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机器学习技术结合Y染色体CpG位点推断男性年龄
引用本文:邢杨峰,冀志敏,李俊丽,杨丰隆,何裕栋,孙林峰,刘龙,严江伟.机器学习技术结合Y染色体CpG位点推断男性年龄[J].中国法医学杂志,2023(4):381-384+389.
作者姓名:邢杨峰  冀志敏  李俊丽  杨丰隆  何裕栋  孙林峰  刘龙  严江伟
作者单位:1. 山西医科大学
基金项目:国家重点研发计划课题(2021YFC3300102);;国家自然基金重点项目(82030058);
摘    要:目的 年龄推断作为个体特征描绘关键环节之一,在法医实践中的地位愈发重要,然而从混合斑中推断出个体年龄是一个尚未解决的难题。本研究通过筛选Y染色体上CpG位点并结合机器学习算法构建男性个体年龄推断模型。方法 从GEO数据库筛选男性血液甲基化数据,按照年龄变化趋势对Y染色体上的位点进行差异性分析。对Y染色体上的差异性CpG位点进行线性回归拟合并计算Spearman相关系数,基于年龄相关CpG位点构建支持向量机、梯度提升机、随机森林、多元线性回归、K最邻近等5种机器学习模型用于年龄推断模拟和验证。结果差异性分析得到26个CpG位点,通过线性拟合得到8个年龄相关CpG位点。五种机器学习训练模型推断年龄的平均绝对偏差(Mean Absolute Deviation,MAD)范围从5.19岁~7.68岁。在验证阶段的数据集中,支持向量机的年龄推断模型表现最佳,MAD为5.43岁。结论 本研究基于机器学习算法验证了Y染色体上的CpG位点对男性个体年龄推断的可行性,为法医实践提供有效依据。

关 键 词:法医物证学  年龄推断  机器学习  男性血液  CpG位点
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