| 猪源乙型脑炎病毒HEN0701株全基因组的分子特征 |
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| 引用本文： | 郑浩,孙春清,袁世山. 猪源乙型脑炎病毒HEN0701株全基因组的分子特征[J]. 中国兽医科学, 2011, 0(5) |
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| 作者姓名： | 郑浩 孙春清 袁世山 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院上海兽医研究所猪传染病研究室; |
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| 基金项目： | 上海市重点科技攻关项目(09391910800); 上海市自然基金项目(11ZR1446200) |
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| 摘 要： | 将乙型脑炎病毒HEN0701株基因组RNA分4段进行RT-PCR扩增,并克隆入pCRⅡ-Blunt-TOPO载体中,测定全长cDNA序列。以MapDraw软件分析了乙型脑炎病毒HEN0701株的基因组结构,并将病毒基因组分成2个非编码区和10个基因,比较了HEN0701株和11株乙型脑炎病毒在全基因组和各基因的核苷酸及推导氨基酸的同源性。以MEGA5软件绘制HEN0701株和11株病毒C、E、NS3、NS5基因的进化树。结果显示,HEN0701株全基因组为10 965 nt,包含一长10 299 nt的开放阅读框。在核苷酸水平,HEN0701株与GⅠ分离株的全基因组和各基因的同源性均高,而与GⅢ分离株则较低;而在氨基酸水平,HEN0701株与GⅠ分离株在多聚蛋白和各病毒蛋白的同源性和HEN0701株与GⅢ分离株的相近。进化分析显示,不同基因进化树的拓扑结构相近,12株病毒的C、E、NS3、NS5基因进化方向相同,GⅠ分离株和GⅢ分离株间C基因进化距离最近。
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| 关 键 词： | 乙型脑炎病毒 全基因组 序列分析 |
Molecular characterization of complete genome of Japanese encephalitis virus HEN0701 strain isolated from swine |
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| ZHENG Hao,SUN Chun-qing,YUAN Shi-shan. Molecular characterization of complete genome of Japanese encephalitis virus HEN0701 strain isolated from swine[J]. Chinese Veterinary Science, 2011, 0(5) |
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| Authors: | ZHENG Hao SUN Chun-qing YUAN Shi-shan |
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| Affiliation: | ZHENG Hao,SUN Chun-qing,YUAN Shi-shan(Department of Swine Infectious Disease,Shanghai Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Shanghai 200241,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Japanese encephalitis virus complete genome sequence analysis |
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