基于miRNA相对表达量自动判别月经血和外周血

目的探索有效区分月经血和外周血的miRNA最优标记组合及最佳分类模型,并构建简便快速的自动化判别软件。方法对10种miRNA(miR-451a、miR-205-5p、miR-203a-3p、miR-214-3p、miR-144-3p、miR144-5p、miR-654-5p、miR-888-5p、miR-891a-5p、miR-124-3p)在200余份月经血和外周血样本中的相对表达量以实时荧光定量PCR检测,并以7种算法模型(核密度估计、K-最近邻、逻辑回归、线性判别分析、支持向量机、神经网络、随机森林)进行数据分析,选出鉴别效果最好的标记组合及算法模型,进而构建自动判别软件。结果月经血和外周血中差别最大的三种miRNA为miR-205-5p、miR-203a-3p和miR-214-3p,使用miR144-5p与上述miRNA中的一种或两种组合可达较好区分效果,其中基于miR-144-5p、miR-203a-3p和miR205-5p所形成的“最优特征项组合一”稳健性最强。7种算法模型中最佳分类模型为核密度估计模型,其次为逻辑回归模型。结论本研究建立的自动判别软件界面友好、使用简单,适合辅助法医检验关于月经血和/或外周血判别分析的计算,便利于法医物证工作,有较大的推广应用价值。     

基于年龄相关DNA甲基化位点推断河南汉族个体年龄

目的探查中国河南汉族个体与年龄相关的DNA甲基化位点,构建年龄推断模型,进行甲基化和年龄相关性分析。方法采用焦磷酸测序法对ELOVL2、ClOrf132、KLF14、TRIM59和FHL2基因的34个CG位点进行甲基化分析,利用SPSS 23软件的多元回归方法建立模型,对甲基化和年龄相关性做分析。结果除ClOrf132基因3个CG位点的甲基化水平与年龄呈负相关外,其余4个基因的31个CG位点甲基化水平均与年龄呈正相关。多元回归分析表明,年龄与CG位点的甲基化水平存在明显的线性关系,实际年龄与推断年龄偏差在5岁以内的准确度达80%以上。结论本研究构建的河南汉族个体年龄推断模型,有助于通过检测血液等组织的DNA甲基化水平推断个体的年龄范围,具有法医学应用前景。     

PrepFilerTM提取甲醛固定石蜡包埋组织检测STR分型1例

1案例1.1简要案情2004年7月某日下午,张某(女,25岁,小区内业主)与杨某(男,57岁,小区公用车棚门卫)因故吵架,杨某倒地后死亡。法医病理检验显示,杨某系冠状动脉粥样硬化性心脏病而死亡。死者家属不服死因结论,多次上访,8年后有关部门将死者心肾器官的石蜡包埋病理组织送至DNA实验室要求检验鉴定。1.2检验过程及结果取石蜡包埋组织适量,放入1.5 m L的离心管中,     

基于ITS2条形码序列对新型“香料”毒品植物成分的研究

目的应用DNA条形码片段ITS2对新型毒品样品中的植物成分进行分析。方法提取可疑毒品样本"spike99","K2","7号"中的植物基因组DNA,用ITS2通用引物进行扩增,对扩增产物进行测序,对序列校对拼接,应用BLAST方法在NCBI数据库中比对。结果 "spike 99"、"7号"各得到1条ITS2基因序列,"K2"得到2条ITS2基因序列,分别与紫花苜蓿、大麻、啤酒花、黄蜀葵的ITS2基因序列的同源性为100%。结论应用条形码技术可以成功分析新型毒品中的植物种属,为案件中植物样本的种属鉴定提供方法。     

河南汉族人群23个Y-STR基因座遗传多态性

<正>人类Y染色体是男性特有,呈父系、单倍型遗传特征,在法医学检验中作用独特。本研究采用Power PlexY23荧光标记复合扩增系统(美国Promega公司),对河南汉族人群23个Y-STR基因座的遗传多态性进行调查,旨在为法医学应用及群体遗传学研究提供基础数据。1材料与方法1.1样本1 100例居住于河南、无父系亲缘关系的汉族男性个体的纸质血样取自实验室日常检案积累。     

手套印 DNA 检验在侦查破案中的应用

随着犯罪嫌疑人反侦查意识的提高,犯罪嫌疑人戴手套作案的情况越来越常见,手套印成为犯罪现场越来越多见的微量生物痕迹之一。如何从此类痕迹中获取犯罪嫌疑人的有效信息、为侦查破案提供有效线索具有重要意义。2012—2013 年,杭州市公安局DNA 实验室受理检验手套印拭子类检材共1 538 份,获得有效STR 分型146 份,有效检出率为9．5%。在入库的 146 个STR 分型中,有61 个STR 分型直接比中犯罪嫌疑人,比中率为48．6%,远高于数据库平均比中率。笔者结合本地应用情况,对犯罪现场的手套印从勘验、DNA 的转移提取及DNA 检验环节进行总结,供同行参考。     

法医 STR 的快速检验方法

以 STR 复合扩增检测为代表的法医 DNA 分型技术以其灵敏度高、核心序列小、可复合扩增、方法易于标准化等优势,已经成为当前法庭科学 DNA 检验的主要手段,在各国刑事案件侦破和民事案件解决中发挥了重要的作用。本研究在国内外实验室法医 STR快速检验方法[1]的基础上,从生物物证 DNA 免提取扩增检验、生物物证 DNA 快速提取检验、生物物证 DNA快速扩增、利用新型检测设备快速检测及使用 Gen-eMapper ID－X 软件快速分析5个方面进行归纳。     

15个基因座复合扩增体系的建立及新疆维吾尔族遗传多态性

目的建立15个基因座五色荧光复合扩增体系,并调查新疆维吾尔族的遗传多态性。方法筛选STR基因座,等位基因测序后按照重复序列重复次数命名,对建立的15个基因座五色荧光复合扩增体系进行灵敏度、种属特异性、同一性及稳定性检测,对新疆维吾尔族群体进行遗传多态性分析,与西藏藏族、岫岩满族、广州汉族进行群体间比较。结果建立了15个基因座复合扩增体系,检测灵敏度为0.3 ng,具有良好的种属特异性、同一性和稳定性。新疆维吾尔族13个常染色体STR基因座的基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡,无连锁不平衡现象,大部分基因座在群体间差异具有统计学意义。结论建立的体系具有法医物证学应用价值,13个常染色体STR基因座在新疆维吾尔族群体多态性高,适合于亲子鉴定及个人识别,可作为现有基因座的补充。     

X染色体STR和InDel在亲缘鉴定中的应用1例CSCD

1案例两位女性因怀疑彼此为同父异母姐妹,委托本中心进行DNA检验,判断她们是否符合同一父亲的遗传条件。经了解,她们的父母均已过世。接受委托后,本中心采集当事人指尖血备检。     

亲子鉴定热的冷思考

作为分子遗传学应用产物的亲子鉴定．在司法领域已经给我们带来很多的惊喜，解决了很多司法难题．有时甚至是一些难以查询线索或者仅有孤证的悬案．在法医生物学家的帮助下都迎刃而解。然而，正是由于亲子鉴定技术的特殊性对人们认知局限性的这种补充作用．导致普通老百姓、律师甚至法官对亲子鉴定技术结论的过分依赖；也由于亲子鉴定技术的高科技含量直接带来的经济效益，使得这项技术逐渐成为许多法定鉴定机构甚至无司法鉴定资质的实验室也乐此不疲地开展这项业务。