遗传距离最小;不同民族间比较发现,与回族的遗传距离最小。     

江苏地区汉族人群15个STR基因座频率调查

采用五色荧光标记引物复合扩增技术 ,对江苏地区 12 0名汉族无关个体进行了 15个STR基因座的基因分型 ,旨在为法医学应用提供基础资料。1　材料和方法12 0例无关汉族个体的血样均系本实验室日常检案积累 ;所有样本的DNA均用硅珠法[2 ] 或Chelex[1]法提取后 ,参照AmpF1STRIdentifiler试剂盒 (PE公司 )及ABI310型遗传分析仪的使用说明书进行扩增和检测 ,并分别计算 15个基因座的基因频率、杂合度(H)、个体识别率 (Dp)及多态信息量 (PIC)。2　结果和讨论12 0例无关个体的 15个STR基因座的等位基因频率见表 1。对每个基因座进行 χ2 …     

30个Y-STR基因座在中国汉族人群中的多态性与突变

目的调查30个Y-STR基因座在中国汉族男性人群中的遗传多态性和突变情况,研究其法医学应用效能。方法应用自行建立的30个Y-STR基因座检测系统对中国汉族人群1 005名男性无关个体和1 008对父子(1 949人)的血样进行Y-STR分型,统计各基因座的群体遗传学参数与突变情况。结果1 005名中国汉族男性无关个体共检出983种单倍型,其中963种仅检出1次,总体单倍型多样性(HD)和识别能力(DC)分别为0.999 955和0.978 109。30个Y-STR基因座共检出340个等位基因,基因多样性(GD)为0.410 3~0.952 3,24个基因座GD值大于0.6。1 008对父子共有30 269次等位基因传递,68对父子仅1个基因座发生突变,3对父子的突变同时发生在2个基因座上。在71对父子间涉及的26个基因座中观察到74次突变,平均突变率为2.4×10~(-3)[95%CI为(1.9×10~(-3),3.1×10~(-3))],其中一步突变73次(98.6%),两步突变1次(1.4%)。结论该30个Y-STR基因座复合扩增体系在中国汉族男性人群中具有较高的遗传多态性及较低的突变率,在Y-STR数据库建设和群体遗传学研究中具有重要价值。     

天津汉族人群12个Y-STR基因座的遗传多态性

目的　建立天津汉族 2 10名无关男性人群 12个Y STR基因座单倍型分布基础遗传数据库。探讨其法医学应用价值。方法　应用PowerPlex YSystem (PromegeCorporation ,USA)荧光标记复合扩增系统、ABI 310 /377型基因分析仪进行检测 ,统计各基因座的单倍体基因频率 ,计算其GD值即基因差异性 (GeneDiversi ty)。结果　 12个Y STR基因座中共检出 2 0 8种单倍型。其中 ,2 0 6种单倍型均出现 1次 ,2种单倍型出现 2次。GD值在 0 32 5 9～ 0 8810之间 ,累计GD值 (TGD)为 0 9999988。另对 2 8个父性家系调查显示 :同一家系(2～ 7名男性 ) 12个Y STR基因座单倍型一致。结论　天津汉族 12个Y STR基因座多态性分布良好 ,父系遗传稳定 ,适用于法庭科学中的个体识别和亲权鉴定