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利用分子特异的条形码评估二代测序中STR的复制滑脱
引用本文:彭海,方慧,李论,方治伟,胡晓星,徐珍,高利芬,李甜甜,周俊飞,陈利红.利用分子特异的条形码评估二代测序中STR的复制滑脱[J].中国法医学杂志,2022(3):273-277+282.
作者姓名:彭海  方慧  李论  方治伟  胡晓星  徐珍  高利芬  李甜甜  周俊飞  陈利红
作者单位:1. 江汉大学生命科学院;2. 武汉市公安局刑事侦查局;3. 公安部物证鉴定中心
基金项目:国家自然科学基金面上项目(82072123);
摘    要:目的 利用分子特异的条形码(Unique Molecular Identifiers,UMIs)研究二代测序平台中STR的复制滑脱现象。方法 采用探针捕获与高通量测序技术对12个中国汉族无关个体进行STR靶标基因座的富集与测序,并利用自己开发的软件进行STR分型及复制滑脱的评估。结果 对12个中国汉族无关个体的高通量测序数据的STR分型及复制滑脱情况的分析发现:单个UMI家族随着成员数目的增多,其STR的复制滑脱产物占所有成员的百分比(Stutter Percentage,SP)逐渐降低,当家族成员数目增至40个时,其SP趋于稳定;STR基因座的各等位基因易向比它自身少一个重复单位的等位基因滑脱,形成stutters。结论 UMI可准确识别STR基因座在PCR扩增过程中DNA链滑脱所产生的stutters并将其去除,达到了降低二代测序平台中STR复制滑脱产物的效果,为法医鉴定中混合检材的精细鉴别提供了技术支撑。

关 键 词:法医物证学  STR  stutters  分子特异的条形码
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