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绵羊PRNP等位基因PCR-SSCP分析条件的优化 总被引:2,自引:0,他引:2
为进行绵羊PRNP等位基因密码子136、154、171的多态性研究,建立适合于绵羊PRNP等位基因开放阅读框(ORF)内高变区PCR-SSCP分析方法,对凝胶浓度、交联度、甘油浓度、电泳电压、电泳时间、PCR产物与变性缓冲液比例、电泳缓冲液浓度、上样量等影响因素进行了优化试验.在优化中引入了正交试验法,以使优化过程简化,结果可靠.结果表明,交联度49:1、甘油浓度0%、凝胶浓度12%、电泳电压200 V、PCR产物上样量≥2.0μL且<4.0μL、PCR产物与变性缓冲液比例1:4、0.5×TBE缓冲液及4℃电泳45 h为最佳试验条件,据此建立了绵羊PRNP等位基因136、154、171密码子的PCR-SSCP分析方法. 相似文献
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目前,国内外亲子鉴定主要采用短串联重复序列(STR)分型方法。常用STR分型试剂盒中的STR基因座多为四核苷酸或五核苷酸STR。正常人常染色体单个STR基因座的等位基因分型表现为纯合子或杂合子,纯合子个体图谱表现为只有1条带或者1个峰,杂合子个体图谱表现为2条带或者2个峰,由于人是二倍体,正常情况下不会出现3条带或3个峰。在极个别情况下,单个STR分型图谱会出现3条带或3个峰,此种情况通常被认为是三带型。本文在2000个(共5000名个体)亲子鉴定或个体识别案例中,共计检出7例三带型等位基因,现报道如下。 相似文献
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目的 为了调查印记基因KCNQl的STR位点在中国汉族人群中的遗传多态性,利用亲源印记等位基因(parentally imprinting allele,PIA)分型法确定孩子的等位基因亲代来源,为亲权鉴定提供新的侯选STR位点.方法 应用Chelex法提取153例佳木斯地区汉族健康无血缘关系个体DNA,用QIAamp Blood l(jt(Qiagen)法提取3个家庭10个个体DNA,PCR扩增,凝胶电泳分型,ABlPRIsMTM3730xL DNA测序仪测序;甲基化敏感性限制性内切酶消化孩子基因组DNA,PCR扩增,确定孩子等位基因的亲代来源.结果 发现在中国佳木斯地区汉族人群中KCNQ1基因的STR有7个等位基因,多态信息含量为0.662,且KCNQI基因的STR位点呈父源印记.结论 印记基因KCNQl的STR位点有很好的多态性.可为亲权鉴定提供新的侯选遗传标记,其亲源特异性甲基化标记有望应用于单亲鉴定中. 相似文献
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PowerPlex^TM16体系OL等位基因序列分析及命名探讨 总被引:3,自引:0,他引:3
目的观察中国汉族人群PowerPlexTM16体系STR基因座分型标准物外等位基因(OL等位基因)的序列组成,探讨其类型及命名。方法应用PowerPlexTM16体系和ABI377或3100遗传分析仪,对10071名中国汉族无关个体的血样DNA进行15个STR基因座的分型,筛选出OL等位基因样本;对该样本进行单基因座扩增、聚丙稀酰胺凝胶电泳、银染显色,获取等位基因条带并再次扩增和测序。结果在11个基因座检见OL等位基因,共32个,频率0.05‰ ̄4.02‰,各基因座OL等位基因数目1 ̄9个不等。按其组成分为四类:(1)重复单位完整重复,但重复次数在ladder范围外;(2)不完整重复;(3)侧翼序列个别碱基的插入或缺失;(4)较大片断的缺失。结论OL等位基因类型不一,既有重复次数的变化,也有侧翼序列或核心序列的变化,现有命名原则尚不能反映其组成类型。 相似文献
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人类D19S40基因座在不同人种中的遗传多态性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
采用PCR技术分析中国汉族、德国人、斯洛伐克人和美国黑人群体D19S400基因座的遗传多态性及世界三大人种之间的差异。四个群体共调查了620人,发现了11个等位基因,观察到47种基因型。各群体观察杂合度为:0.78~0.88,个人识别机率为:0.93850~0.9664。四个群体基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),三大人种(蒙古人种、高加索人种、美国黑人)之间D19S400基因座等位基因频率分布存在极显著差异(P<0.01)。结果显示D19S400基因座在群体遗传学研究和法医学个人识别中有较高应用价值 相似文献
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广东汉族人群15个STR基因座的遗传多态性 总被引:5,自引:0,他引:5
为调查广东汉族人群PowerPlexTM16体系15个STR基因座遗传多态性,并探讨其在法医学检案中的应用价值,应用PowerPlexTM16荧光标记复合扩增系统,对广东地区10071名汉族无关个体的血样DNA进行15个STR基因座的复合扩增,用ABl377或3100遗传分析仪对扩增产物进行分型,统计15个STR基因座的群体遗传学参数和法医学应用相关参数。结果表明PowerPlexTM16体系可满足广东汉族人群法医学的个体识别及亲权鉴定的需要,大样本频率调查能获得更可靠的频率资料。 相似文献