基于线粒体DNA和核DNA遗传标记的中华鲟种属鉴定

目的 构建一种基于线粒体DNA和核DNA遗传标记的中华鲟及其潜在杂交种的鉴定方法。方法 根据美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information, NCBI）已公布的中华鲟cytb基因序列设计引物，并选用鲟鱼单拷贝核基因fam43a扩增引物对中华鲟DNA进行扩增与测序,其中对fam43a基因扩增产物进行TA克隆测序。通过BLAST序列相似性检索确定样本来源，并基于邻接法构建鲟形目系统进化树。结果 中华鲟样本测序所得cytb和fam43a基因序列长度分别为728 bp和730 bp，且10个克隆群所测fam43a基因序列完全一致。基本局部比对搜索工具（basic local alignment search tool, BLAST）序列相似分析显示，所测cytb与fam43a基因序列均与GenBank数据库中的中华鲟相似性最高，相似性分别为99.86%和100%。系统进化分析显示，中华鲟样本所测得序列均与GenBank数据库中的中华鲟DNA序列聚类在一起，且与鲟形目其他物种位于不同分支。结论 联合使用线粒体DNA和核DNA遗...