混合血样品检测的克隆测序法研究

<正> 在法医生物物证检验的DNA分析中,经常会遇到多个个体的混合血样的检测,如受害人与犯罪嫌疑人的混合血,受害人阴道上皮细胞与犯罪嫌疑人精子细胞或男性上皮细胞的混合斑等。对这类检材     

基于年龄相关DNA甲基化位点推断河南汉族个体年龄

目的探查中国河南汉族个体与年龄相关的DNA甲基化位点,构建年龄推断模型,进行甲基化和年龄相关性分析。方法采用焦磷酸测序法对ELOVL2、ClOrf132、KLF14、TRIM59和FHL2基因的34个CG位点进行甲基化分析,利用SPSS 23软件的多元回归方法建立模型,对甲基化和年龄相关性做分析。结果除ClOrf132基因3个CG位点的甲基化水平与年龄呈负相关外,其余4个基因的31个CG位点甲基化水平均与年龄呈正相关。多元回归分析表明,年龄与CG位点的甲基化水平存在明显的线性关系,实际年龄与推断年龄偏差在5岁以内的准确度达80%以上。结论本研究构建的河南汉族个体年龄推断模型,有助于通过检测血液等组织的DNA甲基化水平推断个体的年龄范围,具有法医学应用前景。     

法医DNA检测平台研究与应用新进展

介绍了公安部第一研究所GA118系列遗传分析仪在六色光谱技术、中高通道系列仪器、DNA数据分析以及微流控超快速DNA检测仪相关领域研究新进展,同时论述了国内外基于微流控的快速DNA检测仪、NGS新一代DNA测序仪发展现状,分析了各类技术手段的优劣势,对基于sanger测序技术、微流控技术、NGS新一代测序技术的法医DNA检测平台进行了应用前景展望。     

人类基因组计划10年记（上）

2000年6月26日,众多科学家与时任美国总统克林顿在白宫共同宣布;人类基因组计划经过10年的努力,基本完成了对人类DNA的测序工作——人类基因组工作草图正式问世。如今,又一个10年匆匆而过,人类基因组计划是否如人们所期待的那样大展宏图呢？     

媒体声音

龙之DNA：基因组的下一个进展可能发生在中国 在香港新界一个鲜为人知的工业园区内将建成比整个美国DNA测序能力还要大得多的DNA草图,交付使用后将意味着一个强大的集团就要开创生物2．0信息时代,这就是北京基因组研究所（BGI）。     

男性Amelogenin基因座X片段缺失1例

使用Amelogenin基因座进行性别检测是目前检检验性别的主流手段,扩增检测Amelogenin基因座能同时检验X和Y染色体,结果解释简单,X和Y特异谱带之间只有6BP差异,即使严重降解的DNA也不会出现只扩增二个等位基因中的一个等位基因[1]。     

2008～2009年浙江省猪圆环病毒2型全基因组序列的比较和分析

应用PCR方法对2008～2009年采集的99份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征病猪的脾、肺、淋巴结混合组织样本进行猪圆环病毒2型(PCV2)检测,并以组织DNA为模板进行了PCV2的全基因组扩增,克隆后进行了测序。结果显示,2008年与2009年浙江省PCV2的平均阳性率为47.5%,与2004～2006年相比基本持平。随机选取18份阳性病料进行PCV2全基因组测序分析,结果,18个毒株均属于Group1,其中5个毒株(27.8%)属于1A分支,3个毒株(16.7%)属于1B分支,9个毒株(50%)属于1C分支。表明,Group1依然是浙江省PCV2的主导基因型,且1C分支从无到有,并逐渐占据主导地位。     

D18S51基因座等位基因侧翼序列四碱基缺失3例

3例无关人员口腔拭子经DNA提取后采用AGCU EX20、AGCU EX30、VeriFiler Plus和PowerPlex^?21四种试剂盒检测,同一样本在D18S51基因座获得了相差1个重复单元的两种等位基因分型。本文利用Sanger测序法分别对上述3例人员样本的D18S51基因座及上下游区域进行检测。经序列比对,发现3个样本的基因组中D18S51基因座下游chr18:63281892-63281895位置均存在[GTTT]的四碱基缺失。建议针对D18S51基因座设计引物时,应选择在上述碱基缺失位置上游区域进行。     

NGS二联体亲子鉴定2例

<正>1案例1.1案情简况所涉亲子鉴定案例均为个人委托。案例一:委托人为了解母子(母1,子1)亲缘关系要求进行二联体亲子鉴定。案例二:委托人为了解父子(父2,子2)亲缘关系要求进行二联体亲子鉴定。1.2检验方法案例一采用试剂盒STRtyper-21G(海尔施基因科技)进行复合扩增后,共有17个基因座在被检     

基于Ion Torrent PGM~(TM)测序系统的人mtDNA全测序分析

目的应用Ion Torrent PGM~(TM)测序系统对人线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)全序列进行分析检测,研究不同组织间mt DNA序列差异情况。方法通过法医尸体检验采集6名无关个体的组织样本,包括胸腔血液、头发、肋软骨、指甲、骨骼肌和口腔上皮。使用4对引物对线粒体全序列进行扩增,应用Ion Shear~(TM)Plus Reagents试剂盒和Ion Plus Fragment Library试剂盒等构建文库,并在Ion Torrent PGM~(TM)测序系统上进行线粒体基因组全序列测序,并针对异质性位点和在HVⅠ区域突变位点,进行Sanger测序验证。结果所有样本的全基因组mtDNA都扩增成功,6名无关个体分属于6种不同的单倍型,同一个体不同组织之间mtDNA存在异质性差异。异质性位点和HVⅠ区域突变位点采用Sanger测序结果均得到验证。通过Kappa统计方法进行一致性检验后发现,相同个体不同组织的mtDNA序列检验结果仍具有较好的一致性。结论本研究所采用的人线粒体基因组全序列的测序检验方法,可以检测出同一个体不同组织间mtDNA的异质性差异,该差异具有较高的一致性,该结果对mtDNA在法庭科学中的应用具有指导作用。