广西猪圆环病毒2型全基因组进化分析

为了调查近几年广西猪圆环病毒2型(PCV2)流行毒株的遗传变异趋势,为猪圆环病毒病(PCVD)的有效控制提供理论指导,对广西不同地区送检的病死保育猪肺及淋巴结样品进行PCV2检测和全基因扩增。应用Laser Gene 7.1和M EGA 4.1软件对PCV2全基因序列进行核苷酸同源性和遗传进化分析,并对开放阅读框(ORF2)氨基酸位点变异进行分析。结果显示,从阳性病料中成功扩增出12条PCV2全基因序列,其中6条PCV2序列属于PCV2d基因型,另外6条属于PCV2b基因型。不同基因型ORF2氨基酸序列分析显示,PCV2a、PCV2b、PCV2c和PCV2d各个基因型的ORF2氨基酸序列上的位点具有其独特性。本研究发现,近年来广西地区猪群PCV2d基因型的感染病例增多,有可能会替代PCV2b或者与PCV2b共同成为广西地区的主导基因型。