| 鲁道夫对盲囊线虫C新种的ITS rDNA序列测定及种系发育关系分析 |
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| 引用本文： | 张媛,林瑞庆,赵光辉,袁子国,宋慧群,朱兴全. 鲁道夫对盲囊线虫C新种的ITS rDNA序列测定及种系发育关系分析[J]. 中国兽医科学, 2009, 39(4) |
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| 作者姓名： | 张媛 林瑞庆 赵光辉 袁子国 宋慧群 朱兴全 |
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| 作者单位： | 1. 华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642;中国农业科学院,兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,甘肃,兰州,730046
2. 华南农业大学,兽医学院,广东,广州,510642 |
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| 基金项目： | 家畜疫病病原生物学国家重点实验室(中国农业科学院兰州兽医研究所)开放基金，教育部长江学者和创新团队发展计划创新团队项目，广东省自然科学基金团队项目 |
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| 摘 要： | 以鲁道夫对盲囊线虫C种为研究对象,对其rDNA的内转录间隔区(ITS)序列进行PCR扩增、测序和序列分析,以Clustal X 1.81程序对序列进行比对,然后用MEGA4.0程序的MP法和NJ法及PUZ-ZLE 4.1程序的ML法构建鲁道夫对盲囊线虫A、B、C种以及北方对盲囊线虫的种系发育关系.结果显示,鲁道夫对盲囊线虫C种的ITS-1,5.8 S,ITS-2序列大小分别为451 bp、127 bp和277 bp,鲁道夫对盲囊线虫3个种与北方对盲囊线虫ITS序列种内差异小,种间差异明显.种系发育关系分析发现,这3种方法(NJ法、MP法和ML法)构建的种系发育树的拓扑结构基本一致,其中C种和A种聚在一起,构成一支,再和B种聚在一起;北方对盲囊线虫单独成一支.研究结果证明鲁道夫对盲囊线虫C种确为一新种.
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| 关 键 词： | 鲁道夫对盲囊线虫C种 内转录间隔区 种系发育关系分析 |
ITS rDNA sequencing and phylogenetic analysis of the new species Contracaecum rudolphii C (Nematoda : Anisakidae) |
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| ZHANG Yuan,LIN Rui-qing,ZHAO Guang-hui,YUAN Zi-guo,SONG Hui-qun,ZHU Xing-quan. ITS rDNA sequencing and phylogenetic analysis of the new species Contracaecum rudolphii C (Nematoda : Anisakidae)[J]. Chinese Veterinary Science, 2009, 39(4) |
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| Authors: | ZHANG Yuan LIN Rui-qing ZHAO Guang-hui YUAN Zi-guo SONG Hui-qun ZHU Xing-quan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | rDNA |
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