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基于大鼠心肌组织mRNA表达谱筛选冠状动脉性猝死相关生物标志物
作者姓名:郭相杰  李昊  白雅琴  吴鹏  赵春梅  董祎铭  陈念念  贠克明  高彩荣
作者单位:山西医科大学法医学院
基金项目:国家自然科学基金资助项目(81971790);
摘    要:目的 探寻冠状动脉性猝死(sudden coronary death,SCD)大鼠心肌组织信使RNA(messenger RNA,mRNA)的差异表达,为SCD的法医学鉴定提供思路。方法 建立SCD大鼠模型,利用二代测序技术进行转录组测序;用R软件limma包筛选SCD大鼠心肌组织中差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),使用STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件对DEG构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并基于cytoHubba插件筛选相关hub基因。用R软件clusterProfiler包对筛选到的DEG进行生物学功能和信号通路富集分析。结果 共有177个DEG与SCD相关,主要参与肾素-血管紧张素系统、PI3K-Akt信号通路等。血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)、补体成分4a(C4a)、Fos原癌基因(Fos proto-oncogene,FOS)等基因在SCD的发生发展过程中发挥关键作用。结论 AGT、C4a、FOS等基因有望成为鉴定S...

关 键 词:法医病理学  冠状动脉性猝死  信使RNA  差异表达基因  生物标志物  心肌缺血  死亡原因  大鼠
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