AmpF(l)STR(R) Identifiler(R) Plus试剂盒快速直接PCR扩增初探

目的 探索可应用于法医实践的快速直接PCR扩增方法,以缩短扩增时间,提高STR分型速率.方法 联合运用AmpF(l)STR(R) Identifiler(R) Plus试剂盒与TaKaRa快速PCR检测试剂构建快速直接PCR体系,以FTA血卡为模板,采用优化后的扩增程序在快速PCR仪上进行扩增,分型结果与常规直接扩增方法相比较.结果 AmpF(l)fSTR(R) Identifiler(R) Plus试剂盒与TaKaRa的快速PCR检测试剂针对血卡的联合扩增,所得STR分型结果与常规方法一致,扩增用时由常规直接扩增所需的175 min缩短为55 min.结论 采用快速直接PCR方法进行扩增,可得到与常规直接扩增一致的DNA分型,扩增时间明显缩短,DNA分型速率大幅提高.     

胎儿亲子鉴定中21-三体综合征1例

<正>1案例资料1.1简要案情2012年本单位受理1起亲子鉴定案,征得当事人同意,采集母亲(孕5月余)、嫌疑生父的口腔拭子及羊水(胎儿样本),进行STR分型实验。1.2 DNA检验Chelex-100法提取上述样本DNA。采用AmpFlSTR Identifiler PCR Amplification试剂盒(ABI     

甲醛固定石蜡包埋组织STR分型检测

目的评估10%甲醛固定石蜡包埋组织STR分型结果的影响因素。方法采用QIAGEN法、IQ法、Chelex法对2具新鲜尸体在尸检时常规制备的心、脑、肝、脾、肾、肺、胃、肠石蜡包埋组织进行DNA提取,用AmpFlSTR Identifiler试剂盒进行PCR扩增,在3100-Avant上完成片段分析。另外对15个案例中室温保存1～5年的心、肝、肺、肠存档石蜡包埋组织共56份采用同样的方法进行STR分型。以STR基因座检出率评估分型有效性。结果各种组织DNA片段均随着保存时间延长而持续降解,其中心、肺组织STR基因座检出率与保存时间存在线性相关。相同保存时间时,各种组织基因座检出率差异有统计学意义。其中以肺组织在不同保存时间中基因座检出率最高。结论在甲醛固定时间一定的条件下,存放时间、组织类型、DNA提取方法和PCR模板质量浓度是影响石蜡包埋组织STR分型的重要因素。     

大规模汉族个体15个STR基因座遗传多态性调查

本文利用苏州市公安系统DNA数据库资源,进行大规模汉族人群的15个基因座的遗传多态性分析。采用Amp FISTR Identifiler试剂盒、Amp FISTR Identifiler Plus试剂盒、AGCU 17+1试剂盒进行扩增,经测序后获得510 000名汉族个体15个STR基因座的DNA分型,应用Excel软件计算等位基因的分布频率等群体遗传学数据。在15个STR基因座共检出等位基因344个、基因型1890个。所调查的汉族人群15个基因座具有较好的识别力。     

两种国产磁珠试剂盒对常见PCR抑制物去除效果比较

目的比较国产博坤磁珠试剂盒和Wawasye磁珠试剂盒对法医学常见PCR抑制物的去除效果。方法选择6种常见PCR抑制物,胆汁酸盐、胶原质、腐殖酸、血红素、黑色素和尿素,分别将其与K562 DNA混合后,采用Identifiler试剂盒进行分型,以恰好抑制K562 DNA所有26个不同等位基因的抑制物浓度为标准添加浓度,在此基础上提高每种PCR抑制物的浓度,分别采用两种磁珠试剂盒对混有抑制物的标准品DNA进行纯化处理后,再进行PCR扩增和STR分型检测,统计STR基因座等位基因检出个数。结果分别混有1×、2×和4×标准添加浓度各种抑制物的K562 DNA经博坤磁珠试剂盒纯化后,均可检出所有STR基因座的全部等位基因;经Wawasye磁珠试剂盒纯化后,混有胆汁酸盐、胶原质、血红素和尿素的DNA均可检出所有STR基因座的全部等位基因,而混有腐殖酸和黑色素的DNA未检出任何等位基因。结论除Wawasye磁珠试剂盒无法有效去除腐殖酸和黑色素外,两种国产磁珠试剂盒对大多数PCR抑制物均具有良好去除效果。     

快速PCR仪与普通PCR仪扩增效果的比较研究

目的比较快速PCR仪与普通PCR仪的扩增效果。方法浓度为0.1、0.05、0.025、0.0125、0.0063ng/μL的9947A标准品各取样100例,采用Identifiler Plus试剂盒构建扩增体系,其中50例在普通PCR仪(9700型扩增仪)上进行扩增,50例在快速PCR仪(Speed cycler2扩增仪)上扩增,3500x L型遗传分析仪检测,对比每种浓度组两种扩增仪的检验结果。结果两种PCR仪的检出率均无差异(P0.05)。但当9947A的浓度为0.0125、0.0063ng/μL时,普通PCR仪检验样本的STR基因座检出数(13.7±1.0;11.3±1.5)均高于快速PCR仪(13.1±1.3;9.9±1.9),差异有统计学意义(P=0.029;P0.001);当9947A的浓度为0.1、0.05、0.025 ng/μL时,普通PCR仪检验样本的图谱峰高(18931±4625;13437±3165;5752±1344)均高于快速PCR仪(16929±4034;11815±4120;4865±1401),差异有统计学意义(P=0.023;P=0.030;P=0.002)。结论快速PCR仪可在较短的时间内达到与普通PCR仪相当的检出率,适合于实际案件中的应用;普通PCR仪检验获得的STR分型结果质量可能更高。     

国产STR荧光复合试剂盒DNAtyper15应用结果分析

DNAtyper15是公安部第二研究所研制的STR荧光试剂盒,为检验应用该试剂盒检测样本基因分型的准确性和稳定性,本文对日常案件中的样本进行处理,在实验室内和实验室之间进行基因分型结果比较,并与PE公司Identifiler试剂盒基因分型结果一致性进行调查.     

D3S1358基因座重复序列分析1例

1案例资料1.1简要案情作者在对1例非正常死亡案件死者的血样进行DNA检验中,发现D3S1358基因座呈三带型。1.2检验方法STR分型按照硅珠法[1]提取血样模板DNA,用Identifiler Plus荧光检测试剂盒进行PCR扩增,产物在ABI 3130XL遗传分析仪进行分型检测,使用GeneMapper ID-X软件进行数据分析。筛选阳性克隆设计的引物序列见表1。     

尼龙膜套管分离技术对混合斑中精子细胞DNA的提取

目的建立新型的混合斑中精子细胞分离的方法,并评价其应用价值。方法收集性侵案件中的40份混合斑检材,分别采用常规差异裂解法和尼龙膜套管分离技术进行精子细胞分离,使用硅膜试剂盒(Forensic DNA Extraction Kit for Soft Tissues)提取精子细胞DNA,Amp FlSTR~ Identifiler~ Plus PCR扩增试剂盒进行PCR扩增,3500x L基因分析仪进行电泳检测,并对两种分离方法的结果进行对比。结果 40份混合斑检材中,采用尼龙膜套管分离技术的检材仅3份有女性成分微弱残留,余均获得了完整的单一男性分型。而采用常规差异裂解法分离的检材中,有25份完全未检出男性精子细胞STR分型,15份检出男性精子细胞STR分型(7份不完整男性精子细胞STR分型,6份有女性成分残留,2份单一的男性精子细胞STR分型)。结论本研究建立的尼龙膜套管分离技术适用于混合斑中精子细胞的分离,特别是对含有大量女性细胞而精子细胞较少的检材提取效果明显,整个提取实验成本低廉、快速简便。     

尿蛋白酶抑制剂对尿样STR分型的影响

目的研究尿蛋白酶抑制剂(urinary trypsin inhibitor,UTI)对提高尿样STR分型成功率的作用。方法收集男女各5名健康志愿者中段尿,分装后分别添加不同质量浓度的UTI,-80℃保存,于8个不同的时间点进行DNA提取与Identifiler系统STR分型。比较15个STR基因座在不同组别尿样及来自同一个体对照血样的分型结果,计算不同组别尿样STR分型成功率。结果对照血样及保存期限为1 d的尿样15个STR基因座均分型成功,未经UTI处理的女性尿样3 d即发生基因座的丢失,9 d时检测不到任何基因座,而经UTI处理的女性尿样在9d之内均可以检测到15个STR基因座;未经UTI处理的男性尿样7d时检测不到任何基因座,而经UTI处理的男性尿样9d时STR基因座平均检出数约为9个。当尿液保存时间为30d时,经0.2、0.4和0.6μg/mL UTI处理的女性尿样的STR基因座检出率差异无统计学意义,平均为0.840 0±0.042 3,显著高于男性尿样的0.160 0±0.042 3。结论 UTI处理可显著提高尿样STR分型成功率,一定程度上延长尿样用于个体识别的保存期限。     

AGCU免提取STR荧光检测试剂盒的验证

目的考察AGCU免提取STR荧光检测试剂盒．对保存在滤纸片或FTA卡上血液样本的直接扩增检测情况。方法使用人GCU免提取STR荧光检测试剂盒,对未经提取的滤纸片血液样本、FTA卡血液样本675份进行直接扩增和18个基因座的DNA分型,并对结果的可靠性进行研究。结果18个基因座检测结果与PP16和ID试剂盒分型结果一致,2000年数据库样本成功率92．3％,2001年数据库样本成功率92．6％,2004以后年数据样本及案件样本、亲子鉴定样本成功率在99％以上。结论AGCU试剂盒可以成功地对滤纸片、FTA卡样本的18个STR基因座进行直接扩增检测,检验结果稳定,分型准确。     

Trade mark cartoons 'FOR LIFE(R)'

‘A book may be good for nothing; or there may be onlyone thing in it worth knowing; are we to read it all through?’(Samuel Johnson) This section is dedicated to the review of ideas, articles,books, films and other media. It will include replies (and rejoinders)to articles, the evaluation of new ideas or proposals, and reviewsof books and articles both directly and indirectly related tointellectual property law. Writing a book review has never been more entertaining. The‘book’ under review is a 12 page trilingual (English,French, and Spanish) comic book compiled and co-published byWIPO and the National Institute for     

Unbrauchbarkeit der Wohnung (undichte Gasleitungen) – Rügeobliegenheit

Die Undichtheit von Gasleitungen stellt keinen offenkundigen und schwerwiegenden Mangel dar, der bei der geringsten überprüfung leicht erkennbar gewesen w?re. Wenn der Mieter im Zuge umfangreicher und kostenaufwendiger Adaptierungsarbeiten entgegen der im Mietvertrag ausdrücklich erkl?rten ursprünglichen Einsch?tzung der Vertragsparteien die Undichtheit der Gasleitungen erkennt, dann entspricht es Treu und Glauben, den Vermieter über diesen Mangel zu informieren und ihm die Gelegenheit zur Sanierung zu geben.     

A new sensitive short pentaplex (ShoP) PCR for typing of degraded DNA

Analysis of short tandem repeat makers has become the most powerful tool for DNA typing in forensic casework analysis. Unfortunately, typing of DNA extracted from telogen shed hairs, bones buried in the soil or from paraffin-embedded, formalin-fixed tissue often reveals no results due to the degradation of DNA. The reduction in size of the target fragments by development of new primers and their combination in multiplex approaches open a new field of DNA analysis. Here we present a new sensitive short pentaplex PCR including the loci amelogenin, TH01, VWA, D3S1358 and D8S1179. Validation tests of our new method included sensitivity, mixtures, human specificity, artificial degradation of DNA by DNase I and case work analysis on a panel of different forensic samples. The detection limit was 12.5 pg of human DNA, and mixtures of 50 pg in a total of 1000 pg were clearly detectable and revealed complete profiles. Only DNA extracts of human primates displayed a few signals, whereas other animal, fungal or bacterial DNA showed no signals. Our method proved extremely valuable in the analysis of artificially degraded DNA and in forensic cases, where only poorly preserved DNA was available. This approach and other similar methods can aid in the analysis of samples where allelic drop out of larger fragments is observed. It is highly recommended to develop more of these multiplexes to improve poor quality DNA typing.     

菲德倍斯试剂检验唾液斑的有效性

目的验证菲德倍斯试剂（Phadebas Forensic tube test）检验唾液（斑）的有效性。方法从灵敏度、敏感性、常见载体的影响、唾液斑保存时间的影响,以及与STR检验的相关性等几个方面进行研究。结果0.01 ul唾液和阴干保存1年以上的唾液斑仍能被有效检出,该检验对其它常见体液（斑）反应不敏感,常见载体对该检验无影响。结论菲德倍斯试剂是人唾液（斑）检验的理想试剂。     

Multiplex PCR electrospray-ionization mass spectrometry (ESI-MS): Application to forensic mitochondrial DNA examinations

Mitochondrial DNA (mtDNA) examinations play an important role in criminal investigations, identification of victims of mass disasters, and association of unidentified remains with family members. Typically, HV1 and HV2 are amplified via polymerase chain reaction (PCR) followed by fluorescent sequencing. While this method produces the highest level of resolution, it is labor intensive and unable to distinguish components of a mixture. Previously, an electrospray-ionization mass spectrometry (ESI-MS) method was described to determine the base composition profile of enzymatically digested PCR amplified fragments derived from the HV1 and HV2 regions. Advantages of ESI-MS compared to sequencing include speed of analysis, automation, and increased sensitivity, while retaining a high degree of resolution. Here, we report the next generation of this method in which a base composition profile is determined from 24 overlapping PCR reactions. Because ESI-MS provides the relative abundance of each component present, this method allows for the quantitative typing of mixtures. This ESI-MS method does not rely on a priori knowledge of variable sites, allowing the capture of private mutations and individual-specific variation. Due to the multiplex design, automation, speed of analysis, and ability to interrogate mixtures, this method provides a powerful and rapid tool for forensic mtDNA examinations.