| 口蹄疫病毒基因组IRES和Poly(C)之间功能未知区一级和二级结构分析 |
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| 引用本文： | 张显升,赵启祖,刘在新,常惠芸,江鹏斐,陈应理,李冬,魏怀录,戈银生,谢庆阁.口蹄疫病毒基因组IRES和Poly(C)之间功能未知区一级和二级结构分析[J].中国兽医科学,2001,31(11):5-9. |
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| 作者姓名： | 张显升 赵启祖 刘在新 常惠芸 江鹏斐 陈应理 李冬 魏怀录 戈银生 谢庆阁 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院兰州兽医研究所,甘肃,兰州,730046 |
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| 基金项目： | 国家"973"项目:畜禽重大疫病病原大分子结构与功能研究(G1999011901)部分内容 |
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| 摘 要： | 用RT-PCR法,以口蹄疫病毒(FMDV)WH/99株牛舌水泡皮为材料,提取RNA及扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy载体连接并转化JM109菌株,再经重组质粒电泳、PCR和EcoRⅠ酶切鉴定;用DNAstar软件比较功能未知区的序列差异,以RNAdraw软件分析它们的二级结构.结果表明,7株FMDV的功能未知区序列长度介于207-256个核苷酸;序列分析表明,WH/99与AsiaⅠ 63/72、A24/Cruzeiro、TWTY/97和TWCP/97的序列差异最大,预示此区段可能与病毒感染嗜性有关;二级结构分析表明,A24/Cruzeiro、Asia Ⅰ 63/72和TWCP/97均有5个结构域,WH/99和TWTY/97具有6个结构域.TWTY/97和TWCP/97二级结构的差异可能是TWTY/97功能未知区第20位插入的"C"所致,而O1K/66和O1Campos仅有3个结构域.2株猪O型FMDV功能未知区5′端存在着连续的核苷酸缺失现象,最多达52个,唯有3株牛O型FMDV(O1K/66、O1Campos和WH/99)在上述位置无任何缺失.
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| 关 键 词： | 口蹄疫病毒株 参考毒株 序列分析 |
| 文章编号： | 1000-6419(2001)11-0005-05 |
| 修稿时间： | 2001年7月20日 |
The basic and secondary structure of the sequence between poly(C) and IRES regions in foot-and-mouth disease virus genome |
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| ZHANG Xian-sheng,ZHAO Qi-zu,LIU Zai-xin,CHANG Hui-yun,JIAN G Peng-fei,CHENG Ying-li,LI Dong,WEI Huai-lu,GE Yin-sheng,XIE Qing-ge.The basic and secondary structure of the sequence between poly(C) and IRES regions in foot-and-mouth disease virus genome[J].Veterinary Science in China,2001,31(11):5-9. |
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| Authors: | ZHANG Xian-sheng ZHAO Qi-zu LIU Zai-xin CHANG Hui-yun JIAN G Peng-fei CHENG Ying-li LI Dong WEI Huai-lu GE Yin-sheng XIE Qing-ge |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | FMDV strain Reference strains Sequence analysis |
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