副鸡禽杆菌的指纹图谱分型 |
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引用本文: | 王雪敏,吕学泽,梁玉荣,贺云霞,张培君,龚玉梅,王宏俊. 副鸡禽杆菌的指纹图谱分型[J]. 中国兽医科学, 2011, 0(11) |
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作者姓名: | 王雪敏 吕学泽 梁玉荣 贺云霞 张培君 龚玉梅 王宏俊 |
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作者单位: | 河北工程大学农学院;北京市农林科学院畜牧兽医研究所; |
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基金项目: | 国家“十二五”高技术研究发展计划(863)项目(2011AA10A210); 北京市自然科学基金资助项目(6102009); 北京市优秀人才培养资助项目(2010D002020000009) |
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摘 要: | 为了探索副鸡禽杆菌的新型分型方法,以肠杆菌基因间共有重复序列(ERIC)和随机核苷酸多态性片段(RAPD)为靶序列进行PCR扩增,对所得指纹图谱用POPGENE和MEGA4.0软件进行遗传距离的计算和聚类分析。结果显示,2种方法均能得到丰富﹑稳定的指纹图谱,其多态性为85.7%(18/21);10个国际标准株、血清C型疫苗株以及4个国内分离株可分为11个谱型,聚为4类。划分的11个谱型可以和现有分型方法中的不同亚型一一对应,提示这种方法可以区分不同血清亚型。表明指纹图谱技术可以有效地区分不同菌株,从而为分子流行病学调查和疫苗研制提供了参考。
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关 键 词: | 副鸡禽杆菌 ERIC-PCR RAPD-PCR 聚类分析 |
Fingerprint subtyping of Avibacterium paragallinarum |
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Abstract: | In order to explore a subtyping method for Avibacterium paragallinarum,the enterobacte-rial repetitive intergenic consensus(ERICs) and random amplified polymorphic DNAs(RAPDs) were used as the target sequences of PCR to generate a fingerprint of A.paragallinarum. The genetic distance calculation and cluster analysis of the fingerprints were performed by the POPGENE and MEGA4.0 software.The results showed that both methods can get rich,stable fingerprint,with a polymorphism of 85.7%(18/21). Ten international... |
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Keywords: | Avibacterium paragallinarum ERIC-PCR RAPD-PCR cluster analysis |
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