常染色体STR、X染色体STR鉴定姐妹关系一例

法医DNA技术发展至今．利用常染色体STR进行父子、母子亲缘关系鉴定已很常见。但近年来．由于双亲皆无或双亲皆疑时,在认亲、遗产继承等案件中往往需要做同胞关系鉴定。笔者运用PCR—STR技术分别对两女性个体进行常染色体STR基因座、X染色体STR基因座分型,成功为当事人解决姐妹亲缘关系认定。现报道如下。     

X-STR联合常染色体STR用于亲缘关系鉴定1例

1 案例1．1简要案情某年7月27日夜,某乡镇家庭作坊失火。消防救援后,发现3例烧焦炭化的尸体,2例疑似为姐妹,1例疑似为姐姐的儿子．提取各尸体肋软骨和姐妹的父亲鲁某血样要求进行亲缘关系鉴定比对。1．2检验按行业标准GA／T383—2002中Chelex 100法提取基因组DNA,分别用AGCU、X-12、AGCUEx22、AGCU 21＋1（无锡中德美联生物公司）和Identifiler、Sinofiler试剂盒（美国AB公司）,采用10μL体系按照试剂盒说明书进行PCR扩增,扩增产物在3130遗传分析仪（美国AB公司）上毛细管电泳检测,用Gen—eMapperlDv3．2软件进行基因分析。     

常染色体STR鉴定叔侄关系的应用

PCR-STR分型技术,尤其是高度多态性的特征,在特殊的亲缘关系鉴定中也能发挥作用,并且逐渐在各类亲缘关系鉴定中尝试和应用。对于叔侄关系鉴定,除了Y-STR能提供排除信息外,常染色体也能提供排除信息,但仅凭据Y-STR不能确定叔侄关系。因此,检测常染色体STR基因座,根据PI和W值能否确定叔侄关系是一个值得探索的问题。本文将已确定叔侄血缘关系的样本作29个常染色体STR基因座分型,用ITO法计算叔侄亲权关系指数,探讨其中规律以指导检案。1材料与方法1.1样本已确定叔侄血缘关系的40例(20对);无关个体对40例(20对)作为假设叔侄对照。1.2…     

X-STR在常染色体STR匹配的二联体亲子鉴定中应用

亲权鉴定中,一般采用Identifiler或Power Plex 16检测系统对15个常染色体STR基因座进行分型。但15个STR基因座提供的多态信息量有限,在二联体亲子鉴定容易造成误判,而X-STR具有性连锁和交叉遗传等特殊的遗传特性。本文收集5个在15个常染色体STR基因座完全匹配的案例,应用X-STR分型进行分析,评价X-STR分型在二联体亲子鉴定中的应用价值。     

联合应用常染色体STR和X-STR标记鉴定单亲疑难案例

目的通过对常染色体和X染色体遗传标记的检测,探讨单亲疑难案例的鉴定策略。方法提取3个单亲鉴定案例的6份血样,采用Goldeneye 20A试剂盒和AGCU21＋1试剂盒检测常染色体上39个STR基因座,采用自主研制的16重X-STR扩增系统检测X染色体上16个STR基因座。结果用Goldeneye 20A试剂盒检测后发现每个单亲案例均有一个基因座不符合遗传规律,当常染色体STR基因座增加到39个时,案例1累计出现3个矛盾基因座;案例2和案例3均没有出现新的矛盾基因座。X染色体STR分型结果显示案例1有8个矛盾基因座,案例2和案例3无矛盾基因座,与常染色体分型结论相符。结论对于出现单基因座不符合遗传规律的母女、母子、父女单亲案例鉴定,不仅可以增加新的常染色体STR检测,也可以增加X染色体STR的检测,这样在相互验证的同时也能获得更加可靠的鉴定意见。     

增加检测STR和引入参考样本对叔侄关系鉴定的效能分析

目的 基于模拟数据和真实样本的检测结果,探讨增加STR数量及引入不同参考样本对叔侄关系鉴定模型系统效能的影响,为叔侄关系鉴定选择适宜的STR数量和参考样本提供参考。方法 针对引入不同的参考样本构建5种常见的叔侄关系鉴定模型,每种模型分别模拟10 000对叔侄关系与10 000对对应的无关个体在检测19、39、55个STR时的似然比及不同阈值下的系统效能。收集浙江汉族家系样本,使用SiFaSTR^TM23plex身份鉴定系统、Goldeneye^?DNA身份鉴定系统22NC和AGCU 21+1 STR荧光检测试剂盒进行55个常染色体STR分型,计算每种模型在检测19、39、55个STR时的似然比及不同阈值下的系统效能,并与模拟结果进行比较。结果 在同一检测系统下,模拟数据与对应的真实样本的计算结果基本一致。在同一模型中,叔侄关系鉴定的系统效能与检测STR数量呈正相关关系,且引入亲属时的系统效能均较仅对叔侄两个体进行鉴定时有不同程度的提高。引入亲属的优先顺序为叔的全同胞(或母亲)、侄的全同胞(或母亲)。结论 增加检测STR数量和引入已知亲属均可提高叔...     

四川彝族人群15个常染色体STR基因座遗传多态性

应用AmpFeSTR Identifiler荧光标记复合扩增系统,对302例四川彝族人群无关个体15个常染色体STR基因座遗传多态性进行调查,以期为相关研究及应用提供参考. 1材料与方法 1.1 样本及DNA提取 遵照知情同意的原则随机采自四川地区彝族人群无关个体样本302例(女性47名,男性255名).用Chelex-100法提取血液DNA[1].     

应用X染色体STR进行祖母与孙女鉴定1例

亲权鉴定是法医物证鉴定的主要内容之一,一般的三联体（父-母-孩子）和二联体（父亲-孩子或母亲-孩子）能用常染色体STR进行检验鉴定,然而某些特殊亲权鉴定（如缺少双亲的姐妹认亲、同父异母的半同胞姐妹认亲、隔代认亲等）常染色STR难以排除或认定。x染色体STR由于其遗传的特性在上述案例中具有其它染色体无法比拟的优点。本文报道应用X—STR荧光复合扩增的方法认定祖母与孙女亲缘关系1例。     

1066例新疆汉族人群21个常染色体STR基因座遗传多态性分析

目的研究21个常染色体STR基因座(CSF1PO,D3S1358,D5S818,D7S820,D8S1179,D13S317,D16S539,D18S51,D21S11,FGA,TH01,VWA,D2S1338,D19S433,D1S1656,D12S391,D2S441,D10S1248,TPOX,D22S1045,SE33)在新疆汉族人群中的遗传多态性。方法用GlobalFiler^TM R PCR Amplification荧光标记试剂盒对1066例新疆汉族无关个体的DNA进行PCR扩增,3500遗传分析仪电泳分析,用GeneMapper■ID-X v1.4软件分析等位基因片段大小,用Modified-Powerstates和Arlequin v3.5分析软件进行等位基因频率和法医学常用参数统计分析。结果在新疆汉族人群中,21个常染色体STR基因座不存在连锁不平衡现象,基因型分布符合Hardy–Weinberg平衡,共检出282个等位基因和1147种基因型,杂合度期望值(He)范围从0.6291(TPOX)到0.9428(SE33),多态信息含量(PIC)范围从0.5648(TPOX)到0.9393(SE33),累计个体识别率(CDP)>0.99999999999999999999。结论新疆汉族人群21个常染色体STR基因座具有较高多态性,可以用于法医学亲权鉴定和个体识别,也可以用于人类学和遗传学研究。     

北方汉族21个常染色体STR基因座和1个Y染色体STR基因座的群体遗传学调查

目的分析中国北方汉族人群21个常染色体STR基因座和1个Y染色体STR基因座的遗传多态性,为个体识别和亲权鉴定提供遗传学数据。方法用GlobalFiler PCR AmplificationKit荧光标记试剂盒对1081例中国北方汉族无关个体的DNA进行PCR扩增．3500XL遗传分析仪电泳分析,用GeneMapperID-X软件分析等位基因片段大小,用Modified-Powerstates．xls分析软件进行等位基因频率和法医学常用参数统计分析。结果在中国北方汉族人群中．21个常染色体STR基因座的遗传多态性高,杂合度（H）分布在0．604～0．939之间,随机匹配率（MP）分布在0．007～0．206之间,个体识别力（PD）在0．794～0．993之间,非父排除率（PE）在0．296～0．875之间,典型父权指数（TPI）在1．26-8．19之间,多态性息含量（PIC）在0．55．0．94之间：DYS391基因座共检出6个等位基因,GD值为0．4158。结论中国北方汉族人群21个常染色体STR基因座具有较高多态性,可以用于法医学亲权鉴定和个体识别,也可以用于人类学和遗传学研究。1个Y染色体STR基因座和1个Y-InDel遗传标记可以辅助判断被鉴定人性别。     

16个X-STR基因座在河南汉族人群中的法医学应用评估

目的调查16个X-STR基因座在河南汉族人群中的遗传学数据,评估其法医学应用价值。方法应用Goldeneye~(TM)DNA身份鉴定系统17X试剂盒,对河南地区326名汉族无关个体DNA进行PCR扩增,3130xl型遗传分析仪电泳分析,Gene Mapper~ID-X软件分析等位基因片段大小。统计分析16个X-STR基因座的频率数据和群体遗传学参数,并与其他地区已有人群数据进行比较。结果在所检测的16个X-STR基因座中,DXS6800具有中度多态性,其余15个基因座均具有高度多态性。这16个X-STR基因座在女性群体的累积个人识别率为0.999 999 999 999 992,在男性群体的累积个人识别率为0.999 999 996 577 712,在三联体中的累积非父排除率为0.999 999 971,在二联体中的累积非父排除率为0.999 992 574。结论这16个X-STR基因座达到了法医物证学应用要求,尤其对特殊的亲权鉴定案件具有重要的应用价值。     

犬11个STR基因座的遗传多态性

目的调查犬11个STR基因座的群体遗传多态性。方法应用自主构建的犬11个STR基因座（PEZ1、PEZ2、PEZ3、PEZ5、PEZ6、PEZ8、PEZ12、FH2010、FH2054、FH2132和FH2611）荧光复合扩增体系，扩增105只犬的样本，统计各基因座扩增结果，并分析其群体遗传参数。结果11个STR基因座的累积非父排除率和累积个体识别率分别为0．9330621和0．9999999．平均杂和度和平均多态信息含量分别为0．502和0．640。结论该11个犬STR基因座的遗传多态性较好，可以有效用于犬的个体识别和亲权鉴定。     

云南壮族人群15个STR基因座遗传多态性

目的 对600个云南壮族人群15个常染色体短串联重复(short tandem repeat,STR)序列基因座的遗传多态性进行调查,探讨云南壮族群体遗传学特性及在法医学中的应用价值.方法 使用AmpFLSTR? Identifiler? Direct PCR扩增试剂盒对此地区600名壮族无关个体血样DNA进行PCR扩...     

6个新的STR基因座复合扩增体系的建立及应用

目的构建6个常染色体STR基因座的荧光复合扩增体系,应用于法医学DNA检验。方法筛选6个STR基因座D4S2366、D3S3045、D18S1002、D20S481、D22S689、D4S2639,根据复合扩增要求设计引物并采用不同荧光染料进行标记,经过反复调整和优化,建立6基因座荧光复合扩增体系,并用该复合扩增体系对224名华东汉族无关个体进行分型,计算出常用法医遗传学参数。结果使用该荧光复合扩增体系,在224名华东汉族无关个体中,6个STR基因座D4S2366、D3S3045、D18S1002、D20S481、D22S689、D4S2639分别检出7、8、9、10、9、9个等位基因和21、26、21、23、28、32种基因型,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。杂合度（H）分布为0.714～0.808,个体识别率（DP）为0.874～0.934,二联体非父排除率（PED）为0.310～0.453,三联体非父排除率（PET）为0.485～0.628,多态信息含量（PIC）为0.672～0.784,二联体累积非父排除率（CPED）为0.947689,三联体累积非父排除率（CPET）为0.993345,累积个人识别能力（CDP）为0.999999543。结论构建的荧光复合扩增体系具有较高的法医学应用价值,D4S2366等6个常染色体STR基因座在华东汉族群体中均具有高度多态性,可作为常规商品化试剂盒的有效补充,用于突变情形的亲权鉴定以及依据亲权指数值不能明确鉴定意见的亲权鉴定。     

广西地区壮族人群17个STR基因座遗传多态性研究

目的调查广西地区壮族人群17个STR基因座遗传多态性,为法医物证鉴定和群体遗传研究提供基础数据。方法收集2624份广西地区壮族人群无关个体样本采用Chelex-100提取样本DNA,用PowerPlex■18D System试剂盒进行PCR扩增及检测,计算群体遗传学参数。结果17个常染色体STR基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05),共检测出235个等位基因,971种基因型,累积个体识别率(TDP)为0.999999999999999,累积非父排除率(CPE)为0.999999772。结论17个STR基因座在广西地区壮族人群中具有较好的遗传多态性,可以用于法医学中个体识别和亲权鉴定,也可用于群体遗传学及法医学研究。     

STR基因座三带型等位基因的统计学分析

目的探讨STR基因座三带型等位基因的统计学方法。方法对8846份无关个体的静脉血或血痕样本利用磁珠法提取血液DNA,通过复合荧光扩增和毛细管电泳得到STR基因型,采用GeneMapperIDv3．2软件分析STR基因型,并通过直接计数法检测三带型基因型频率,公式计算三带型等位基因频率,并推导三带型统计学分析在亲缘鉴定及个体识别中的公式。结果8846份样本中,共检出4例三带型等位基因和3种三带型基因型。且发现等位基因基因频率的乘积与实际发生率差异具有统计学意义,并成功推导出三带型在亲缘鉴定及个体识别中的公式。结论三带型等位基因某两个等住基因作为整体在群体中遗传的频率可用这两个等位基因频率的乘积进行估算。     

X—STR基因座的法医学应用研究进展

对X染色体的结构特征、遗传特征及其短串联重复序列（STR）基因座在法医学领域的研究历史、现状进行了综述。并分析了X染色体STR基因座在混合斑鉴定和复杂亲子关系鉴定中的应用,以及在法医学领域应用中应注意的问题．如单倍型和连锁不平衡现象等。     

广东壮族群体12个X-STR基因座的遗传多态性

目的 调查广东壮族群体DXS10103等12个 X-STR基因座的遗传多态性.方法 采用Investigator Argus X-12体系对200名广东壮族无关个体（男性100名,女性100名）进行12个X-STR的DNA分型.结果 该群体中12个X-STR基因座共检出143个等位基因,等位基因频率为0.0033～0.6433,等位基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡.DXS10103与DXS10101基因座间存在连锁不平衡.各基因座的多态信息含量（PIC）为0.3944～0.9159,男性个体识别力（DPm）和女性个体识别力（DPf）分别为0.4815～0.9214和0.6441～0.9884,二联体和三联体的平均非父排除率分别为0.2625～0.8501（MECduo）和0.3944～0.9159（MECtrio）.累积男性个体识别力（CDPm）为0.999999998,累积女性个体识别力（CDPf）为0.999999999,累积二联体非父排除率（CMECduo）为0.999998271,累积三联体非父排除率（CMECtrio）为0.999999989.结论 Investigator Argus X-12系统在广东壮族群体中具有高度的多态性,本实验获得的群体数据可用于个体识别及亲缘关系鉴定案件的评估参考.