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印记基因H19上游高甲基化区SNPs多态性研究 总被引:2,自引:1,他引:1
目的建立简单、高效的DNA甲基化标记和SNPs联合检测技术,并用于H19基因上游高甲基化区两组SNPs群体遗传学检测。方法用PCR—DGGE技术对232例武汉汉族无关个体H19基因上游启动子区H19FR1和H19FR2单倍型进行检测;同时选用两种甲基化敏感的限制酶(msRE)HpaⅡ和HhaⅠ,检测H19FR等位基因亲代来源。结果H19FR1区检出5种单倍型、9种表型组合,其个体识别能力(DP)、多态性信息含量(PIC)和非父排除率(PE)分别为0.803、0.58和0.322;H19FR2区检出2种单倍型、3种表型组合,其DP、PIC和PE值分别为0.626、0.37和0.162。测序结果显示,片段H19FR1含有a7342g、a7357g和g7547a3个SNPs与1个g7351c点突变;H19FR2仅含aS097g1个SNP。msREHpaⅡ或HhaⅠ可消化个体母源等位基因,PDP-DGGE分析仅能检测到父源等位基因。结论PDP-DGGE是一种简单、灵敏、高效的DNA甲基化标记和SNPs联合分析技术,其在进行多态性分型同时还可以确定等位基因的亲代来源,具有较高的法医学应用价值。 相似文献
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错配引物诱导酶切技术检测GC多态性 总被引:1,自引:0,他引:1
目的探讨建立检测GC点突变rs7041的引物错配诱导酶切技术(mismatch primer-induced RFLP,MPIR)及应用价值。方法针对GC基因点突变(NCBI Reference SNP ID:rs7401),设计错配引物进行PCR扩增,引物错配碱基结合GC点突变诱导XhoI酶切,产生GC-rs7041片断长度多态性,并调查183例温州汉族无关群体GC-rs7401多态性。结果引物错配诱导酶切技术对GC-rs7041亚型的3种基因型分型明确。温州地区汉族人群GC-rs7041 T/G基因频率分别为0.787和0.213,基因型频率分别为T/T0.685、T/G 0.284和G/G 0.071,Ho(0.284)、He(0.337)、PIC(0.279)、DP(0.502)、PE(0.140),基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。结论成功建立引物错配诱导酶切技术检测GC-rs7041单核苷酸多态性,该位点多态性有实际应用价值。 相似文献
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D. Argac O. Bulbul M.S. Shahzad E. Acar H. Altuncul G. Filoglu 《Forensic Science International: Genetics Supplement Series》2009,2(1):99-101
In some forensic cases, nuclear DNA is degraded and cannot be analyzed. In such a case mitochondrial DNA (mtDNA) is usually used in forensic cases for identification because of its special features as high number of copies per cell, maternal inheritance and high mutation rate. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) represent the most abundant class of human polymorphisms. The aim of this study was optimization of 10 mtDNA SNPs by using SNaPshot minisequencing technique on ABI310 genetic analyser in forensic molecular genetics laboratory. At the end of this study, the optimization of minisequencing technique was done by changing some assay parameters. Also, during the optimization of 10 mtSNP loci in our laboratory. 相似文献
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中国4个群体VDR基因2号外显子的SNP基因座遗传多态性 总被引:2,自引:0,他引:2
目的 调查中国北方汉族、维吾尔族、藏族和哈萨克族群体维生素D受体基因2号外显子SNP基因座的遗传多态性和群体差别。方法 应用PCR-RFLPs和DNA序列分析技术对271例个体的DNA样品进行分型。结果等位基因ACG的频率最高,分布在0.57~0.72之间。藏族与维吾尔族基因型ACG/ATG的频率超过0.5,汉族基因型ACG/ATG与ACG/ACG的频率均为0.3976;哈萨克族基因型ACG/ACG的频率达到0.5769。DP值与EPP值在4个群体中均超过0.56和0.16。基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡,并在4个群体间有一定程度差异。结论 维生素D受体基因2号外显子SNP基因座具有较高的多态性,并具有一定的群体差别。 相似文献
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法医DNA检验在实际工作中发挥了重要作用,其中针对Y染色体进行的DNA检验,可以开展家系排查和辅助父系亲缘鉴定,为案件侦查提供重要线索。本文针对Y染色体DNA检验,讨论完整利用染色体具有的信息,制定整体检验策略,以期为相关研究和试剂盒开发研制提供参考。 相似文献
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