猪T细胞受体β链CDR3的多样性及其分子结构的遗传特征 |
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引用本文: | 姚文娟,房永祥,贾怀杰,何小兵,曾 爽,陈国华,刘泰安,景志忠.猪T细胞受体β链CDR3的多样性及其分子结构的遗传特征[J].中国兽医科学,2014(6):641-649. |
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作者姓名: | 姚文娟 房永祥 贾怀杰 何小兵 曾 爽 陈国华 刘泰安 景志忠 |
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作者单位: | 中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部兽医公共卫生重点实验室; |
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基金项目: | 国家自然科学基金面上项目(31372423);国家自然科学基金青年项目(31302072);甘肃省技术研究与开发专项(1207TCYA025) |
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摘 要: | 通过带谱分型技术研究临床健康猪T细胞受体(TCR)β链CDR3的谱型种类及多样性,并对其序列进行生物信息学分析,以探究CDR3分子结构的遗传特征。结果显示,20个TRBV家族在3头猪中均有表达,且大部分TRBV家族CDR3的谱型呈现类高斯分布,具有丰富的多样性;同一个体中不同TRBV家族CDR3出现的频次相差较大,同一TRBV家族在不同个体中出现的频次也不相同;100多条猪TCRβ链基因序列的CDR3分析发现,其大小在33~66nt之间,出现频次最多的序列为第42位碱基;在CDR3核苷酸序列组成中,鸟嘌呤的含量较高,推测其编码甘氨酸的频次较高;TCRβ链CDR3的两侧由相对保守的氨基酸组成,中间部分氨基酸变化较大,其中在第5位和第8位的氨基酸组成差异最大,确认CDR3的多样性和复杂性主要由D区两端的N插入序列及拼接时的灵活性造成。本研究结果为T细胞TCR分子的功能复杂性与特异性研究提供了一定的理论依据。
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关 键 词: | T细胞受体 TRBV家族 带谱分型技术 CDR 分子结构 |
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