The Recovery and Analysis of Mitochondrial DNA from Exploded Pipe Bombs*

Abstract: Improvised explosive devices (IEDs) represent one of the most common modes of arbitrarily injuring or killing human beings. Because of the heat generated by, and destruction to, an IED postconflagration, most methods for identifying who assembled the device are ineffective. In the research presented, steel pipe bombs were mock‐assembled by volunteers, and the bombs detonated under controlled conditions. The resultant shrapnel was collected and swabbed for residual cellular material. Mitochondrial DNA profiles were generated and compared blind to the pool of individuals who assembled the bombs. Assemblers were correctly identified 50% of the time, while another 19% could be placed into a group of three individuals with shared haplotypes. Only one bomb was assigned incorrectly. In some instances a contaminating profile (mixture) was also observed. Taken together, the results speak to the extreme sensitivity the methods have for identifying those who assemble IEDs, along with precautions needed when collecting and processing such evidence.     

武汉汉族人群D15S659、D6S2418、D5S1457遗传多态性

利用PCR和PAGE技术,对武汉地区汉族人群D15S659、D6S2418、D5S1457三个STR基因座进行群体调查。1材料与方法1.1样本221例武汉地区汉族无关个体抗凝血样,取自同济医院血库。1.2 DNA提取采用Chelex-100提取法提取血样DNA。1.3 3个STR基本特征和引物参数见文献。1.4 PCR扩增及电泳采用常规DNA-STR银染分型技术,参照文献。     

X染色体STR荧光复合扩增体系的建立及其应用

目的研究X染色体STR在法医学亲权鉴定中的应用。方法利用荧光标记引物复合PCR技术,在同一反应管中同时检测DXS6801、DXS9902、DXS6809、DXS6803、DXS6804和DXS67996个X-STR基因座,采用3100遗传分析仪电泳和GeneMapper IDv 3.1软件进行基因分型。结果本体系同时分析6个X-STR基因座,结果清晰,灵敏度高,重复性好。结论本研究的6个X-STR基因座复合扩增体系,在法医学个体识别特别是女性的亲权鉴定中有重要应用价值。     

引物3'端第二个碱基SNP变异的长度多态性遗传标记检测

目的为了获得引物3'端存在SNP点突变的插入缺失遗传标记rs10644346所有等位基因片段。方法基于等位基因特异性PCR原理,设计一条共用上游引物,二条3’端倒数第二个位置特异性碱基的下游引物。运用该三条引物检测150个无关个体及10例亲子关系已确定的三联体,同时运用其中二条引物(共同上游引物和其中一条下游引物)扩增9例样本。结果三条引物扩增150个无关个体均有清晰扩增片段;10例三联体案例亲代与子代扩增片段均符合孟德尔遗传定律;二条引物扩增9例样本后发现特定片段丢失。结论本次研究设计的三条引物PCR,证明特异性碱基位置除了通常的3'末端,理想条件下3'端的其他位置(如倒数第二个位置)也可以成为有效选择,该三条引物设计方法为检测引物侧翼存在点突变的遗传标记提供了一种新的参考。     

7个Y-STR基因座单倍型及其法医学应用

目的调查7个Y-STR基因座单倍型及其法医学应用。方法利用二组复合扩增体系,(Ⅰ:DYS391、GATA-A4、GATA-A10和GATA-H4;Ⅱ:DYS439、DYS437和DYS434)检测7个Y染色体特异性的STR基因座,并用聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染显色技术进行基因分型。结果在广东汉族372名无关男性个体中,二组7个基因座分别检出5、7、6、5和6、4、4个等位基因,共检出254种单倍型,其中201种为唯一的。单倍型基因多样性为0.9960。结论7个Y-STR基因座具有很高的识别能力,对建立Y染色体STR数据库,研究群体遗传学和进行法医学鉴定有重要意义。     

DYS385检测方法的改进

目的建立检测DYS385的新方法。方法比较基因数据库(GDB)中推荐的引物和Schneider所设计的引物扩增DYS385的效果;在此基础上,以GDB推荐的引物作为外引物,Schneider所设计的引物作为内引物,通过调整内、外引物的浓度,优化扩增条件,建立DYS385的半巢式PCR体系。结果与常规方法相比,采用Schneider所设计的引物扩增DYS385,扩增片段缩短112bp,电泳分离的效果好,灵敏度提高2倍,达500pg;建立的半巢式扩增方法,能特异性扩增短片段,灵敏度提高20倍,达50pg。结论建立的DYS385半巢式扩增方法具有更高的特异性和灵敏度,适合法医学应用。     

Usefulness of dura mater in providing DNA samples for identifying cadavers

We examined the usefulness of the dura mater in identifying human remains. Dura mater was collected from 50 cadavers, including drowned, charred, and mummified remains. The STR genotype using the AmpFlSTR Identifiler Kit could be typed at 15 STR and amelogenin loci in 30 samples of 33 cases. Furthermore, the ABO genotype and amelogenin using gel-based methods could be typed in 44 samples of 50 cases. In cases with successful typing of STR, ABO-DNA, and amelogenin, the longest time after death was from 12 to 26 days in a drowned body. The minimum quantity of dura mater required for DNA extraction was about 2.5 mg, dried and fixed by ethanol, in a cadaver 15 h after death. The state of the DNA from the dura mater from the calvaria may be better than that from the basis cranii interna. We found that DNA from dura mater is one of the most useful samples for forensic identification.     

多色荧光STR检测试剂盒的研制与验证

目的建立18个基因座的PCR扩增检测试剂盒。方法采用两个多重PCR体系和四色荧光素标记技术,对Amelogenin和17个STR基因座(D3S1358、vWA、FGA、D8S1179、D21S11、D18S51、D5S818、D13S317、D16S539、TH01、TPOX、CSF1PO、D7S820、D2S1338、D19S433、D12S391和D19S253)进行基因型检测,并对其可靠性、稳定性、效能等进行研究。结果通过2个多重PCR扩增体系,可以成功地对各类生物学检材的Amelogenin和17个STR基因座进行检测,且可靠、稳定、高效。结论本研究所研制的试剂盒,是对该18个基因座进行检测的高效、稳定、可靠的新体系。     

片段长度差异等位基因特异性PCR——一种改良的SNP分型新方法

目的建立一种基于等位基因特异性PCR原理的改良SNP分型新方法:片段长度差异等位基因特异性PCR,并考察特异性引物的3'端第3位、第4位碱基错配对特异性延伸的影响。方法以SNP位点rs759117和rs760887为例,设计两条长度不同、3'末端分别与SNP两个等位基因碱基配对的上游引物,同时在两个等位基因特异性引物3'端第3或第4位碱基引入错配以增加特异性,下游为公用引物。PCR产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染显带后确定样本的基因型。结果不同SNP纯合子为长度不同的单一谱带,杂合子则为两条带,其结果与直接测序完全一致。两条特异性上游引物3'端第3或第4位碱基引入错配后非特异性延伸显著减少,且对PCR反应条件的严格性要求明显降低。结论片段长度差异等位基因特异性PCR是一种简单快速而有效的SNP分型新方法;两条特异性引物3'端第3、第4位碱基引入错配可使特异性显著增加     

广东地区汉族人群 13个 STR基因座的频率调查

目的调查广东地区汉族无关个体的 13个 STR基因座（ D3S1358、 vWA、 FGA、 D8S1179、 D21S11、 D18S51、 D5S818、 D13S317、 D7S820、 D1 6S539、 TH01、 TPOX、 CSF1PO）多态性,研究其在法医学检验中的应用价值。方法用 AmpFlSTR Profiler Plus及 Cofiler二个荧光标记系统对新鲜血样进行 13个基因座的复合扩增,用 ABI 377-96全自动测序仪对扩增产物进行检测,用 GenoTyper软件进行基因分型。结果 13个基因座 PIC >0.5,DP >0.76,家系调查符合孟德尔遗传规律。结论含有 13个 STR基因座的二个荧光标记复合扩增系统可满足法医物证学的个体识别及亲权鉴定的需要。