D8S1179基因座等位基因丢失现象的研究

目的 探讨在进行STR分型时发生的等位基因“丢失”情况的原因。方法 分别采用Profiler Plus试剂盒和GenBank数据库设计的引物,对D8S1179基因座进行基因分型,并对丢失的等位基因进行测序分析。结果D8S1179基因座丢失的等位基因在第147位碱基出现G-A转换。在中国人群中,该位置出现碱基转换的频率是0.50×10-2(在2013个无关个体中观察到10例无关变异事件)。结论 第147位碱基转换正好位于Prfiler Plus试剂盒中D8S1179基因座的引物结合区域,导致扩增时等位基因丢失。     

基于SNP推测中国汉族人群身高的遗传学研究

目的选取已知与身高关联的31个SNP位点,在1220例中国汉族健康成年人群样本中验证其身高遗传关联性,并构建身高预测模型及评估该模型的推断能力。方法基于多元线性回归及logistic回归分析,在31个SNP位点中验证与中国汉族人群身高相关联的SNP位点;利用质控后的22个SNP位点,采用加权等位基因求和法(weight allele sums,WAS)针对不同身高分类方法建立推断模型。并通过受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic, ROC)及曲线下面积(area under curve,AUC)分别计算推断准确性。结果 7个SNP位点与身高的关联得到验证,其中rs3823418、rs2166898、rs4821083及rs6030712来自东亚人群研究,rs11021504来自中国汉族人群研究,rs3816804、rs3751599在欧洲和中国汉族人群研究中均有报道。四川男性群体二元分类身高预测模型的AUC值为0.67(95%CI:0.55-0.79),稍高于Aulchenko等研究(AUC=0.65),但低于Liu等研究(AUC=0.75,95%CI:0.72-0.79)。结论本研究揭示了身高遗传位点具有人群差异性,筛选与某一群体身高遗传显著相关的SNP位点,结合适当的特征分类方法,有望构建出对该群体推断效果较好的身高模型。     

用等位基因特异扩增技术检测人类补体第八成份C8A DNA多态性的研究

建立补体第八成份蛋白质多态性的DNA检测方法。根据导致C8A多态性的DNA点突变核苷酸差异 ,建立一个检测C8A基因型的特异性扩增方法。采用该法 ,对 10 0份血样本进行检测 ,并同时用传统的检测C8A蛋白质多态性的SDS 凝胶电泳方法进行对照检测 ,结果显示新建立的C8A多态性PCR分型方法不仅快速、灵敏、稳定 ,而且分型结果清晰 ,容易判读 ,适用于法医学中多种检材的C8A多态性分型     

国产遗传分析仪测试专用等位基因标准物的新型制备方法研究

利用定点突变技术,以D2S441基因座为靶位点,通过体外克隆重组的方法建立包含该STR位点重复单位为8-17的等位基因克隆库,调整模板的浓度后,采用荧光标记引物,对上述模板混合物进行复合模板PCR扩增,最终获得了高质量的等位基因分型标准物。测试结果表明,该方法制备的等位基因标准物可完全满足GA118-16A等国产遗传分析仪的测试和验证要求。     

绝经后妇女肾虚证与载脂蛋白E基因多态性的相关性

目的探讨绝经后妇女肾虚证与载脂蛋白E（apolipoprotein E，ApoE）基因多态性的相关性。方法以80例绝经后肾虚证妇女及65例绝经后无肾虚证妇女为研究对象，以ApoE基因为候选基因，运用限制性片段长度多态性检测ApoE基因型。结果肾虚组人群ApoE基因型ε2/ε3、ε2/ε4、ε3/ε3、ε3/ε4和ε4/ε4频率分别为11．25％、8．75％、58．75％、11．25％、10．00％，对照组人群ApoE基因型ε2/ε3、ε2/ε4、ε3/ε3、ε3/ε4、ε4/ε4频率分别为15．38％、6．15％、69．23％、9．24％、0；肾虚组人群ApoE等位基因ε2、ε3、ε4频率分别为10．00％、70．00％、20．00％，对照组ε2、ε3、ε4频率分别为10．76％、81．55％、7．69％；肾虚组ApoE等位基因ε4频率明显高于正常对照组（χ^2=4．386，P〈0．05）。结论ApoE等位基因ε4频率升高与绝经后妇女肾虚证相关，可能是肾虚证的危险因子；ApoE基因型ε4／ε4是绝经后妇女肾虚证一个有用的标志物。