用VBA语言开发群体遗传学统计分析软件

目的开发适用于短串联重复序列(STR)基因座群体遗传学统计分析的软件,促进和加快STR基因座群体遗传学基础研究。方法选用简单易用的MicrosoftVBAforExcel语言,利用宏功能,开发STR基因座群体遗传学统计分析软件。结果开发建立了基于VBA语言的“群体遗传学分析易”软件,能进行STR基因座群体遗传学分析。结论开发的基于VBA语言的“群体遗传学分析易”软件,具有计算统计功能完善、输入格式兼容性好、使用方便、输出格式清晰易懂的特点,可在国内外STR基因座群体遗传学研究领域推广应用。     

甘肃地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性

本文对甘肃地区汉族无关个体15个STR和Amel基因座遗传多态性进行调查,现报道如下。1材料与方法从甘肃地区2005年检案受害人及嫌疑人中筛选的215份无关汉族个体血样,经Chelex-100法提取DNA,采用Identifiler 16荧光检测试剂盒(按其说明书方法),用9700扩增仪进行复合扩增,3100遗传分析仪Data collection2.0检测收集数据,genemapper3.2软件分析,得到STR分型结果。经统计学分析基因频率、基因型频率、杂合度等基础数据。2结果与讨论甘肃汉族人群体215例15个STR基因座等位基因频率,结果见表1。杂合度(H)及个体识别率(DP)等统计结果见表2。…     

STRtyper-10G系统9个STR基因座突变分析

目的观察和分析STRtyper-10G系统9个STR基因座的突变特点。方法在7 707例肯定亲子关系的案件中,统计使用STRtyper-10G试剂盒（9个STR基因座）检测发现的突变事件,判断突变等位基因的来源,计算各基因座的突变率,分析突变特点。结果在9个基因座上共发现118个突变事件,均为1步突变;平均突变率为1.69×10-3（95%CI 1.40×10-3~2.03×10-3）,各基因座的突变率介于0.78×10-3~2.84×10-3,父、母来源突变比例为9.64∶1;短、中、长等位基因的突变比值约为1∶8∶3,增加和减少重复单位的突变比值为1.29∶1。结论 9个基因座的突变率存在显著差异,实际检案时应结合各基因座的突变率进行PI值计算更为科学。     

双胞胎鉴定10例

双胞胎分为两类：同卵双生和异卵双生。同卵双生子起源于同一个受精卵，受精后，卵裂的产物没有立刻分化，结果发育成两个正常的个体，因此两个体具有完全相同的基因组。异卵双生子是由两个卵子同时或几乎同时发生受精形成的双生子，两个体之间的遗传关系与同胞兄弟姐妹之间的关系相同。双胞胎的发生率为１～３％［１、２］，性别相同约占２／３，其中同性别双胞胎约３／４为同卵双生犤３犦，性别不相同全部为异卵双生。在性别相同的双胞胎中区别是否同卵双生，过去通常检测血型、酶型及HLA，目前常规采用PCR－STR分型技术，可以获得理…     

牙齿的DNA提取及STR分型研究

目的建立有效的牙齿DNA提取方法。方法使用物理及化学方法去除牙齿表面污染物,经脱钙、裂解、纯化从牙粉中提取DNA进行STR分型。结果对96例牙齿检材进行DNA检验,获得STR分型的有94例,在查找尸源的案件中发挥了重要作用。结论本方法操作简单快速,能够显著提高牙齿DNA检验的成功率。     

运用二代测序技术拆分混合STR分型

目的探讨二代测序技术在混合STR分型拆分中的应用。方法对一例强制猥亵妇女案中受害人颈部的拭子和血样作DNA提取,以Precision ID GlobalFiler^TM NGS STR Panel v2试剂盒制备文库,经Ion S5测序仪测序,运用Torrent_Suite_v5.2.1软件进行数据分析后,将检测基因座的序列多态STR分型与长度多态STR分型进行比较。结果在D8S1179、D21S11、D2S441、D2S1338、D10S1248五个基因座发现存在序列特异的等位基因亚型,利用这些亚型对混合STR分型进行了成功拆分。结论二代测序技术提供的等位基因序列信息可对混合STR分型的拆分起到帮助作用。     

混合STR分型分析方法研究进展

混合STR分型的解释及分析一直是国际上法医物证领域研究的热点和难点。随着DNA检验技术的发展,案件中检出的混合STR分型呈现出模板量降低以及混合组分数增加的趋势,其解释变得愈加复杂,传统的人工分析方法已难以满足现实要求。近几年国外基于统计算法模型的自动化软件解析方法渐趋成为混合STR分型分析的主要方法。本文综述了混合STR分型分析方法的相关研究进展,包括人工为主的定性分析方法以及基于统计模型的基因型概率分析方法;讨论了混合STR分型分析方法的未来发展趋势以及人工智能技术的应用前景。     

两种混合STR分型分析软件的比较与应用

随着DNA技术的发展和应用拓广,案件现场生物检材及其提取检验愈受重视、愈显重要性,近年来混合检材的DNA有效检出比例越来越高,混合STR分型的拆分与合理解释也益发成为DNA鉴定技术领域的研究热点与难点。本文主要针对当下国际主流的两款混合分型分析软件——STRmix和云算GPM进行比较研究,就两者的基本信息、理论、分析过程作比较,并结合实战应用和典型案例综合分析两者的异同,希冀为法医DNA工作者提供选用参考和使用依据,也希望能够推动国内混合STR分型分析的发展及与国际交流互鉴。     

对Cofiler体系在亲子鉴定中应用价值的研究

将商品化 Profiler Plus和 Cofiler扩增检测试剂盒用于亲子鉴定案例和无关个体血样的分析。 186例亲子鉴定案中,母－子－假设父三联体 149例,假设父－子二联体 37例。在 149例含双亲和孩子的鉴定中,有 127例认定存在亲生血缘关系,其 RCP值平均为 99.98％;其余 22例排除了被检父为孩子生父,排除机率为 14.77％,排除指标平均为 6.1个。在 37例含单亲及孩子的鉴定中,有 23例认定存在亲生血缘关系,其 RCP值平均为 99.92％;其余 14例排除被检父为孩子生父,排除机率为 37.84％,平均有 5个不吻合的 STR位点出现。若特意省去三人组合案例中的母亲,将其作为单亲案件进行统计,仅检测 Profiler Plus体系的 9个 STR位点时,则 RCP值平均为 99.1959％,案例中 21.51％将不能得出明确的结论。同时检测 Profiler Plus和 Cofiler体系共 13个 STR位点,则案例中 97.31％能排除或认定生父,案例中 2.69％通过补充母亲样本能排除或认定生父。 Cofiler体系中 6个 STR位点的累积排除率达 0.9825。上述数据表明, Cofiler试剂盒在单亲鉴定案件中有着重要的应用价值。     

复合扩增9个STR位点在亲子鉴定中的应用评估

在法医学亲子鉴定中应用复合扩增及四色荧光自动分析技术检测 Profiler plusTM9个 STR位点,一次性获得的信息量大,累计非父排除率达 0.9999。应用于 268例亲子鉴定的结果表明, 9个具有高度多态性 STR基因座的联合检测,能使三联体亲子鉴定的排除结论明确无误。对不排除案例,其 RCP值均可达国际认定标准。对二联体亲子鉴定一般需增加 CofilerTM试剂盒 4个 STR位点检测。