判别分析法在胃癌组织身源鉴定中的应用

目的 评估基于共有基因座数或共有等位基因数的判别分析方法 在胃癌组织身源鉴定中的应用价值. 方法 采用Identifiler 试剂盒对22对新鲜的胃癌组织块及相应身源正常组织块进行STR分型,采用计数法获得胃癌组织中各基因座不同变异类型的变异率和胃癌-身源正常组织对中的全不同基因座数(A0)、半相同基因座数(A1)、全相同基因座数(A2)和共有等位基因数(IAn),将上述参数代入已知的Fisher判别函数,以误判率评价Fisher判别函数对胃癌组织身源认定的效果. 结果 22例胃癌组织中,STR基因型改变(STR genotypic alteration,STRGA)的发生率为3.03%(95%CI:1.46%-5.50%),至少有一个STR基因座出现STRGA者占31.38%(95%CI:13.86%～54.87%).采用基于共有基因座数或共有等位基因数的Fisher判别函数,本组胃癌组织均被认定与相应正常组织来自同一个体,误判率为0.00%. 结论 胃癌组织中STR基因型改变的发生率较高;基于共有基因座数或共有等位基因数的判别函数适用于胃癌组织的身源认定.     

TPOX基因座遗传多态性及三等位基因研究

正常人常染色体单个STR基因座的分型图谱为纯合子个体只有1个峰,杂合子个体有2个峰,一般情况下不会出现3个或多个峰。本研究     

PowerPlex~?21体系基因座等位基因丢失2例

1案例资料 1.1样本来源 全部样本来源于2013年-2015年广东省妇幼保健院法医物证司法鉴定所受理的亲子鉴定案例,共6 700例。签署知情同意书后,采集受检者外周静脉EDTA抗凝血2m L、头发、羊水等用于鉴定分析。     

中国汉族人群21个常染色体STR的遗传多态性

本文对中国汉族608个无关个体的常染色体STR基因座遗传多态性进行调查。结果 21个常染色体STR基因座检出的频率分布在中国汉族人群中均符合Hardy-Weinberg平衡。Globalfiler~(TM)试剂盒所包含的STR基因座具有良好的遗传多态性,对法医学应用和群体遗传学研究具有重要意义。     

D21S11稀有等位基因落入相邻基因座1例

正1案例1.1简要案情建立基因档案,送检血液样本一份。1.2初次检验采用Chelex-100法提取DNA,Amp FSTR~SinofilerTM试剂盒(美国AB公司)进行PCR复合扩增,扩增体系和热循环反应按试剂盒说明书进行,扩增产物在3130xl遗传分析仪(美国AB公司)电泳,Genemapper ID v3.2软件分析结果。D21S11基因座表现为纯合子,D7S820基因座显示为5/8/11三带型,     

汉族12个STR位点群体遗传学调查

目的240个汉族无关个体12个STR位点基因频率调查及其法医学应用;方法采用12位点复合扩增及变性聚丙烯酰胺凝胶电泳基因分型;结果该系统12个STR基因位点在汉族人群中均为高识别率位点,特别适合于陈旧血痕检验;结论12位点STR-PCR复合扩增系统检测方法简便,经济实用,在法医个体识别和亲子鉴定中具有应用价值。     

应用常染色体STR基因座共有等位基因数判别全同胞关系

目的建立基于常染色体STR基因座共有等位基因数的全同胞关系判别标准。方法根据280对全同胞及2003对无关个体Identifiler系统15个STR基因座的分型结果,对15个STR基因座的共有等位基因数（S15）和全同胞指数（FSI）进行统计,应用SAS8.2软件包得出Fisher判别函数并与ITO法结果进行比较。结果全同胞对及无关个体对中共有等位基因数目均符合正态分布。采用Identifiler系统15个STR基因座共有等位基因数进行全同胞关系判别时,判别函数分别为：ZFS=3.26970S15-31.51174和ZUI=1.70058S15-8.52411。用上述判别函数进行全同胞/无关个体关系判别时的平均错判率为0.0298。15个STR基因座共有等位基因数法、CODIS13个STR基因座共有等位基因数法与ITO法判别结果差异无统计学意义。结论应用常染色体STR基因座的共有等位基因数判别全同胞关系简便、可信,易于掌握且不受STR基因座等位基因频率的影响。     

STR基因座等位基因阶梯制备方法尝试

提高PCR-STR分型技术的准确性。采用荧光标记dNTP掺入法,通过DNA自动测序仪分析不同等位基因片段的长度并确定其命名后,建立并比较扩增产物混合-纯化-重扩增法、琼脂糖凝胶电泳-切割回收纯化DNA-重扩增法、非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳-切割回收纯化DNA-重扩增法等3种Ladder制备方法。扩增产物混合-纯化-重扩增法相对较简便、快速、经济。Ladder对照使基因分型数据化,判型准确,重复性好,有利于标准化的实现。     

超出等位基因阶梯范围的基因峰与三带型等位基因的鉴别

目前国内外法医学亲子鉴定和个体识别的主要技术方法是短串联重复序列(STR)基因座分型方法[1]。随着技术的不断进步,市场上出现多种商业STR荧光标记复合扩增试剂盒,所标记的STR基因座也在不断增加[2-5]。常染色体上单个STR基因座在PCR扩增正常情况下,纯合子个体的毛细管电泳图谱表现为1个基因峰,杂合子个体表现为2个基因峰。极少数个体的STR分型图谱会出现三带型,即出现3个基因峰[6-9]。法医工作者需要有丰富的经验对在实验中所发现的单个基因座上出现3个基因峰的情况进行分析,并判断3个峰的真实性。     

应用常染色体STR基因座共有等位基因数认定无名尸1例

某市某公园树林中发现一具腐败的无名女尸,容貌已毁,无法辨认。经勘察,现场遭到很大程度的破坏．没有获得其他现场生物检材和其他有价值的信息。无名女尸的身份鉴定是破获本案的关键,