常染色体STR分型鉴定半同胞关系的亲缘关系指数计算

目的获得双方生母均参与情形下计算两个或三个孩子间半同胞关系指数(half-sib index, HSI)的简化公式。方法在给定的前提假设下,根据HSI值的定义,首先推导出单基因座上HSI值的统一表达式,再获得不同基因型组合下的计算公式,最后归纳出两种鉴定情形下的简化公式。将简化公式应用于1例典型的半同胞关系鉴定,根据39个常染色体STR位点的分型计算不同鉴定情形下的累积HSI值。结果成功地推导和归纳出双方生母均参与情形下计算两个或三个孩子间HSI值的简化公式。实际案例的计算结果显示,当双方生母均参与时,任意两个孩子间的累积HSI值与生母均不参与时相比均发生了数量级的改变,即在半同胞关系情形下大约为10~4～10~6倍,在无关个体情形下大约为10~(-4)～10~(-3)倍。结论所推导出的简化公式可用于计算双方生母均参与情形下两个或三个孩子间的HSI值。     

常染色体STR遗传标记在同胞鉴定中的应用

目的 探讨常染色体STR遗传标记用于鉴定两个体同胞关系的可行性。方法 用Power Plex~(TM)16体系15个STR基因座检测150对同胞个体和150对无关个体,ITO法计算同胞关系指数(PI_(FS))与同胞关系概率(W_(FS)),并比较两组W_(FS)值及两个体间等位基因匹配情况的差异,对前者进行组间差异的x~2检验。结果 100对(66.67％)同胞个体的W_(FS)大于0.9995;无关个体W_(FS)均小于0.8,其中100对(66.67％)W_(FS)小于0.27。同胞个体两个体间等位基因全相同的基因座个数为1～10个不等,平均5.49个,无关个体0～5个不等,平均1.33个;等位基因全不同的基因座个数,同胞个体0～6个不等,平均1.66个,无关个体2～11个不等,平均6.57个;等位基因半相同的基因座个数,同胞个体3～13个不等,平均7.85个,而无关个体1～13个不等,平均7.11个。经x~2检验,同胞个体和无关个体间全相同和全不同的基因座数差异均有极显著意义(P<0.001),半相同的基因座数差异无显著意义(P>0.05)。结论 PowerPlex~(TM)16体系可用于鉴定同胞关系。当两个体全不同基因座个数大于或等于6个,或全相同基因座数为0时,提示为无关个体;当两个体全不同基因座个数小于或等于1个,或全相同基因座数大于或等于6个时,提示为同胞。     

两个个体间常用亲缘关系指数的统一算法

目的 介绍仅有两名被鉴定人时二者间常见亲缘关系指数的统一算法.方法 以ITO法计算二联体亲权指数(paternity index in duos,PID)、全同胞指数(full sibling index,FSI)、半同胞指数(half sibling index,HSI)、叔侄指数(avuncular index,A...     

常染色体STR祖孙亲缘关系鉴定分析

目的概括归纳一种简便易行的祖孙亲缘关系鉴定分析方法,对实际检案起到指导作用。方法根据孟德尔遗传规律、概率论和亲权指数(PI)值基本概念,归纳推导适用于常染色体STR各种基因型组合的祖孙亲缘关系似然率(LR)计算式及其代入参数。并应用于一个三代家系的祖孙鉴定及实际案例。结果祖孙亲缘似然率(LR)计算总共有三种计算式,它们概括了祖孙亲缘关系鉴定中的各种基因型遗传组合情形。公式中祖父母遗传可能的生父基因的概率可以简单地根据可能生父基因在祖父母基因型中所占的比例数来推定。祖孙亲缘关系鉴定分为孩子生母参与和不参与两种情况,同样的遗传指标检验分析后,前一种情形LRs明显升高,后一种情形LRs明显降低。结论用常染色体STR检验进行祖孙亲缘关系鉴定分析,在祖父、祖母均参与的情况下,其祖孙亲缘关系似然率的计算简单、直观、可操作性强;孩子生母尽可能参与检验,否则需要增加检验STR位点的数量才能获得更加明确的结论。     

常染色体和X染色体遗传标记分析同父异母半同胞关系1例

1 案 例 1.1 简要案情 在一起遗产继承纠纷案件中,赵1(女)、赵2 (女)、陈某(男)、赵3(男)为全同胞的兄弟姐妹,父母已故,在案件办理过程中查到邢某(女)可能为上述4人同父异母的姐姐,故法院委托本中心对邢某与赵1、赵2、陈某、赵3之间是否存在同父异母半同胞关系进行鉴定.     

X染色体遗传标记研究进展

随着人类基因组计划的进展,全面深入地了解个体和群体间基因组的变异或多态性已成为可能,并日益显示其重要性。X染色体遗传标记的遗传多态性较多地表现在短串联重复序列和单核苷酸的多态性。这类多态性有助于解释个体的表型差异、不同群体和个体对疾病,特别是对复杂疾病的易感性、以及对各种药物的耐受性和对环境因子的反应,因此受到临床及法医工作者的重视。本文收集了国内外X染色体遗传标记在临床疾病诊断及法医DNA工作者实践中的研究和应用资料,汇总报道了X染色体遗传标记的研究进展。     

常染色体STR检验认定祖孙亲缘关系1例

祖孙亲缘关系鉴定又称隔代亲权鉴定,属复杂亲权关系鉴定[1].该类案件因孩子的父/母不能参加鉴定,故需通过检测缺席者的父母,鉴定其与孩子间是否存在祖孙亲缘关系. 1案例资料 1.1简要案情 成某(男)与某女未婚同居生育一女孩,后成某遇车祸身亡,其父母为明确该女孩身份,特委托本中心进行祖孙亲缘关系鉴定.     

X-STR联合常染色体STR用于亲缘关系鉴定1例

1 案例1．1简要案情某年7月27日夜,某乡镇家庭作坊失火。消防救援后,发现3例烧焦炭化的尸体,2例疑似为姐妹,1例疑似为姐姐的儿子．提取各尸体肋软骨和姐妹的父亲鲁某血样要求进行亲缘关系鉴定比对。1．2检验按行业标准GA／T383—2002中Chelex 100法提取基因组DNA,分别用AGCU、X-12、AGCUEx22、AGCU 21＋1（无锡中德美联生物公司）和Identifiler、Sinofiler试剂盒（美国AB公司）,采用10μL体系按照试剂盒说明书进行PCR扩增,扩增产物在3130遗传分析仪（美国AB公司）上毛细管电泳检测,用Gen—eMapperlDv3．2软件进行基因分析。     

X染色体遗传标记的研究应用进展

X染色体遗传标记在法医学中占有不可或缺的位置,因其独特的结构和遗传特征而被应用于复杂亲缘鉴定。目前应用于法医遗传学领域的有超过50个高度多态性X-STRs,筛选到高度多态性的X-SNPs和X-Indels的数量也在逐渐增加,且X染色体特异性遗传标记对复杂疾病的易感性也受到了临床工作者的重视。本文就X染色体遗传标记在法医学及临床医学上的研究和应用进行综述。     

常染色体STR突变基因座父权指数计算

目的概括归纳常染色体STR突变基因座的父权指数计算方法,以在实际检案中应用推广。方法根据目前对常染色体STR基因座突变的认识,用经验递减模型从基因座突变率计算等位基因突变率,分别推导在标准三联体和二联体亲子鉴定中STR突变基因座的父权指数计算式,并举例进行演算。结果总结了在标准三联体鉴定中,只允许假设父突变和既允许假设父也允许母发生突变时,以及二联体鉴定时X和Y的计算式。结论STR基因座发生突变时计算得的父权指数明显低于未发生突变时,提示要检测更多的遗传标记才能使累积父权指数达到认定亲权关系的标准。     

云南苗族常染色体STR遗传多态性及其遗传结构分析

目的研究云南苗族常染色体9个STR基因座遗传多态性并分析其遗传结构。方法采用荧光标记PCR复合扩增、基因扫描自动分型技术调查了87名云南苗族无关健康个体9个STR基因座等位基因分布情况。结果9个基因座共检出52种等位基因和109种基因型,等位基因频率分布在O．0057～0．7184。经计算杂合度（H）为0．4023-0．8161、多态信息量（PIC）为0．4090～0．8057、个体识别力（DP）为0．6429。0．9436、非父排除率（PE）为0．1153～0．5654。X^2检验显示所有基因座均符合Hardy—Weinberg平衡。聚类分析结果显示．苗族、僳僳族、傣族、德昂族、普米族及景颇族遗传关系较近。结论为进一步研究STR遗传结构奠定了基础．在人类学、法医学等领域也有重要的应用价值。     

云南苗族常染色体STR遗传多态性及其遗传结构分析

目的研究云南苗族常染色体9个STR基因座遗传多态性并分析其遗传结构。方法采用荧光标记PCR复合扩增、基因扫描自动分型技术调查了87名云南苗族无关健康个体9个STR基因座等位基因分布情况。结果9个基因座共检出52种等位基因和109种基因型,等位基因频率分布在0.005 7～0.718 4。经计算杂合度(H)为0.402 3～0.8161、多态信息量(PIC)为0.4090～0.8057、个体识别力(DP)为0.6429～0.943 6、非父排除率(PE)为0.115 3～0.565 4。x~2检验显示所有基因座均符合Hardy-Weinberg平衡。聚类分析结果显示,苗族、僳僳族、傣族、德昂族、普米族及景颇族遗传关系较近。结论为进一步研究STR遗传结构奠定了基础,在人类学、法医学等领域也有重要的应用价值。     

中国汉族人群21个常染色体STR的遗传多态性

本文对中国汉族608个无关个体的常染色体STR基因座遗传多态性进行调查。结果 21个常染色体STR基因座检出的频率分布在中国汉族人群中均符合Hardy-Weinberg平衡。Globalfiler~(TM)试剂盒所包含的STR基因座具有良好的遗传多态性,对法医学应用和群体遗传学研究具有重要意义。     

常染色体STR分型鉴定祖孙关系的亲权指数计算

随着DNA遗传标记在亲权鉴定中的广泛应用,不仅扩大了检材的使用范围,也扩大了亲缘关系的鉴定范围,使鉴定隔代、同胞、旁系亲缘关系成为可能。近几年,由于父或/和母已亡,或某种原因不能参与检验,为了认亲、移民、继承财产、入户等要求进行隔代鉴定的案例有所增加。作者在实际工作中已受理了10余起祖父、祖母、孙“三联”的隔代血缘关系鉴定,现对此类个案根据家系基因型重建计算亲权指数的方法[1]作一分析讨论。1隔代亲权鉴定的原理隔代(一三代)亲权鉴定的原理与鉴定父权的原理一样。根据孟德尔遗传规律,孩子与父母各方必定有1个等位基因同…     

四川彝族人群15个常染色体STR基因座遗传多态性

应用AmpFeSTR Identifiler荧光标记复合扩增系统,对302例四川彝族人群无关个体15个常染色体STR基因座遗传多态性进行调查,以期为相关研究及应用提供参考. 1材料与方法 1.1 样本及DNA提取 遵照知情同意的原则随机采自四川地区彝族人群无关个体样本302例(女性47名,男性255名).用Chelex-100法提取血液DNA[1].     

一家3代常染色体STR等位基因特殊遗传关系分析

笔者在检案中观察到一例非常罕见的常染色体呈"捆绑式"在三代间遗传的现象,现报道如下:     

常染色体STR三体基因座父权指数计算方法探讨

目的探讨常染色体三体综合征患者异常基因座的父权指数计算方法。方法根据三体综合征的发病机理,以及父权指数计算原理,分别推导涉及三体综合征孩子的标准三联体和二联体亲子鉴定中的异常基因座的父权指数计算式,并举例演算。结果总结了在涉及三体综合征孩子的标准三联体和二联体的亲子鉴定中,分别在明确和不明确不分离染色体来源的情况下,X和Y的计算式。结论对于涉及到三体综合征孩子的亲子鉴定,在明确的核型分析诊断的前提下,可通过归纳的计算式进行三体基因座的父权指数计算。     

江西汉族人群15个常染色体STR位点的遗传多态性

本文采用Amp FISTR~?Identifiler试剂盒对3500例江西九江地区无血缘关系汉族个体检测15个常染色体STR位点的遗传多态性。实验发现15个STR位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,DP值介于0.9671(D2S1338)~0.7873(TPOX),PE值介于0.7326(D2S1338)~0.3022(TPOX),He介于0.8690(D2S1338)~0.6093(TPOX),在法医学个体识别和亲缘鉴定中具有较高的应用价值。     

联合应用常染色体STR和X-STR标记鉴定单亲疑难案例

目的通过对常染色体和X染色体遗传标记的检测,探讨单亲疑难案例的鉴定策略。方法提取3个单亲鉴定案例的6份血样,采用Goldeneye 20A试剂盒和AGCU21＋1试剂盒检测常染色体上39个STR基因座,采用自主研制的16重X-STR扩增系统检测X染色体上16个STR基因座。结果用Goldeneye 20A试剂盒检测后发现每个单亲案例均有一个基因座不符合遗传规律,当常染色体STR基因座增加到39个时,案例1累计出现3个矛盾基因座;案例2和案例3均没有出现新的矛盾基因座。X染色体STR分型结果显示案例1有8个矛盾基因座,案例2和案例3无矛盾基因座,与常染色体分型结论相符。结论对于出现单基因座不符合遗传规律的母女、母子、父女单亲案例鉴定,不仅可以增加新的常染色体STR检测,也可以增加X染色体STR的检测,这样在相互验证的同时也能获得更加可靠的鉴定意见。     

武汉汉族8个Y染色体双等位基因标记遗传多态性

目的筛选汉族群体中具有多态性的Y染色体双等位基因标记并研究其等位基因及单体群频率分布, 为法医学应用和群体进化研究提供基础数据。方法采用片段长度差异等位基因特异性PCR和PAGE技术对武汉地区160名男性汉族无关个体的8个Y染色体双等位基因标记(M9、M89、M111、M119、M122、M134、IMS-JST003305 和SRY+465)进行分型。结果 8个双等位基因标记在武汉汉族群体中均具有遗传多态性,其基因多样性(GD)范围为 0．0126-0．4830,共检出9种不同单体群(Hg1～9),其单体群多样性(HD)为0．7776。结论 8个Y染色体双等位基因标记组成的单体群在法医学应用和群体进化研究中具有一定的实用价值,可作为Y-STRs标记的有效补充。