车辆上脱落细胞STR检验

目的对汽车方向盘及变速杆把手上的皮肤脱落细胞进行STR检验研究。方法用EZ-tape采集车辆方向盘及变速杆上的脱落细胞,Chelex-100法与磁珠法结合提取DNA,延长保温时间。定量后调整PCR反应体系,适当增加PCR循环数,增加PCR产物量及延长进样时间进行电泳检测,使用GeneMapperIDV3.2软件进行STR分型。同时,对比使用多重置换扩增技术对提取的DNA进行全基因组扩增。结果对33份车辆方向盘和变速杆上脱落细胞的检测,其中19份检出全部基因座的基因分型结果,9份检出部分基因型,5份未检出DNA分型结果。而利用多重置换扩增技术未获得满意图谱。结论本研究建立的脱落细胞收集、DNA提取、PCR扩增及检测方法适合于车辆上脱落细胞的检验,其结果优于使用多重置换扩增技术获得的分型。     

手部皮肤脱落细胞的DNA检验

一些案件中指纹和掌纹蕴藏着重要的信息,以往常常因为残缺不能满足形态学比对要求而丧失证明价值。随着DNA分析技术的进步,对汗潜指纹和掌纹中脱落细胞进行基因分型成为可能。但由于提取DNA量极少,属于低拷贝模板（low copy number,LCN）,提高分型成功率成为研究的难点和热点。     

霰弹枪支上微量脱落细胞STR分型检验初探

随着DNA检验技术的不断发展,检验手段更灵敏,脱落细胞等微量物证检验成功率逐渐提高。本文实验通过对霰弹枪上残留的人体脱落细胞进行STR分型检验,探索其在实际检案中应用的可行性。     

刀鞘上脱落细胞STR检验1例

1案例资料1．1案件简介2009年某日，某岛上发生一起聚众斗殴事件，导致2人死亡，多人受伤。技术人员在勘察现场后提取7把长刀和多名涉案人员血样送检。刀刃和刀柄上粘有大量血迹，经DNA检验，刀刃上检出5名不同男性DNA谱带。刀柄上检出的均是3人以上混合谱带，判断分析刀具来源难度较大。后又送检了外围现场提取的3把刀鞘，尝试分段提取脱落细胞进行检测。用EZ-TAPE粘取器按上、中、末段分别粘取细胞，将胶纸放人1．5mL的离心管中；     

一次性牙刷上脱落细胞的DNA提取及STR分型

目的研究一次性使用牙刷上脱落细胞的DNA提取和STR分型。方法对一次性使用牙刷的采集方法、采集部位、DNA提取方法、存放时间对STR分型的影响进行比对研究。结果割取法可获得较高浓度的DNA,30例中检出9个以上基因座达27例,与擦拭法存在统计学差异（P〈0.05）。Chelex-100法、DNA IQTM法检出9个以上基因座分别为26例、24例,STR分型结果无统计学意义（P〉0.05）。提取牙刷的前、后部三束刷毛检出9个以上基因座分别达27例、28例,STR分型结果无统计学意义（P〉0.05）;放置1天、1周、1个月、3个月、6个月的时间后检出9个以上基因座分别为28例、27例、22例、12例、7例。结论割取法提取一次性牙刷上的脱落细胞进行STR分型效果良好;放置时间越长的牙刷,检出率越低。     

两种DNA提取法对签字笔上脱落细胞STR分型比较

目的比较Chelex-100法和硅珠法两种DNA提取法,在签字笔上附着微量脱落上皮细胞分型中的应用效果。方法 17名志愿者每人使用14支签字笔,每支笔每天使用20min,为期1个月,平均分为两组,分别保存1、3、5、7、14、21和28d,同时运用Chelex-100法和硅珠法两种方法提取签字笔上遗留微量脱落细胞中的DNA,用Identifiler复合扩增系统在AB I 3100遗传分析仪上对这些DNA样品进行STR分型,同时采集上述17名志愿者口腔拭子作为对照。结果以基因座检出个数为指标,使用后签字笔保存1、3、5、7、14、21和28d后,采用Chelex-100法和硅珠法两种方法提取DNA并进行分型检出的基因座个数相比差异均有统计学意义(P0.01);口腔拭子保存1、3、5、7、14、21和28d后,采用Chelex-100法和硅珠法两种方法提取DNA并进行分型检出的基因座个数相比差异均无统计学意义(P0.05)。结论对于微量检材,应用硅珠法提取的DNA分型效果明显优于Chelex-100法,具有较高的应用价值,而在检材量比较多时区别不明显。     

凶器包装袋内面脱落细胞STR检验1例

1案例资料 简要案情及检验2009年某日,女工李某高坠死亡,3d后其丈夫邓某跳楼自杀。技术人员在李某坠地现场的10楼发现1根47cm长的铁管。铁管一端粘有血迹,经DNA检验,该血迹为李某所留。     

低拷贝模板STR分型及其存在的问题

微量、超微量生物学检材的STR分型常常是案件调查中进行DNA分析的难点。多年来 ,法医DNA分析工作者一直努力探索对微量DNA进行分析的方法。应用少于试剂盒规定的最小DNA模板量进行STR扩增检验 ,并对结果加以分析解释 ,被定义为低拷贝模板 (lowcopynumber ,LCN )STR分型[1、2 ] 。LCN STR分型不同于标准的STR分型 ,在实际应用中也存在许多问题需要引起注意[1～ 5] 。为了避免在LCN STR分型中出现误判 ,本文对如何正确地使用LCN STR分型技术加以介绍。1　LCN STR分型根据生产厂家的推荐 ,标准STR分型方法使用最低的模板…     

绳索上人体脱落细胞的DNA检验

本文作者应用脱落细胞提取仪及二步纱线擦拭法收集各类绳索上的微量脱落细胞,并运用Chelex-100法和QIAamp MinElute Column法联合提取纯化浓缩DNA模板,明显提高了绳索类上微量脱落细胞的检出成功率,现报道如下。     

衣物载体上人体脱落细胞的负压吸附采集法

目的建立脱落细胞负压吸附方法,用于DNA检验中衣物等载体上人体脱落细胞的采集。方法检材包括由志愿者佩带1、5、10、20m in纱线手套,穿着5、10、20m in的内衣以及外套、鞋、帽子、头套、袜子、水杯、矿泉水瓶等。在吸尘器的进风口处连接特制的吸筒,一端覆盖具有拦截和静电吸附细胞能力的特制吸附膜,选择适当负压对各检材相应部位进行吸扫。收集吸附膜上的脱落细胞,采用Chelex-100法提取DNA,AmpFLSTR Identifiler复合扩增试剂盒扩增检测。结果上述检材用本文负压吸附法采集人体脱落细胞,经检验均获得清晰、完整的STR分型图谱,并与检材提供者的基因型一致。结论本文建立的脱落细胞负压吸附技术可有效吸附载体上的脱落细胞,适用于DNA检案实践。     

PCR扩增循环数与低拷贝模板DNA的STR分型

目的探讨PCR扩增循环数对低拷贝模板DNA的STR分型的影响。方法模板DNA(9947A)的不同扩增用量(含低拷贝模板量),采用ProfilerPlus试剂盒,扩增循环数分别为28、30、32、34、38次,3100型基因分析仪(ABI,美国)检测结果。结果循环数从28次增至38次,模板DNA量最低检出量可从0.25ng减少至0.0312ng;先循环28次后,每反应加0.3μlAmpliTaqGoldDNA聚合酶,再循环6次较1次34个循环的检测灵敏度高,相当于1次38个循环的效果。结论增加PCR扩增循环数,可能影响低拷贝模板DNA的STR分型。     

改良IPEP法用于痕量DNA检测的实验研究

目的探讨改良扩增前引物延伸(IPEP)法对痕量DNA样本STR检测分型的效果。方法用改良IPEP法对痕量样品DNA进行全基因组扩增(WGA),扩增产物用实时荧光定量PCR技术定量、用AmpFLSTR~ Indentifiler~试剂盒作基因型检测。结果该方法可增加模板DNA约200~1100倍。基因组DNA不低于0.025ng时,可获得15个STR基因座和Amelogenin性别基因座的分型结果。基因组DNA0.01~0.025ng时,可获得9个以上基因座的分型结果。结论改良IPEP法可有效提高痕量DNA样本STR分型检验的灵敏度,有较好的实用价值。     

MiniFiler~(TM)试剂盒在LCN-STR分型中的应用

目的评估MiniFilerTM试剂盒在LCN-STR分型中的法医学应用价值。方法采用MiniFilerTM与IdentifilerTM试剂盒,对49份常量与39份LCN检材,包括血迹、精斑、骨骼等7类常见检材的检验结果进行比较,并对两种试剂盒的检测灵敏度进行比较。结果在49份常量检材的检验结果中,两种试剂盒的STR分型结果全部一致;在39份LCN生物检材的检验结果中,MiniFilerTM试剂盒获得全部STR分型的有30份,部分分型的5份,阴性的4份;IdentifilerTM试剂盒获得部分STR分型的22份,阴性的17份。MiniFilerTM试剂盒检验成功率明显高于IdentifilerTM试剂盒;MiniFilerTM试剂盒的检测灵敏略高于IdentifilerTM。结论MiniFilerTM试剂盒可显著提高LCN生物检材的检验成功率,适合应用于法庭科学实际检案中LCN生物检材的检验鉴定。     

Comparison of two whole genome amplification methods for STR genotyping of LCN and degraded DNA samples

The analysis of LCN or highly degraded DNA samples presents a challenge for forensic science. Improving the quantity and/or quality of samples would greatly increase the profiling success rate from LCN and degraded samples. Whole genome amplification (WGA) is one method that has such potential. Two commercially available WGA kits, GenomePlex and GenomiPhi, were investigated for use on LCN and degraded DNA samples. Both kits amplified genomic DNA, producing microgram quantities from sub-nanogram templates. Profiling success of LCN DNA samples was increased, with improvements of over 700% from 10pg template DNA compared to non-WGA-amplified control samples. The amplification success with degraded DNA was also improved by WGA. Degraded DNA was simulated using restriction enzymes to demonstrate that the application of WGA can result in the typing of STR loci that could not previously be amplified. An increase in artefacts, such as stutter alleles and amplification biases, were observed in many samples. Results show that WGA is capable of increasing both the quality and quantity of DNA, and has the potential to improve profiling success from difficult samples in forensic casework.     

A review of low template STR analysis in casework using the DNA SenCE post-PCR purification technique

LGC has developed a method for analysing low-level DNA samples called DNA SenCE (Sensitive Capillary Electrophoresis) based on post-PCR treatment of standard 28-cycle SGMplus PCR product and demonstrated to be equally effective at enhancing profiles as 34-cycle PCR. The method has been validated and accredited and used in casework since July 2007. Inherent in the method is the initial generation of a standard 28-cycle SGMplus profile so a direct comparison of standard and DNA SenCE results for all casework is possible. Here we review DNA SenCE casework, reporting the magnitude of peak enhancement and stochastic effects seen in the DNA SenCE profiles.     

Single primer extension (SPEX) amplification to accurately genotype highly damaged DNA templates

High levels of non-authentic sequence data can be generated by traditional PCR-based methodologies when DNA is damaged, template numbers are small and/or the target amplification size too large. We therefore present an alternate methodology based on single primer extension (SPEX) amplification; that places no pre-defined size constraints on amplification and interacts with only one of the DNA strands at the target locus.     

DNA提取方法和PCR循环次数对STR扩增成功率的影响

目的探讨常见载体上的微量血痕DNA的提取方法、PCR循环次数对STR扩增成功率的影响。方法分别应用Chelex-100法及Chelex-100结合纯化法对8种载体上不同大小的血痕样本进行DNA提取,并采用28次、30次及34次PCR循环进行STR扩增,分别观察其扩增成功率。结果经28次、30次及34次PCR循环,Chelex-100法提取DNA后的STR扩增成功率分别为0.2917,0.3333,0.4583,Chelex-100结合纯化法的STR扩增成功率分别为0.3750,0.4583,0.8750。结论用Chelex-100结合纯化法提取DNA,用34次循环扩增可提高STR基因座的检测成功率。     

粪便DNA提取及检验

目的　研究人类粪便DNA的提取和检验方法。方法　 8人份粪便样本 ,磁珠法提取DNA后 ,进行STR复合扩增和mtDNAHVI区测序分析。结果　用 2种方法提取的粪便DNA ,STR复合扩增检验均未获成功 ;方法1提取的粪便DNA有 6个样本、方法 2有 7个样本获得了清晰可读的mtDNAHVI区序列 ,并与唾液对照样本DNA的序列完全一致。结论　用本文建立的方法提取粪便DNA ,不适于STR分析 ,可通过mtDNA测序分析进行检验。     

DNA数据库9个STR基因座比中认定亲权的可靠性分析

目的探讨Profiler plus试剂盒9个常染色体STR基因座用于DNA数据库中双亲亲缘关系比中结果认定亲权的可靠性。方法在DNA数据库中搜集无关个体与已知母子（或父子）在9个STR基因座不排除亲缘关系的比中记录54例，组成54例假定的三联体家庭，计算其PI值与RCP值；应用Identifiler试剂盒加做到15个常染色体STR基因座，观察其排除情况。结果在54例假定三联体中PI值最低为178．598597（RCP=99．443203％），最高为97318．085812（RCP=99．998972％）。加做到15个STR基因座后，54例假定三联体中每个三联体至少出现2个基因座排除，最多5个基因座出现排除的现象，平均排除基因座数为3．52个。结论Profilerplus试剂盒9个STR基因座用于亲缘关系鉴定可能出现错误结论；单纯利用RCP值来认定亲缘关系是不安全的；建议应用16个或更多的基因座建设DNA数据库和进行亲缘关系判定。