复合扩增STR位点片段长度多态性的研究

本文介绍了以三个短串联重复序列（STR）位点为基础的复合扩增进行个体识别的技术。其特点是在同一扩增体系内对彼此独立的三个STR位点，即HUMTH01[AATG]nHUMFABP[AAT]nHUMARA[AGC]n进行复会扩增，扩增产物用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离。经研究发现这三个STR位点具有高度多态性，扩增产物分子量在190～310bP之间，各位点等位基因数分别为6、9、16个，杂合度78．2％、85，0％、89．0％，个体识别率0．918、0．960、0．905，其累积的个体识别率达0．9997，高于pMCT118等位点，且扩增时间短，操作简便，为法医物证检验提供了一种高效的个体识别手段。     

汉族12个STR位点群体遗传学调查

目的240个汉族无关个体12个STR位点基因频率调查及其法医学应用;方法采用12位点复合扩增及变性聚丙烯酰胺凝胶电泳基因分型;结果该系统12个STR基因位点在汉族人群中均为高识别率位点,特别适合于陈旧血痕检验;结论12位点STR-PCR复合扩增系统检测方法简便,经济实用,在法医个体识别和亲子鉴定中具有应用价值。     

STR系统HUMCSF1PO-HUMTPOX-HUMTH01三位点复合扩增在上海地区的频率分布

STR（ShortTandemRepeat）短串联重复序列多态性又称微卫星（Microsatellite）DNA多态性，通常由某个位点3～7个碱基对的重复数目差异构成，用PCR方法扩增STR位点的技术为个体识别提供了又一有效方法。由于STR片段相对较短（＜500bp），更适用于法医实践中已降解的DNA样品的需要；由于多个STR位点可以复合扩增，又较符合法医检案中DNA样品通常是很微量的实际，因此该技术已广泛地受到法医界的关注。国外已有对HUMTH01、HUMvWA、HUMF13A1、HUMFES等位点的研究报道，国内也已开始了一些工作。我们参照美国Promega公司的方…     

D8S1179位点扩增不平衡

短串联重复（shorttandemrepeat，STR）是目前法医学上个体识别中应用最广泛的遗传标记。STR的分型多数采用扩增片段长度多态性（amplifiedfragmentlengthpolymorphism，Amp－FLP）分型技术。由于各种原因，不同的STR等位基因的PCR扩增效率并不总是相等，使杂合子个体的两个等位基因间可能出现扩增不平衡的现象。本文报道４例D８S１１７９位点扩增不平衡的现象。１材料与方法１．１标本来源４个血样本的DNA用酚／氯法提取。１．２D８S１１７９位点的分型１．２．１聚丙烯酰胺凝胶银染法检测引物按照STRBase（http：／／www．cstl…     

中国德昂族9个STR基因座的遗传多态性

<正> 人类基因组由约30亿个碱基对组成,其中短串联重复序列(Short tandem repeat STR)一般由2～7bp为单位组成核心序列重复排列[1]。人类基因组中每15～20kb就出现1个STR基因座。 聚合酶链式反应分析时,STR等位基因片段大小一般为100～500bp。由于扩增的片段短,可多基因座复合扩增,不仅灵敏度高,而且方便快捷,已广泛应用于个体识别、亲权鉴定、考古、基因诊断等方面,是目前最理想的DNA遗传标记[2]。本研究选择的D3S1358、vWA、FGA、,TH01、TPOX、CSF1P0、D5S818、D13S317、D7S820基因座,个体识别率高,均为美国法庭科学PCR检验金标准位点[3]。本文作     

舟山群岛汉族人群15个STR基因座遗传多态性

本文用荧光标记复合扩增系统对中国舟山群岛汉族人群15个STR基因座进行遗传多态性调查,得到基因频率及法医学参数,为相关法医学工作提供基础数据. 1材料与方法 1.1 样本及DNA提取 220份40岁以上三代皆居住于舟山群岛的汉族无关健康个体血样,其中男性147例、女性73例,取自本实验室前科人员血样本积累.采用常规Chelex-100法[1]提取DNA.     

HUMCYAR04基因座扩增片段长度多态性

HUMCYAR04基因座是Holly等人[1]报道的一个短串联重复序列（STR）基因座。笔者根据本实验室的条件，以中国人为研究对象，进行了此基因座的扩增和频率调查，并用于法医物证常见的血痕、混合斑的检验，取得了较好的效果。材料和方法一、实验材料1．血液取自昆明及玉溪地区191名无关汉族个体的静脉血，构椽酸钠抗凝；2混合斑及组织决、血痕血样实验室办案中积累；3．家系血样自愿者提供；4HUMCYAR04序列[1]：5’GGTAAGCAGGTACTTAGTTAGCTAC－3’；5’－GTTACAGTGAGCCAAGGTCGTGAG－3’。由北京赛百盛（美国）生物工…     

超出等位基因阶梯范围的基因峰与三带型等位基因的鉴别

目前国内外法医学亲子鉴定和个体识别的主要技术方法是短串联重复序列(STR)基因座分型方法[1]。随着技术的不断进步,市场上出现多种商业STR荧光标记复合扩增试剂盒,所标记的STR基因座也在不断增加[2-5]。常染色体上单个STR基因座在PCR扩增正常情况下,纯合子个体的毛细管电泳图谱表现为1个基因峰,杂合子个体表现为2个基因峰。极少数个体的STR分型图谱会出现三带型,即出现3个基因峰[6-9]。法医工作者需要有丰富的经验对在实验中所发现的单个基因座上出现3个基因峰的情况进行分析,并判断3个峰的真实性。     

STR联合扩增鉴定碎尸案1例

聚合酶链反应（PCR）技术于1985年由美国Cetus公司的RandallSaiki、HenryErlich和KaryMullis等联合创建[1]。人类基因组DNA有3×109bp，其中10％是串联重复序列，被称为卫星DNA。卫星DNA按重复单位的长短分为大卫星、中卫星、小卫星和微卫星。其中微卫星重复单位仅由2～7hp组成，故又称为短串联重复序列（STR）。Saihi等人发现人类STR可用PCR方法扩增[2]，并且有高度多态性[3]。作者成功地利用PCR扩增PLA2A、VWA、CYP19、TH01、LPL、D6S366、D19S253、FESFPS八个STR位点对一例碎尸案中尸块做同一认定及尸源鉴定，现…     

印记基因KCNQ1的遗传多态性及在亲权鉴定中的应用

目的为了调查印记基因KCNQ1的STR位点在中国汉族人群中的遗传多态性，利用亲源印记等位基因（parentally imprinting allele，PIA）分型法确定孩子的等位基因亲代来源，为亲权鉴定提供新的侯选STR位点。方法应用Chelex法提取153例佳木斯地区汉族健康无血缘关系个体DNA，用QIAamp Blood Kit（Qiagen）法提取3个家庭10个个体DNA，PCR扩增，凝胶电泳分型，ABIPRISM^TM 3730XL DNA测序仪测序；甲基化敏感性限制性内切酶消化孩子基因组DNA，PCR扩增，确定孩子等位基因的亲代来源。结果发现在中国佳木斯地区汉族人群中KCNQ1基因的STR有7个等位基因，多态信息含量为0．662，且KCNQ1基因的STR位点呈父源印记。结论印记基因KCNQ1的STR位点有很好的多态性，可为亲权鉴定提供新的侯选遗传标记，其亲源特异性甲基化标记有望应用于单亲鉴定中。     

甘肃裕固族人群21个STR基因座的遗传多态性

正短串联重复序列(STR)在人类基因组中分布广泛、多态性高、可复合扩增,已被广泛应用于亲权鉴定、个人识别以及种族识别。由于同一STR遗传标记在不同人群中的多态性分布存在差异,因此,应用于法医学鉴定前,必须通过群体调查获得该群体的基本遗传学参数[1]。本研究对甘肃省肃南裕固族自治县裕固族无关个体的血样进行21个STR基因座的复合扩增,获得该群体21个STR基因座的遗传多态信息,     

海南黎族群体14个STR基因座遗传多态性

STR基因座是建立DNA数据库首选遗传标记,建库需要针对目标人群做了大量的基因频率调查,本文作者应用公安部物证鉴定中心研发的DNATyperTM15试剂盒,对345个海南黎族无关个体14个基因座进行了调查。1材料与方法样本345份无关个体血样取自看守所内在押海南黎族人,采指尖末梢静脉血滴于滤纸上,阴干保存。DNA提取全部345份检材均选用Chelex-100法提取DNA[1]。复合扩增应用公安部物证鉴定中心研发的DNATyperTM15试剂盒,对14基因座进行复合PCR扩增。扩增体系为B ffer 2.0μl,10×primer 1.0μl,Taq酶0.2μl,灭菌水5.8μl,模板DNA 1.0…     

5个Y-STR基因座复合扩增及其单倍型

多个Y STR基因座复合扩增在国内外已得到应用[1、2 ] 。本文作者报道用银染法复合扩增DYS389II、DYS389I、DYS390、GATA A7 2和DYS393等 5个Y STR基因座 ,并对广东汉族 4 15名无关男性个体进行基因分型调查。1　材料和方法1 1　材料4 15份广东汉族无关男性个体血样来自本室日常检案标本 ,用Chelex 10 0法提取DNA。1 2　引物序列DYS389Ⅱ、DYS389Ⅰ、DYS390、GATA A7 2和DYS393等 5个基因座引物序列见文献 [3、 4 ],由上海生物工程有限公司合成。1 3　PCR扩增条件总体积 2 5 μl,内含dNTP 4 2 0 μmol/L ,MgCl23 0mm…     

盐城地区汉族人群15个STR基因座的遗传多态性

本文利用复合STR技术,应用PowerPlex(16System试剂盒对213名盐城地区汉族无关个体进行15个基因座的遗传多态性调查。现报道如下:1材料与方法213名盐城地区汉族无关个体血样,全部为本实验室办案积累。chelex法[1]或硅珠法[2]提取血样DNA,应用PowerPlex(16System试剂盒复合扩增,扩增体系10μl,热循环参数和电泳体系各组份配比按试剂盒所附操作手册设置。主要仪器:ABI9700扩增仪、ABI3100-Avant基因分析仪。对基因型数据作χ2检验。利用PowerStats分析软件对群体数据进行处理,得到15个STR基因座的杂合度(H)、个体识别能力(DP值)、偶…     

SNP-STR遗传标记复合扩增体系的构建及法医学应用

目的筛选并构建与目前STR数据库兼容的SNP-STR遗传标记复合扩增体系,调查其在四川汉族群体中的遗传多态性,并探讨其在混合DNA样本分析中的应用价值。方法以现有商业试剂盒中使用的STR遗传标记为基础,筛选与STR遗传标记相邻的SNP位点并组成SNP-STR遗传标记。运用SNP等位基因设计特异性引物,构建基于等位基因特异性扩增的SNP-STR遗传标记复合扩增体系。调查该体系在四川汉族群体的遗传多态性,并评价不同位点数目的体系对两个体混合DNA样本的检测效能。结果筛选并构建了由13个SNP-STR遗传标记构成的等位基因特异性复合扩增体系。在四川汉族群体中,各位点杂合度为0.76～0.88,累积个体识别率达0.999 999 999 999 999 968。在对两个体混合DNA的分析中:单位点扩增时,混合样本的混合比例达到1 000∶1时依然可以检测到少量成分所特有的分型;多位点复合扩增时,混合比例最大可达500∶1;随着体系中位点数量的增加,对混合DNA中少量成分的检测效能降低。结论SNP-STR遗传标记较STR具有更高的多态性,其构成的复合扩增体系对混合样本的分析效能优于传统的STR复合扩增体系。     

江苏地区汉族人群15个STR基因座频率调查

采用五色荧光标记引物复合扩增技术 ,对江苏地区 12 0名汉族无关个体进行了 15个STR基因座的基因分型 ,旨在为法医学应用提供基础资料。1　材料和方法12 0例无关汉族个体的血样均系本实验室日常检案积累 ;所有样本的DNA均用硅珠法[2 ] 或Chelex[1]法提取后 ,参照AmpF1STRIdentifiler试剂盒 (PE公司 )及ABI310型遗传分析仪的使用说明书进行扩增和检测 ,并分别计算 15个基因座的基因频率、杂合度(H)、个体识别率 (Dp)及多态信息量 (PIC)。2　结果和讨论12 0例无关个体的 15个STR基因座的等位基因频率见表 1。对每个基因座进行 χ2 …     

猫STR基因座复合扩增体系的构建及其法医学应用

目的 构建一个猫STR基因座复合扩增体系并对其技术性能进行测试,评估其应用价值。方法整理和分析猫STR基因座文献数据资料,筛选可用于猫个体识别和亲缘关系鉴定的STR基因座和性别鉴定位点,设计荧光标记引物,构建复合扩增体系。对构建的复合扩增体系进行灵敏度、准确性、均衡性、稳定性、种属特异性、组织同一性和混合样本等验证,并对145例猫无关个体进行群体遗传学调查。结果 成功筛选到16个猫常染色体STR基因座和1个Y染色体性别决定区,并构建了包含上述基因座的复合扩增体系。DNA模板量低至0.25 ng时仍可得到完整分型,检测其他常见动物样本时未见特异性扩增峰。群体遗传学调查结果显示,16个猫STR基因座累积个体识别率为1-3.57×10^-20,累积非父排除率为1-6.35×10^-5,累积匹配概率为3.61×10^-20。结论 本研究构建的猫STR基因座复合扩增体系灵敏度高、种属特异性好、分型结果准确,能够为司法鉴定领域中涉及猫的种属鉴定、个体识别及亲缘关系鉴定等案件提供有效的解决方法。     

河南汉族人群21个STR基因座遗传多态性

正本文采用GlobalFilerTMExpress荧光标记复合扩增系统对河南汉族人群21个STR基因座遗传多态性进行调查,旨在为法医DNA数据库的建立及群体遗传学研究提供基础数据。1材料与方法1.1样本1136例河南汉族无关个体纸质血样取自实验室日常建库积累,男性776名、女性360名。     

牛的13个STR基因座复合扩增体系的构建及法医学验证

目的 构建一套适用于牛进行个体识别和亲子鉴定的STR基因座复合扩增体系,并对其法医学应用性能进行评估。方法 基于数据库筛选了13个多态性牛STR基因座（TGLA126、BT66、BT165、ETH10、CSSM0113、INRA005、BT54、BT61、INRA023、BM2113、G18833、UMN0929、INRA063）,构建了5色荧光复合扩增体系。对复合扩增体系进行了灵敏度、准确性、均衡性、稳定性、种属特异性、组织同一性和混合样本等验证,并在96例牛无关个体样本中进行了群体遗传学调查。结果 本研究成功构建了一套包含13个多态牛STR基因座的复合扩增体系,该体系灵敏度达125pg,检测同一个体的不同组织、重复检测样本均得到一致的分型结果,检测常见动物样本时未见特异性扩增峰,体系可耐受血红素（≤200μM）、腐殖酸（≤150 ng/μL）、尿素（≤24 000 ng/μL）、靛蓝（≤5 000ng/μL）、黑色素（≤400 ng/μL）等PCR抑制剂。13个STR基因座累计个体识别概率为0.999 999 999 97,累计非父排除概率为0.999 926 668 46。结论 ...     

越南北方人群15个STR基因座遗传多态性

应用AmpFISTR IdentifilerTM荧光标记复合扩增系统,对越南北方人群15个STR基因座进行遗传多态性调查,获得了相关的群体遗传学参数,为法医学个体识别、亲权鉴定、DNA数据信息共享,以及人类群体遗传学研究提供基础数据。1材料和方法1.1材料119例越南北部地区的无关个体血纱样本,取自户籍明确的越南广宁省的农民自愿者,其中男性54例,女性65例。1.2方法用Chelex-100法提取样本DNA,按AmpFISTRIdentifilerTMK it说明书,在AB I 9600型热循环仪中进行复合扩增;扩增产物经AB I 3100遗传分析仪毛细管电泳,Data collection 1.01收集信息…