二组分混合DNA样品STR图谱解释

对混合样品STR图谱的结果进行解释。实验模拟二组分DNA混合样品 ,复合扩增荧光检测 10个基因座 ,比较混合样品谱带 ,计算等位基因峰面积比。结果发现 :二组分DNA混合样品的等位基因数增加 ,样品的混合比例不同就出现峰面积的不平衡。在等位基因峰面积比值与样品组分混合比例接近时 ,可由峰面积比值推断混合样品的混合比例。在混合比例为 1∶2 0时 ,基本上检测不到来自少量混合成分的等位基因 ,表现为单一组分图谱 ;在混合比例为 1∶10时 ,含量低的组分的等位基因峰面积接近与主要组分的“Stutter”峰面积 ,与来自主要组分的等位基因峰面积差异很明显。能检出混合样品中少量成分等位基因的最高混合比例为 1∶10     

2人份混合检材STR图谱分析

目的探讨混合检材STR图谱分析结果。方法收集了3例实际案例检材,提取DNA,PCR扩增后用310型遗传分析仪检测。结果当DNA含量差距不大时,2人份混合检材检验结果易于分析,当DNA含量差距较大时或者2人份以上混合检材,图谱分析非常困难。结论根据本文提出的问题和实验结果,当遇到这样的混合样品,分析结论一定要谨慎。     

混合生物样品的组分分析及其STR基因型判定

目的应用荧光标记STR多基因座联合检测技术对混合生物样品较少组分最低比例检出限和STR基因型的判定进行研究。方法 将已知浓度的人标准细胞系DNA:9947A和K562分别按照1:1、1:4、1:9、1:19、1:39、1:59、1:79和1:99比例混合后作为扩增模板,应用Profiler plus试剂盒对D3S1358、VWA、FGA、D8S1179、D21S11、D18S51、D5S818、D13S317、D7S820和性别鉴定基因座检验。结果在比例为1:19时能明确判定两个体各基因座基因型,且两样品基因型结果峰高平均值之比与样品浓度之比正相关。结论应用荧光标记STR多基因座联合检测技术可以对一定比例的混合生物样品进行STR基因型判定,并对其混合比例状况进行大致推断。     

SMART:自主研发的混合STR图谱分析系统

目的混合STR图谱的分析是法医遗传学领域的一个难题。目前国内大多数法医DNA实验室依靠人工方法分析混合STR图谱,费时费力,且拆分效果也多有主观性,难以满足日益增长的混合STR图谱分析的需求。本文介绍一套自主研发的混合STR图谱分析系统——SMART(STR Mixture Analysis and Resolution Tools),其能够实现对混合STR图谱的自动化分析,包括拆分混合STR图谱和计算似然比。方法SMART使用的STR峰高的概率模型,考虑了影子峰、降解、基因座特异性扩增效率、峰高变异、插入峰、峰丢失等因素。模型通过比较各个基因型集合拟合当前混合STR图谱的似然值大小来推断最有可能的基因型集合,采用了马尔可夫链蒙特卡洛(MCMC)算法进行求解。结果SMART可应用于不同试剂盒和遗传分析仪产生的数据。经使用ABI-3500XL遗传分析仪和Global Filer试剂盒测试,SMART能够实现对2~5人的混合STR图谱的分析,输出包括混合比例、混合图谱质量、各个贡献者单人的STR基因分型、似然比等多项结果。结论SMART作为一款自主研发的混合STR图谱分析系统,其基本涵盖了国外同类分析系统所具有的功能,技术性能指标达到国际先进水平,能够满足一线法医工作者对于混合STR图谱分析的多样化需求,提高混合STR图谱结果的利用率。     

荧光标记STR复合扩增检验系统的研究

本研究以化学合成的荧光标记引物建立了STR复合扩增体系,体系I包括4个STR基因座和牙釉蛋白基因,体系Ⅱ包括4个STR基因座,体系Ⅲ包括3个STR基因座.制备了体系I各基因座的等位基因标准对照,测定了各等位基因长度.对代表性等位基因进行了序列测定,确定了等位基因重复单位的重复数目及测量长度与等位基因命名的对应关系,对各基因座等位基因进行了标准命名.建立了复合扩增检验系统等位基因自动分析命名的模板.三个复合扩增检验体系的累积随机匹配概率为8.3×10-3,为遗传学分析建立了实用的检验系统.     

精-血混合斑检出单一STR分型3例

两人或两人以上个体的体液、分泌液混合形成的斑痕称为混合斑。包括精-阴混合斑、精-血混合斑、精-精混合斑及血-血混合斑等。精-血混合斑因与血斑在肉眼观察上无明显差别,有时会被办案单位作为血斑送检,检验人员如果不予注意,可能漏检。笔者在日常检案中遇到3例精-血混合斑,均被办案单位作为血迹要求检验,实验室检出单一STR分型,因与案件情况不符,     

荧光标记短片段STR复合扩增系统的法医学应用研究

目的解决严重降解(低于300bp)DNA检验问题,提高降解DNA的检出率。方法重新设计引物,减小扩增产物片段长度,用荧光标记短片段STR复合扩增体系进行DNA检验,扩增结果与用Identifiler试剂盒扩增出的结果进行比较。结果用荧光标记短片段STR复合扩增系统对实际案件中的高度降解DNA检材进行检验,可以获得满意分型。结论该系统可用于严重降解DNA检材的检验工作。     

荧光标记检测STR复合基因座的应用

自DNA检验应用于法医鉴定以来,经过了十几年的发展,已建立了许多各种各样的方法和技术.STR分析方法虽发展时间不长,但由于其本身特有的特点,如等位基因片段短小,易于扩增,灵敏度高;基因座多,识别力强;对降解DNA能进行分析,可检验腐败陈旧生物检材;易于实现自动分析和计算机管理等,已日益成为日常DNA分析的主要、首选方法.STR分析从单个位点扩增分析到多个位点复合扩增分析,从银染到荧光检测分析,日趋自动化.反过来,检验程序的自动化进一步促进STR技术在日常案件检验中的应用.现荧光标记检测STR复合基因座技术已开始在法医DNA检验中应用并将被广泛采用.本文就其应用中的一些问题进行讨论.     

混合STR分型分析方法研究进展

混合STR分型的解释及分析一直是国际上法医物证领域研究的热点和难点。随着DNA检验技术的发展,案件中检出的混合STR分型呈现出模板量降低以及混合组分数增加的趋势,其解释变得愈加复杂,传统的人工分析方法已难以满足现实要求。近几年国外基于统计算法模型的自动化软件解析方法渐趋成为混合STR分型分析的主要方法。本文综述了混合STR分型分析方法的相关研究进展,包括人工为主的定性分析方法以及基于统计模型的基因型概率分析方法;讨论了混合STR分型分析方法的未来发展趋势以及人工智能技术的应用前景。     

对指甲进行STR检测的可行性

STR(短串联重复序列)是人类基因组中具有高度多态性的遗传标记,它以3～7个bp为基本单元,在同一位点上因重复数的不同而形成不同的等位基因,STR位点因其序列短,扩增成功率高,对降解及微量检材具有特殊价值,因而在法医检验上得到了广泛应用。目前,大部分人体生物样品可通过消化的方式裂解细胞以获取足够量的模板DNA进行STR分型,指甲等硬组织核DNA提取相对困难,没有现成的方法或试剂盒。作者参照Kane等人报道的方法[1,2],通过高浓度的DTT打开角化蛋白中的二硫键使PK得以对指甲进行消化,从而获得核DNA,得到了令人满意的STR分型结果。…     

STR和性别位点PCR产物的荧光自动检测

运用荧光染料标记引物、变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 (denaturingpolyacrylamidegelelec trophoresis,denaturingPAGE)结合荧光法检测6个STR位点 (vWA31A、TH01、F13A1、FES、TPOX、CSF1PO)及1个性别鉴定位点(Amelogenin) ,就荧光自动检测的重复性、准确性、分辩力等方面进行了研究 ,建立了6个STR位点等位基因判定视窗及用荧光DNA测序仪进行STR分析的方法 ,实现电脑自动判读结果。结果表明 ,本文所述STR和性别鉴定的自动检测方法可靠、分辨力高 (可达1bp) ,所得数据有助于荧光自动DNA分型软件系统的数据积累。     

无比对样本的STR混合分型分析策略

目的充分利用数据库的比对功能,指导无比对样本混合分型的分析、数据库比对和比对结果的筛选。方法使用联合包含概率描述混合分型的识别力。利用联合被包含概率来估计被混合分型包含的样本的可靠性。结果混合分型的联合包含概率小于10~(-7)时具备入库比对的价值。混合分型单个基因座上能确定的等位基因大于等于2个时,增加一个额外等位基因,不会过多降低识别力。数据库检索获得多个无容差比中结果后,可以根据联合被包含概率来进行排序,快速找到最有价值样本。     

免疫磁珠法分离混合样本中血液成分的探究

目的 基于免疫磁珠法分离脱落上皮细胞中的白细胞,消除或减弱混合检材中血液来源STR分型对结果分析的干扰。方法 分别取两名不同个体的血液和口腔脱落上皮细胞,按不同比例制备成混合样本作为实验组,并同时制备细胞量相等的对照组。应用免疫磁珠法分离实验组样本中白细胞,并与对照组以相同条件进行DNA提取、扩增、分型,对比两组STR分型结果。结果 当血液量较少时,对照组为混合STR分型,经免疫磁珠法分离混合检材中白细胞后,实验组为单一来源STR分型;当血液量较多时,此时对照组为混合STR分型,但口腔脱落上皮细胞来源的STR分型谱带峰高较低甚至丢失,经免疫磁珠法后,实验组仍为STR混合分型,但口腔脱落上皮细胞来源的STR分型谱带成为主峰;当混合样本中口腔脱落上皮细胞微量,血液占比极大时,此时对照组为血液来源的单一STR分型结果,经免疫磁珠法后,实验组为STR混合分型,包含口腔脱落上皮细胞来源的所有等位基因分型。结论 该方法可用于分离脱落上皮细胞中血液成分,降低血液来源的DNA比例,能够改善此类混合检材中目的细胞的STR分型结果,为刑事案件中含有血迹浸染的混合生物检材的检验提供了一种新思路。     

AGCU免提取STR荧光检测试剂盒的验证

目的考察AGCU免提取STR荧光检测试剂盒．对保存在滤纸片或FTA卡上血液样本的直接扩增检测情况。方法使用人GCU免提取STR荧光检测试剂盒,对未经提取的滤纸片血液样本、FTA卡血液样本675份进行直接扩增和18个基因座的DNA分型,并对结果的可靠性进行研究。结果18个基因座检测结果与PP16和ID试剂盒分型结果一致,2000年数据库样本成功率92．3％,2001年数据库样本成功率92．6％,2004以后年数据样本及案件样本、亲子鉴定样本成功率在99％以上。结论AGCU试剂盒可以成功地对滤纸片、FTA卡样本的18个STR基因座进行直接扩增检测,检验结果稳定,分型准确。     

STR复合扩增及荧光检测技术在个体识别中的应用

目的 :使用 310型遗传分析仪对D3S1358等 10个位点进行基因型检测并应用于法医物证学个体识别案件。方法 :用PCR复合扩增结合四色荧光检测技术对样本DNA进行基因分型。结果 :常见物证检材可成功地得到检验。结论 :这些位点适用于法医物证学个体识别。     

山东地区人群9个STR基因座遗传多态性及频率调查

应用AmpFISTRProfilerPlus试剂盒及377型测序仪对山东地区200例无关个体血样进行了9个STR基因座多态性及频率调查,经X2检验,9个基因座基因频率均符合Hardg-Weinberg平衡定律,家系分析均符合孟德尔遗传规律,并应用于案件检验取得良好效果。     

荧光染料掺入PCR检测STR基因座多态性的研究

目的研究荧光染料掺入PCR检测STR基因座多态性。方法 利用荧光染料掺人PCR扩增技术,测定FABP、CYP19、FOLP23、MBP、DYS19五个基因座的梯阶片段长度,将带有荧光标记物的dCTP通过PCR反应加入到目的片段PCR产物中,通过PE 377 DNA测序仪分离和基因扫描软件分析。结果 获得了清晰、准确的图谱,计算出各基因座中核心序列的重复次数,并按照ISFH标准对各基因座命名。结论 该方法具有灵敏度高、结果客观准确、操作简便、产物定量等优点,在新基因座开发和法医鉴定实践中具有较理想的应用价值和发展前景。     

快速个体识别STR分型技术

DNA-STR分型技术[1]一般包括DNA提取、PCR扩增、电泳分析三个部分,DNA提取需要1 h以上,PCR扩增需要3~4 h,电泳分析需要1 h以上,完整的DNA-STR分型需要6~8 h[2]。进一步缩短DNA-STR分型时间,实现快速DNA分析成为科研攻关的一个新的重点[3-5]。目前,快速DNA分析的研究主要集中在快速DNA提取和快速电泳分型两个部分。在快速     

两种混合STR分型分析软件的比较与应用

随着DNA技术的发展和应用拓广,案件现场生物检材及其提取检验愈受重视、愈显重要性,近年来混合检材的DNA有效检出比例越来越高,混合STR分型的拆分与合理解释也益发成为DNA鉴定技术领域的研究热点与难点。本文主要针对当下国际主流的两款混合分型分析软件——STRmix和云算GPM进行比较研究,就两者的基本信息、理论、分析过程作比较,并结合实战应用和典型案例综合分析两者的异同,希冀为法医DNA工作者提供选用参考和使用依据,也希望能够推动国内混合STR分型分析的发展及与国际交流互鉴。     

混合血样品检测的克隆测序法研究

<正> 在法医生物物证检验的DNA分析中,经常会遇到多个个体的混合血样的检测,如受害人与犯罪嫌疑人的混合血,受害人阴道上皮细胞与犯罪嫌疑人精子细胞或男性上皮细胞的混合斑等。对这类检材