| TaqMan探针技术用于X-SNP位点的分型 |
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| 引用本文： | 张素华,李莉,李成涛,赵书民. TaqMan探针技术用于X-SNP位点的分型[J]. 法医学杂志, 2010, 26(1): 22-25. DOI: 10.3969/j.issn.1004-5619.2010.01.007 |
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| 作者姓名： | 张素华 李莉 李成涛 赵书民 |
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| 作者单位： | 1. 苏州大学医学部法医学系,江苏,苏州,215123;司法部司法鉴定科学技术研究所,上海市法医学重点实验室,上海,200063
2. 司法部司法鉴定科学技术研究所,上海市法医学重点实验室,上海,200063 |
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| 基金项目： | 上海市自然科学基金资助项目(08ZR1419800) |
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| 摘 要： | 目的建立一种基于TaqMan探针技术的快速、准确且经济的实时荧光PCR方法,用于检测X染色体上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)。方法选择X染色体上的13个SNP位点(X-SNP),针对每个位点分别设计1对PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增,对X-SNP位点进行分型。结果13个位点均符合Hardy-Weinberg平衡;多态信息含量分布为0.3497～0.3750,杂合度为0.4537～0.5021。建立的方法能够用于X-SNP位点的基因分型,检测结果与DNA测序结果完全一致。结论基于TaqMan探针技术的等位基因特异的实时荧光PCR方法灵敏、简单、快速,可实现对X-SNP位点的分型检测;所选择的13个X-SNP位点具有高信息量,在法医遗传学中具有潜在的应用价值。
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| 关 键 词： | 法医遗传学 多态性 单核苷酸 X染色体 TaqMan探针 |
X-SNP Genotyping Using the TaqMan Probe Technology |
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| ZHANG Su-hua,LI Li,LI Cheng-tao,ZHAO Shu-min. X-SNP Genotyping Using the TaqMan Probe Technology[J]. Journal of Forensic Medicine, 2010, 26(1): 22-25. DOI: 10.3969/j.issn.1004-5619.2010.01.007 |
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| Authors: | ZHANG Su-hua LI Li LI Cheng-tao ZHAO Shu-min |
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| Affiliation: | 1.Department of Forensic Medicine;Medical College of Soochow University;Suzhou 215123;China;2.Shang-hai Key Laboratory of Forensic Medicine;Institute of Forensic Science;Ministry of Justice;P.R.China;Shang-hai 200063;China |
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| Abstract: | Objective To develop a rapid,accurate and economical real time fluorescence PCR method with TaqMan probe technology to detect the X chromosome single nucleotide polymorphism(X-SNP).Methods Taq-Man probes and polymerase chain reaction primers were respectively designed according to the 13 X-SNP.Then,the X-SNP were genotyped after the amplification by real time fluorescence PCR.Results All the loci follow the Hardy-Weinberg equilibrium.The polymorphic information content for 13 distinct loci varied between 0.... |
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| Keywords: | forensic genetics polymorphism single nucleotide X chromosome TaqMan probe |
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