Y-STR遗传标记在大家系中的突变

目的调查大家系中Y-STR基因座在减数分裂等位基因传递过程中的突变现象。方法收集一个林姓父系家系的163个男性个体口腔拭子样本,采用AGCU Y24荧光检测试剂盒(AGCU Y24体系)进行22个Y-STR遗传标记分型。AGCU Y24体系包含YfilerTM复合扩增试剂盒(Yfiler体系)的全部16个YSTR遗传标记。比较该家系内男性个体两两之间的Y-STR分型差异。结果该林姓家系163个男性个体在Yfiler和AGCU Y24体系分别获得20和30种单倍型,男性个体两两之间单倍型差异率分别为0.9105和0.922 7,平均遗传标记差异数目分别为6.582 1个和9.824 8个。男性个体两两之间的单倍型差异率随着减数分裂次数增多而增加。结论 Y-STR突变会使同一父系男性个体的Y-STR基因分型产生差异,随着减数分裂次数增多差异增加。     

运用法医学二代测序技术侦破19年久冷案

基于Y染色体STR(Y-STR)多态性的男性家系排查技术帮助全国各地破获了诸多冷案积案。然而对于出现明显降解的生物检材,或因检出Y-STR基因座数量过少而无法开展有效排查。STRSeqTyperY68男性家系精细化排查试剂盒,定位于二代测序技术,利用Mi Seq FGx二代测序平台可单管实现52个单拷贝Y-STR基因座、6个二拷贝Y-STR基因座、1个三拷贝Y-STR基因座和1个性别判定基因座的分型检测,并能同时支持STR长度和/或序列多态分型,全部基因座扩增子长度在350bp以下,且其中62个不大于300bp,适用于降解检材的检测。本文报道一起长达19年未破的强奸杀人案,用传统STR检测方法仅得到24个Y-STR基因座分型,部分300bp以上的Y-STR片段未检出,但通过二代测序方法使用STRSeqTyperY68试剂盒完整得到了67个Y-STR和1个性别基因座分型,从而帮助办案单位锁定了嫌疑人所在的男性家系,为案件侦破提供了关键技术支撑。     

家系基因型重建法在单亲祖孙关系鉴定中的应用研究

目的对有参考个体参与的单亲祖孙关系鉴定中家系基因型重建方法的应用及计算思路的选择进行探索研究。方法依据河北汉族人群38个常染色体短串联重复序列遗传学数据,用计算机模拟8000个祖孙家系,选择生母及不同数量父辈个体作为参考样本进行单亲祖孙关系鉴定,应用家系基因型重建法的三种不同计算思路:期望值法、最小概率值法及改良的最小概率值法计算祖孙关系指数(grandparent index, GI),通过诊断实验设定累积祖孙关系指数(combined grandparent index,CGI)界值,并用60例实际案例进行验证。结果父辈参考个体数目显著影响单亲祖孙关系的判定,随着参考个体数目的增加,判定的准确性增加。若以104、10-4作为认定与排除的界值,即使只有1个父辈参考个体,期望值法获得的判定准确度也在90%以上,2个父辈个体参与时准确度达99.8%,而最小概率值法的灵敏度较低,假阴性率较高,改良的最小概率值法介于二者之间。60例实际案例验证结果显示,以期望值法计算CGI值,除有一个单参考个体真家系不能判定外,其余家系均被准确认定或排除。结论在单亲祖孙关系鉴定中,生母及父辈个体参与鉴定时,应用家系基因型重建法可以有效利用更多被检个体的遗传信息,提高鉴定效力;在讨论的三种计算思路内,期望值法能更准确的估计亲缘关系成立的可能性,其效力和安全性均足以满足该类鉴定需求。     

同胞关系法医学鉴定1例

<正>1案例1.1简要案情因出国公证需要,古甲、古乙和古丙(均为化名)三姐妹要求对两两之间的同胞关系进行鉴定。1.2检验方法采集古甲、古乙和古丙3人的血样,用Chelex法提取检材DNA。采用AGCU Expressmarker 22荧光检测试剂盒、AGCU 21+1 STR荧光检测试剂盒和AGCU X19 STR荧光检测试剂盒(无锡中德美联生物技术有限公司)对检材DNA进行PCR复合扩增。     

中国汉族男性家系Y-STR容差规律研究

目的 调查分析常用的35个Y-STR以及累加另24个备选Y-STR基因座在中国汉族男性家系成员及无关个体间的容差分布情况，研究获得不同容差数与间隔减数分裂次数之间的分布规律。方法 收集37个中国汉族男性家系成员283名与100名无关人员血样，利用Yfiler Plus^TM、ZGWZ FSY、Yfiler Platinum、SureID^?PathFinder Plus、Y SUPP Plus试剂盒进行Y-STR分型，分析35个常用Y-STR和总共59个Y-STR分型数据，分别统计家系成员之间和无关个体之间的容差分布情况，并利用贝叶斯公式计算不同容差数的家系成员之间间隔不同减数分裂次数的概率分布。结果 对于35个Y-STR分型，家系成员之间容差分布在0～5个基因座与0～5个步长，97.98%的容差发生在3个基因座以内；0容差的两个体有68.33%概率在间隔6次减数分裂以内，3容差的两个体有74.34%的概率在间隔10次以上。对于59个Y-STR分型，家系成员之间的容差分布在0～7个基因座与0～9个步长，90.56%的容差发生在3个基因座以内...     

应用家系重建鉴定半同胞关系亲权指数计算

在法医物证鉴定中，目前对于半同胞亲缘关系的鉴定还没有统一的技术规范，较为常用的方法是通过ITO法计算两个被鉴定个体之间的半同胞关系指数进行判定，但在部分实际检案中，即使加测更多数量的STR基因座仍不能达到阈值。本文探讨通过家系重建法鉴定半同胞关系，根据被检孩子生母是否参与鉴定，以及缺席鉴定者不同的推测基因型分别推导亲权指数的计算公式，并对其进行了归纳和总结。