PCR技术的常见问题与处理方法

自1989年我国DNA指纹技术研究获得成功并正式用于法医物证检验以来,已经为侦查破案发挥了重要作用.随着DNA技术的深入发展,此后PCR技术由于它日益明显的优越性得到越来越广泛的应用.到目前为止全国已有几十个法医PCR实验室,从单个VN-TR和STR位点的扩增技术到银染检测,从复合扩增STR技术到荧光检测,使得该技术越来越精确和方便.笔者将在办案过程中就PCR技术的常见问题与处理方法,尤其是银染检测STR位点复合扩增技术和荧光检测STR位点复合扩增技术所积累的一些经验总结如下供大家参考.     

磁珠直接吸附法对体态检材游离DNA的提取

目的采用磁珠直接吸附法对人体尿液、唾液、血液3种体态生物检材中的游离DNA进行提取检验,为法医物证中游离DNA的研究及检验工作提供参考。方法对3种生物检材采取离心吸取上清液的方法分离游离DNA,然后采用磁珠直接吸附法进行提取纯化,Identifiler-Plus试剂盒进行复合扩增后常规STR检测。结果在3种检材中均检出了游离DNA,其中血液中游离DNA检出率为100%,唾液为90%,尿液为70%。结论人体体态生物检材中存在游离DNA,同时磁珠直接吸附法可高效、快捷的提取生物检材中的游离DNA。     

荧光STR复合扩增试剂盒的评估过程探索

STR复合扩增检验技术是目前法医DNA检验技术中最重要也是最常用的技术种类之一，随着荧光检测技术和毛细管电泳技术的发展，特别是DNA数据库建设中丰要采用STR复合扩增技术进行基因分型，大大拓展了STR复合扩增检验应用范围。与此同时，STR复合扩增检验试剂成为影响检验质量的重要因素，关系到样本检验分型结果，而分型数据是为法庭提供证据的直接依据，     

荧光标记检测STR复合基因座的应用

自DNA检验应用于法医鉴定以来,经过了十几年的发展,已建立了许多各种各样的方法和技术.STR分析方法虽发展时间不长,但由于其本身特有的特点,如等位基因片段短小,易于扩增,灵敏度高;基因座多,识别力强;对降解DNA能进行分析,可检验腐败陈旧生物检材;易于实现自动分析和计算机管理等,已日益成为日常DNA分析的主要、首选方法.STR分析从单个位点扩增分析到多个位点复合扩增分析,从银染到荧光检测分析,日趋自动化.反过来,检验程序的自动化进一步促进STR技术在日常案件检验中的应用.现荧光标记检测STR复合基因座技术已开始在法医DNA检验中应用并将被广泛采用.本文就其应用中的一些问题进行讨论.     

强奸案中的DNA证据

强奸案中DNA证据有哪些作用1．确定案犯确定案犯是DNA证据首要的也是最重要的作用。目前用于法医DNA分析的STR基因座在人类基因组中分布广泛,适用于陈旧降解及微量生物检材的分析。以目前常规用于DNA检测的16个STIR基因座复合扩增试剂盒而言,除同卵双生子之外,没有两个人的DNA分型结果一致。所以,通过对现场犯罪分子遗留的精斑、唾液、血迹等生物物证的检测分析并与嫌疑人进行比对,就可以直接认定。STR基因座判型准     

15个常染色体和10个Y-STR基因座复合扩增试剂盒的研发

目的建立法医物证学常染色体和Y染色体综合检测的方法。方法选择常用的常染色体STR基因座和Y染色体STR基因座,设计复合扩增引物,形成五色荧光标记复合扩增试剂盒。结果开发出一个五色荧光标记复合扩增试剂盒,可同时对15个常染色体STR基因座、1个性别基因座和10个Y染色体STR基因座进行分型检测。结论 15个常染色体STR加10个Y染色体STR检测试剂盒结合毛细管电泳凝胶进行STR分型,结果准确可靠,在法医学案件检验及数据库建设等方面有良好的应用前景。     

环氧乙烷消杀DNA污染效果初探

目的初探环氧乙烷消杀DNA污染的效果。方法收集98例分别含有唾液、皮屑、汗斑、毛发、血斑、肋软骨的法医物证样本,分两组进行环氧乙烷灭菌6h和8h,提取DNA后扩增,使用3130XL或3500XL测序仪检测进行STR分型。结果 EO 6h组44例样本中有2例口腔拭子检出阳性结果,EO 8h组54例样本中有1例毛发检出阳性结果,阳性样本STR图谱表明仅有少量DNA残留,其余生物样本未检测到STR图谱。结论环氧乙烷能有效消杀DNA污染,可适用于DNA检验耗材的灭菌。     

MiniFiler试剂盒运用于法医微量物证的检验

目的应用MiniFiler试剂盒对法医微量物证进行DNA分析。方法采用MiniFiler试剂盒对样本进行DNA分型,确定样本9个STR基因座的等位基因型。结果10pg DNA模板经MiniFiler试剂盒扩增后,能够进行DNA分型,但40pg以上的DNA方可得到稳定可靠的分型结果。结论MiniFiler试剂盒可以用于法医微量物证的STR分析。     

STR复合扩增及荧光检测技术在个体识别中的应用

目的 :使用 310型遗传分析仪对D3S1358等 10个位点进行基因型检测并应用于法医物证学个体识别案件。方法 :用PCR复合扩增结合四色荧光检测技术对样本DNA进行基因分型。结果 :常见物证检材可成功地得到检验。结论 :这些位点适用于法医物证学个体识别。     

毛干STR分型1例

目前国内法医DNA检验中,毛干只能进行线粒体DNA测序鉴定。本文利用荧光STR复合扩增技术对1例案件中的毛干进行了检验,获得了STR分型,现报道如下。     

应用自动化工作站提取常见生物样本DNA

目的建立使用自动化工作站提取法医案件生物样本DNA的方法。方法选用Biomek 3000自动化工作站,采用DNA IQTM系统及Chelex法对法医案件中常见生物样本进行DNA提取,荧光定量技术进行定量,PCR扩增16个STR基因座并与手工提取方法比较。结果与手工提取方法进行比较,选用自动化工作站结合使用DNAIQTM系统及Chelex法提取DNA可获得满意的STR检验结果。结论自动化工作站可用于法医案件中常见生物样本的DNA提取。     

荧光标记STR分型进行烟蒂的个人识别

<正> 荧光标记STR复合扩增技术在法医物证中的成功应用,极大地拓展了法医物证检验范围,使微量生物检材个体认定成为可能[1]。本文作者结合典型案例,对烟蒂上的人体成分进行STR检验分析,并就其优点及注意事项等进行讨论,旨在进一步提高这类检材在法医学中的应用价值。1 案例资料 案例1 1999年7月5日,孔某(男、47岁)被杀。现场勘查发现:在死者床头柜上的烟灰缸内有黄色和白色过滤嘴的烟蒂2个。取烟蒂外层的纸片,用     

基于切口酶的等温全基因组扩增体系的建立与应用

目的 建立依赖切口酶Nt.BstNBI的等温全基因组扩增体系，并对该体系的微量生物物证STR分型效能进行验证。方法 选用切口酶Nt.BstNBI（识别序列为GAGTC）和等温扩增的聚合酶Bst，建立切口酶依赖的扩增体系（NDA）。对DNA样本进行NDA并纯化NDA产物，对NDA前后的样本进行复合扩增和毛细管电泳，检测该方法的有效性、灵敏性。结果 007标准品12个常染色体基因座的扩增效率提高2倍以上，灵敏度约为3 pg/μL;19个Y染色体个基因座的扩增效率提高2倍以上，灵敏度约为6 pg/μL。8个人血样本扩增效率提高2倍以上的常染色体基因座与007标准品一致。结论 本文建立的NDA体系准确性好，能够对包含特定侧翼序列的STR基因座进行有效的线性扩增，对法医微量生物物证的高效扩增检测具有重要意义。     

STR等位基因梯阶制备的研究

目的 建立制备STR的等位基因梯阶标准对照的新方法。方法 以T-质粒载体直接连接STR等位基因扩增产物,导入大肠杆菌,使其随大肠杆菌的无性繁殖而复制、扩增,获得单一DNA分子的大量拷贝;经PCR鉴定及测序分析后,制备出标准的STR等位基因梯阶对照(AL)。结果 所建方法制备出了标准AL;保存重组质粒及转染的大肠杆菌,可保证AL的大量快速制备,并能长期保存。结论 该方法制备的AL在法医物证检验中有很高的应用价值,对STR试剂盒国产化有重要意义。     

低拷贝模板DNA分析技术研究进展

近年来,低拷贝（LCN）模板类生物物证在法医DNA分析中占有了越来越重要的地位。用于低拷贝模板DNA的检测方法也得到飞速发展。本文通过对各种LCN-DNA分析技术如增加扩增循环数、纯化扩增产物、全基因组扩增、激光捕获显微切割等检测方法的综述,以及对LCN—DNA检测结果的分析评价,全面介绍LCN分析技术在法庭科学应用的最新进展及存在问题。最大限度地拓展低拷贝模板类生物物证在刑事司法领域的应用。     

全基因组扩增技术应用于法医学的进展

全基因组扩增(whole genome amplification,WGA)技术是一种对全部基因组序列进行非选择性扩增的技术。对微量模板DNA的检验,一直是法医物证学特别关注和急需解决的难题之一。近年来,对WGA技术的的研究发展日渐深入,研究成果有望应用于法医DNA检验中各类微量检材的检验。本文综述了WGA技术在法医物证学中的研究进展和应用前景,为法医物证工作者提供参考。     

DNA IQ^TM SYSTEM在疑难指甲DNA检验中的应用

目的探索DNA IQTMSYSTEM在疑难指甲DNA提取中的应用。方法 15份疑难指甲采用Chelex方法检验没有成功获得STR分型图谱,采用DNA IQTMSYSTEM提取法并纯化,采用Identifiler PLUS试剂盒进行复合扩增,产物经ABI3130XL型DNA基因分析仪检测。结果成功获得15例疑难指甲的STR基因座DNA分型。结论 DNA IQTMSYSTEM方法能快速、有效提取疑难指甲DNA进行STR分型。     

国产法医DNA检验试剂耗材检测DNA标准品的准确性研究

目的利用法医DNA标准品对自主研发的法医DNA检验试剂耗材进行电泳检测准确性的实验考查。方法实验平台分为2个：平台1全部由美国AppliedBiosystems公司进口的3130xl遗传分析仪、16道电泳毛细管与甲酰胺、电泳缓冲液、凝胶构成;平台2由AppliedBiosystems公司进口的3130xl遗传分析仪、16道电泳毛细管与本实验室研发的甲酰胺、电泳缓冲液、凝胶构成。在实验平台上对allelicladder、内标等标准品以及阳性对照9947a的STR复合扩增产物进行电泳检测,利用GeneMapper软件对电泳结果进行分析。结果自主研发的法医DNA检验试剂耗材可与国外进口的3130xl遗传分析仪配套使用,构建的实验平台对法医DNA标准品的检测结果准确无误。结论自主研发的甲酰胺、电泳缓冲液、凝胶等法医DNA检验试剂耗材检测准确性达到了国外同类产品水平。     

泥土中二氧化硅对硅珠法提取现场生物物证DNA的影响

目的 研究泥土中二氧化硅对硅珠法提取现场生物物证DNA的影响。方法 泥浆悬液和稀释血混合,制成混有灰尘、泥土的生物样本以模拟现场生物物证,分别用加热裂解和胍盐化学裂解的方式进行细胞裂解,硅珠法提取DNA后用Identifiler Plus试剂盒进行PCR扩增及毛细管电泳检测,并对电泳结果进行比较;用泥浆悬液代替硅珠提取稀释血DNA,反向验证泥土中二氧化硅对硅珠法提取现场生物物证DNA的影响。结果 混有泥浆悬液的4μL、20μL稀释血加热裂解,提取扩增后得到完整STR分型,平均峰高1 969.7±376.9 RFU、9 706.7±349.8 RFU;混有泥浆悬液的4μL稀释血胍盐化学裂解,提取扩增后无法获得完整STR分型;混有泥浆悬液的20μL稀释血胍盐化学裂解,提取扩增后得到完整STR分型,平均峰高1 899.8±801.3 RFU;泥浆悬液代替硅珠提取20μL稀释血得到完整STR分型。结论 泥土中的二氧化硅在胍盐存在条件下会与DNA结合,导致硅珠法提取现场生物物证DNA的回收效率降低。     

放置不同时间果核微量生物物证的提取

正近年来,犯罪分子反侦察意识增强,留下的常规生物物证越来越少,DNA检验的主要对象逐渐转变为一些存在形式特殊、类型多样的非常规生物检材,即接触DNA。目前,接触DNA检验是法医DNA检验的难点和热点,其中接触DNA的发现和提取是影响检验成功率的主要因素之一~([1])。本研究将苹果果核在自然环境下放置不同时间,采用擦拭法收集果核不同部位的微量DNA样本,对各样本的STR分型结果进